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1、劉春艷北京大學(xué)醫(yī)學(xué)圖書(shū)館信息咨詢部liucy@lib.bjmu.edu.cnPubMed生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索方法與技巧主要內(nèi)容PubMed概況PubMed數(shù)據(jù)來(lái)源PubMed檢索機(jī)制PubMed檢索運(yùn)算符PubMed檢索方法結(jié)果的顯示、打印、保存其他輔助功能1.PubMed概況創(chuàng)建機(jī)構(gòu):美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書(shū)館下設(shè)的美國(guó)生物技術(shù)信息中心(NCBI)1997年6月開(kāi)始向全球開(kāi)放特色:具有收錄范圍廣(免費(fèi))、內(nèi)容全、檢索途徑多、檢索體系完備等特點(diǎn),部分文獻(xiàn)還可在網(wǎng)上直接免費(fèi)獲得全文。2.PubMed數(shù)據(jù)來(lái)源MEDLINE:[pubmed
2、-indexedformedline]InProcessCitations:每天收錄,尚未經(jīng)規(guī)范處理的數(shù)據(jù)。[pubmed-inprocess]Publisher-SuppliedCitations:由出版商提供的電子文獻(xiàn),每條記錄標(biāo)有[PubMed-assuppliedbyPublisher]。3.PubMed檢索機(jī)制自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配功能(AutomaticTermMapping)Leukemia"leukaemia"[AllFields]OR"leukemia"[MeSHTerms]OR"leukemia"[AllField
3、s]對(duì)于輸入的檢索詞,PubMed先按一定的詞表順序進(jìn)行對(duì)照匹配和轉(zhuǎn)換,再進(jìn)行檢索。詞表匹配轉(zhuǎn)換順序是:MeSH表期刊刊名表短語(yǔ)表作者索引如果在以上4個(gè)表中都找不到相匹配的詞,PubMed將把短語(yǔ)分開(kāi),以單詞為單位,分別重復(fù)以上的過(guò)程,檢索時(shí)各個(gè)詞之間是AND邏輯關(guān)系。如果仍找不到相匹配的詞,則用單個(gè)詞在所有字段查找,各個(gè)詞之間也是AND邏輯關(guān)系。3.1自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配功能人重組三葉因子(humanrecombinanttrefoilfactor)("humans"[MeSHTerms]OR"humans"[AllFields]
4、OR"human"[AllFields])ANDrecombinant[AllFields]AND("trefoilfactor"[SupplementaryConcept]OR"trefoilfactor"[AllFields])4.PubMed檢索運(yùn)算符邏輯運(yùn)算符邏輯運(yùn)算符①邏輯“與”運(yùn)算AND:檢索式寫(xiě)成AandB,表示文獻(xiàn)中同時(shí)包含檢索詞A和檢索詞B的文獻(xiàn)才是命中文獻(xiàn)。AIDSandtherapy②邏輯“或”運(yùn)算OR:檢索式寫(xiě)成AorB,表示包含檢索詞A的文獻(xiàn)或者包含檢索詞B的文獻(xiàn)或者同時(shí)包含檢索詞A和B的文獻(xiàn)為命中
5、文獻(xiàn)。AIDSorAcquiredImmunodeficiencySyndrome③邏輯“非”運(yùn)算NOT:檢索式寫(xiě)成AnotB,表示包含檢索詞A同時(shí)不包含檢索詞B的文獻(xiàn)為命中文獻(xiàn)。HepatitisnotAnimalIP地址:http://pubmed.govPubMed網(wǎng)址基本檢索高級(jí)檢索主題檢索臨床咨詢臨床實(shí)驗(yàn)5.PubMed檢索方法5.1基本檢索5.2高級(jí)檢索5.3主題檢索5.4臨床咨詢5.1基本檢索默認(rèn)檢索字段為主題、作者、期刊關(guān)鍵詞、詞(詞組)或短語(yǔ):⑴輸入任意關(guān)鍵詞:livercancer、Lungcancer;
6、⑵帶有雙引號(hào)””作為短語(yǔ)檢索:”cancertherapy”;⑶帶有連接號(hào)”-”作為一個(gè)詞組檢索(英文可以,中文不行):interleukin-6。限制檢索字段:如livercancer[ti]作者:SmithJ、僅知道作者姓,則必須加上字段標(biāo)識(shí),如:Smith[au]2002年以后的文獻(xiàn)若文中有作者全稱可用全稱檢索如:JoshuaLederberg5.1基本檢索期刊刊名:⑴可用期刊全稱:GENETHERAPY[TA];⑵可用期刊簡(jiǎn)稱:JAMA[TA];(TheJournaloftheAmericanMedicalAssoc
7、iation)復(fù)雜表達(dá)式:livercancerANDtherapy帶有摘要文獻(xiàn)的檢索:livercancerANDhasabstract5.1基本檢索分析該檢索課題,包含兩個(gè)方面:肝癌:livercancer;酒精:alcohol兩個(gè)主題之間的邏輯關(guān)系是AND,即livercancerANDalcohol基本檢索舉例:肝癌和酒精的關(guān)系基本檢索舉例:肝癌和酒精的關(guān)系輸入:livercancerANDalcohol“肝癌和酒精的關(guān)系”的基本檢索結(jié)果5.2高級(jí)檢索高級(jí)檢索5.2高級(jí)檢索5.2高級(jí)檢索分析該檢索課題,包含兩個(gè)方面:
8、作者為:馬大龍(madl);作者單位為:北京大學(xué)(pekinguniversity)。高級(jí)檢索舉例:北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)高級(jí)檢索舉例:北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)輸入:madl輸入:pekinguniversity高級(jí)檢索舉例:北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)5.3主