臨床檢驗診斷學(xué)雙語領(lǐng)域本體構(gòu)建方法研究承

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1、20lO年6月情報探索第6期(總152期)臨床檢驗診斷學(xué)雙語領(lǐng)域本體構(gòu)建方法研究承杜志銀1劉芳。胡虹趙文龍(1重慶醫(yī)科大學(xué)信息管理系重慶400016)(2重慶市江北區(qū)第一人民醫(yī)院檢驗科重慶400020)摘要：在對現(xiàn)有領(lǐng)域本體構(gòu)建方法進(jìn)行綜合分析的基礎(chǔ)上，提出了臨床檢驗診斷學(xué)領(lǐng)域本體6雛模型，并采用斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院開發(fā)的本體編輯軟件ProtSg64．0，開發(fā)了臨床檢驗診斷領(lǐng)域雙語本體。關(guān)鍵詞：領(lǐng)域本體雙語本體臨床檢驗診斷學(xué)本體構(gòu)建中圖分類號：TP391．5文獻(xiàn)標(biāo)識碼：A文章編號：1005—8095(2010)06-oOl8-031引言構(gòu)建領(lǐng)域本體的目的主要在于實現(xiàn)某種程度的本體

2、的概念起源于哲學(xué)．是對客觀世界本質(zhì)的知識共享和復(fù)用。國內(nèi)外在本體構(gòu)建方法上，研究最描述，其最終目標(biāo)是精確地表示那些隱含信息。2o多的主要是以下兩種方式：一種是本體工程，即探討世紀(jì)以來，本體概念被引入到計算機(jī)領(lǐng)域，用以解決本體的構(gòu)建方法：另一種是基于詞表的本體構(gòu)建。知識表示和知識組織方面的問題。2．1本體工程本體構(gòu)建的方法主要有手工構(gòu)建、復(fù)用現(xiàn)有本本體工程的主要特點(diǎn)就是強(qiáng)調(diào)構(gòu)建本體時要按體、利用程序自動構(gòu)建以及半自動構(gòu)建4種[1]。手工照一定的規(guī)范和標(biāo)準(zhǔn)。相對于一般的系統(tǒng)，本體更強(qiáng)構(gòu)建本體費(fèi)時費(fèi)力。工程巨大。復(fù)用現(xiàn)有本體主要是調(diào)共享、重用，可以為不同系統(tǒng)提供一種統(tǒng)一的語利用已有

3、的主題詞表、頂級本體、在線本體等資源庫言．因此本體構(gòu)建的工程性更為明顯。常見本體工程獲取領(lǐng)域知識以及概念之間的等級關(guān)系。自動構(gòu)建構(gòu)建方法有骨架法、TOVE法(評估法)、Bemaras法、本體是借助知識獲取方法，如機(jī)器學(xué)習(xí)、數(shù)據(jù)挖掘等SENSUS法、KACTUS工程法、IDEF5法、ME哪ON—技術(shù)，通過自然語言規(guī)則以及統(tǒng)計分析來確定概念TOLOGY法、七步法等嘲。以及概念之間的關(guān)系并自動構(gòu)建。半自動構(gòu)建就是但是目前本體工程中尚沒有標(biāo)準(zhǔn)的權(quán)威的方法首先借助自然語言處理和數(shù)據(jù)挖掘等技術(shù)，從語料論。構(gòu)建方法不成熟，本體的復(fù)用性得不到充分保庫中自動抽取領(lǐng)域的相關(guān)概念和概念之間的關(guān)系，

4、障。因為這些現(xiàn)有的方法都是基于所開發(fā)的項目并最后通過人工校驗來修正結(jié)果。自動或半自動構(gòu)建結(jié)合自身的經(jīng)驗總結(jié)提取出來的，都具有特殊的針本體的方法目前還處于研究階段。對性和適用性。目前國內(nèi)已有的生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域本體生物醫(yī)學(xué)是一個發(fā)展非常迅猛的學(xué)科，同時也絕大多數(shù)都是按照或者借鑒七步法的思想而建立是概念間關(guān)系相對比較容易確定的學(xué)科。美國國立的。醫(yī)學(xué)圖書館早在1963年就出版了(MESH)，(MESH)2．2基于詞表的本體構(gòu)建通過參見系統(tǒng)和樹狀結(jié)構(gòu)表明確了概念之間的上下由于現(xiàn)有主題詞表、分類法具有清晰的語義結(jié)位關(guān)系，同時提供了參見關(guān)系，正因為如此，生物醫(yī)構(gòu)，便于從中抽取概念關(guān)系，特別是醫(yī)

5、學(xué)領(lǐng)域，詞表學(xué)領(lǐng)域一直是本體研究的熱點(diǎn)．國外已經(jīng)取得了相豐富，因此。有很多研究者都嘗試將現(xiàn)有的詞表轉(zhuǎn)換當(dāng)?shù)某晒Ｔ诩膊”倔w方面，澳大利亞人Hadzie等為本體。利用詞表構(gòu)建本體的方法可以分為兩類：一提出了一個人體4維通用疾病本體模型；隨后中國類是對現(xiàn)有詞表完整地采用XML／RDFS語法進(jìn)行形學(xué)者方安等提出了改進(jìn)型的人體6維通用疾病本體式化描述；另一類是對現(xiàn)有詞表進(jìn)行調(diào)整，調(diào)整詞問模型[2]。這些都是以疾病為軸心的本體模型。本文在關(guān)系，對詞進(jìn)行增減，然后生成新的本體。分析這些通用疾病本體模型的基礎(chǔ)上，提出構(gòu)建以實際上．?dāng)⒃~表和本體都是對現(xiàn)有概念的等級臨床檢驗診斷應(yīng)用為軸心和目的

6、，以手工構(gòu)建和復(fù)關(guān)系、語義關(guān)系進(jìn)行描述，因此，二者按照一定的規(guī)用現(xiàn)有領(lǐng)域資源為基礎(chǔ)的臨床檢驗診斷學(xué)領(lǐng)域雙語則進(jìn)行轉(zhuǎn)換具有可行性。但是一些學(xué)科發(fā)展非?？?。本體的方法。詞語和概念的更新頻率較快，而詞表本身的變換需2構(gòu)建領(lǐng)域本體的方法要一定的周期，因此，在進(jìn)行詞表轉(zhuǎn)換為本體的時收稿日期：2OLO-O3-24々本文系重慶醫(yī)科大學(xué)校級課題“臨床檢驗診斷學(xué)領(lǐng)域本體構(gòu)建及其應(yīng)用研究”(項目編號：XBYB2007119)成果之一。作者簡介：杜志銀(1975一)，男，館員，碩士。182010年6月杜志銀等：臨床檢驗診斷學(xué)雙語領(lǐng)域本體構(gòu)建方法研究第6期(總152期)候，需要考慮學(xué)科特點(diǎn)，根據(jù)不同

7、學(xué)科的特點(diǎn)采用不同的構(gòu)建方法。3臨床檢驗診斷學(xué)領(lǐng)域本體構(gòu)建方法本課題的目的是為了實現(xiàn)語義組織、語義檢索．為臨床檢驗醫(yī)師和臨床醫(yī)師的臨床診斷決策服務(wù)。臨床檢驗診斷學(xué)屬于醫(yī)學(xué)的分支。其詞間的語義關(guān)系可以參照美國《醫(yī)學(xué)主題詞表(MESH))、ICD一11、SNOMED等，但是臨床檢驗診斷學(xué)領(lǐng)域發(fā)展非?？?，有很多新技術(shù)、新方法不斷應(yīng)用于臨床實踐中。為了增強(qiáng)本項目所開發(fā)的臨床檢驗診斷學(xué)領(lǐng)域本體的實用性，課題組確定采用在參照{(diào)MESH)的情況下，使用本體工程法的思想來構(gòu)建。3．1本體構(gòu)建工具的選擇本體構(gòu)建的工具有P