基于磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)蘋(píng)果砧木干旱脅迫響應(yīng)的分子機(jī)理研究

基于磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)蘋(píng)果砧木干旱脅迫響應(yīng)的分子機(jī)理研究

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1、分類(lèi)號(hào)密級(jí)UDC單位代碼10733甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文基于磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)蘋(píng)果砧木干旱脅迫響應(yīng)的分子機(jī)理研究MolecularmechanismsofdroughtstressresponseinMalusrootstocksbasedonquantitativephosphoproteomicstechnology任靜指導(dǎo)教師姓名陳佰鴻教授(甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)蘭州730070)學(xué)科專(zhuān)業(yè)名稱(chēng)果樹(shù)學(xué)研究方向果樹(shù)栽培與生理生態(tài)論文答辯日期2017年5月25日學(xué)位授予日期2017年6月答辯委員會(huì)主席謝忠奎研

2、究員評(píng)閱人楊洪強(qiáng)教授彭建營(yíng)教授楊國(guó)順教授2017年6月13日甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)2017屆博士畢業(yè)論文摘要植物對(duì)干旱脅迫的響應(yīng)是一個(gè)非常復(fù)雜的現(xiàn)象,不同物種具有的個(gè)體特性也不相同。人們對(duì)草本植物的抗旱機(jī)理已進(jìn)行了較多研究,而多年生木本植物在抗旱過(guò)程中的生理與分子機(jī)理仍不清楚。蘋(píng)果是世界重要的園藝作物之一。為了研究干旱脅迫條件下蘋(píng)果砧木的生理生化特性以及初步探索依賴(lài)磷酸化信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的調(diào)控機(jī)制,鑒定到抗旱響應(yīng)磷酸化蛋白,本文以蘋(píng)果M26與山定子兩個(gè)基因型砧木為試材,通過(guò)各項(xiàng)生理生化指標(biāo)的測(cè)定以及采用nanoLC-

3、ESI-MS/MS串聯(lián)質(zhì)譜與TiO2富集相結(jié)合的方法進(jìn)行的磷酸化蛋白質(zhì)組鑒定,對(duì)蘋(píng)果砧木響應(yīng)機(jī)理進(jìn)行闡述。主要結(jié)果如下:1.隨著干旱程度的加重,蘋(píng)果兩個(gè)基因型砧木通過(guò)不斷增加可溶性糖(SS)、可溶性蛋白(SP)與游離脯氨酸(FP)等滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)的含量來(lái)響應(yīng)持續(xù)干旱脅迫。,同時(shí),在持續(xù)干旱脅迫過(guò)程中,山定子葉片內(nèi)滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)的積累量是高于M26的,表明山定子的抗旱性?xún)?yōu)于M26。2.隨著干旱脅迫的持續(xù),葉片內(nèi)丙二醛(MDA)含量升高。蘋(píng)果砧木的抗氧化酶系統(tǒng)與AsA-GSH循環(huán)系統(tǒng)可在一定程度上消除體內(nèi)活

4、性氧帶給細(xì)胞膜的氧化損傷,超氧化物歧化酶(SOD)、過(guò)氧化物酶(POD)、抗壞血酸過(guò)氧化物酶(APX)、谷胱甘肽還原酶(GR)、抗壞血酸(AsA)與還原型谷胱甘肽(GSH)等指標(biāo)的值于脅迫前期持續(xù)升高,而于后期時(shí)不斷下降,峰值出現(xiàn)在第6d,即中度干旱脅迫,且山定子消除活性氧的能力高于M26。3.參與碳代謝過(guò)程的淀粉酶(AMY)與轉(zhuǎn)化酶(INV)活性,在干旱脅迫發(fā)生的前期迅速增至峰值(中度干旱脅迫)隨后緩慢降低,而氮代謝過(guò)程的兩種相關(guān)酶活硝酸還原酶(NR)與谷氨酰胺合成酶(GS)則持續(xù)下降,且山定子四

5、種酶活均高于M26。4.采用中度干旱脅迫時(shí)蘋(píng)果兩個(gè)基因型砧木的葉片組織進(jìn)行磷酸化蛋白質(zhì)組的鑒定研究,兩個(gè)基因型共識(shí)別到595條唯一的磷酸化肽,682個(gè)磷酸化位點(diǎn)(593個(gè)pS,80個(gè)pT與9pY)與446個(gè)磷酸化蛋白。通過(guò)Motif-X程序,獲得6個(gè)顯著富集的磷酸化基序,被公認(rèn)為是促分裂原活化蛋白激酶(MAPK),細(xì)胞周期蛋白依賴(lài)性激酶(CDK),類(lèi)細(xì)胞周期蛋白依賴(lài)性激酶(CDK-like),酪氨酸激酶II(CK-II),鈣調(diào)素激酶II(CaMK-II),蛋白激酶A(PKA)和蛋白激酶C(PKC)識(shí)

6、別的基本基序。I甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)2017屆博士畢業(yè)論文5.根據(jù)兩個(gè)基因型磷酸化蛋白的差異性分析,在M26中識(shí)別到12個(gè)PLSC磷酸化蛋白在磷酸化水平上發(fā)生顯著變化(PLSC),山定子中共識(shí)別到46個(gè)PLSC磷酸化蛋白,其中兩個(gè)基因型相同的PLSC磷酸化蛋白有9個(gè)。對(duì)PLSC磷酸化蛋白進(jìn)行GO分析,鑒定到與干旱脅迫響應(yīng)相關(guān)的磷酸化蛋白,主要參與代謝、轉(zhuǎn)錄、翻譯、蛋白質(zhì)加工等過(guò)程的調(diào)控。對(duì)mRNA水平上的驗(yàn)證,TFIIE1、IF3B、Hsp70、Hsp70-90、TUBA3與RPL5等6個(gè)基因在mRNA水平

7、表達(dá)差異顯著,且與其相應(yīng)的磷酸化蛋白豐度一致。6.對(duì)兩個(gè)基因型間磷酸化蛋白的差異性分析,在M26鑒定到的5個(gè)差異磷酸化蛋白,微管結(jié)合蛋白70-1-lik(microtubule-associatedprotein70-1-like)和3個(gè)未知磷酸化蛋白發(fā)生磷酸化的肽和位點(diǎn)與山定子完全相同,而?;o酶A結(jié)合域蛋白(acyl-CoA-bindingdomain-containingprotein4)在兩個(gè)基因型中發(fā)生磷酸化的肽與位點(diǎn)均不相同,表明在中度干旱脅迫條件下M26的抗旱機(jī)制與山定子相同,主要涉及

8、脂類(lèi)代謝與細(xì)胞骨架變化;山定子中鑒定到的其余30個(gè)差異磷酸化蛋白大多數(shù)參與了碳氮代謝過(guò)程。7.根據(jù)蘋(píng)果兩基因型砧木的生理與磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)分析,干旱脅迫下,磷酸化蛋白主要通過(guò)調(diào)節(jié)脂類(lèi)代謝與碳氮代謝過(guò)程,進(jìn)而清除活性氧與合成滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)以抵御干旱脅迫對(duì)植株造成的損傷。關(guān)鍵詞:蘋(píng)果,山定子,M26,干旱脅迫,磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué),iTRAQ,脅迫響應(yīng)II甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)2017屆博士畢業(yè)論文SummaryTheresponseofplantstodroughtstressisav

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