甘薯種質(zhì)資源的srap鑒定及遺傳多樣性分析

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1、核農(nóng)學(xué)報2013,27(5):0568~0575568JournalofNuclearAgriculturalSciences文章編號:1000-8551(2013)05-0568-08甘薯種質(zhì)資源的SRAP鑒定及遺傳多樣性分析1,231,21,21,21,2張凱羅小敏蔣玉春吳正丹王季春唐道彬12(西南大學(xué)農(nóng)學(xué)與生物科技學(xué)院,重慶400716;重慶市甘薯工程3技術(shù)研究中心,重慶400716;重慶市農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣總站,重慶401121)摘要:為了拓寬甘薯育成品種的遺傳背景,篩選優(yōu)良親本,提高育種效率,本研究利用SRAP標記對48份主要甘薯種質(zhì)資源進行了遺傳多樣性分析。結(jié)果表明,

2、隨機選用的37對SRAP引物中29對引物具有多態(tài)性,引物多態(tài)性比率為78.4%,共獲得126條多態(tài)性譜帶,平均每對引物產(chǎn)生4.3條多態(tài)性譜帶,表現(xiàn)出較高的多態(tài)性。48份種質(zhì)材料的SRAP遺傳距離為0.037~0.601,當遺傳距離L1=0.46時,48份材料被聚為6個類群,包括1個復(fù)合大類群和5個獨立類群,其中第Ⅰ復(fù)合大類群又包括7個亞類群,聚類結(jié)果與系譜吻合性較好。采用5個重要農(nóng)藝性狀對供試材料進行了聚類分析,L1=3.20時,48份材料也可被聚為6個類群,聚類結(jié)果與依據(jù)SRAP標記聚類分析的結(jié)果差異較大。甘薯種質(zhì)資源間的遺傳差異與地理來源無必然聯(lián)系。關(guān)鍵詞:甘薯;遺傳多

3、樣性;聚類分析;SRAP;農(nóng)藝性狀[23-26]甘薯(IpomoeabatatasL.)是世界上重要的糧食、析等研究,具有經(jīng)濟、簡便、穩(wěn)定性好、重復(fù)性高、[1][4,20]飼料、工業(yè)原料及新型能源用塊根作物。近年來中便于克隆測序目標片段的特點。將農(nóng)藝性狀為主國甘薯品種改良取得了顯著進展,育成了大量品種,打的表型分析和分子水平的檢測相結(jié)合,已經(jīng)成為目前[2][27]破了以國外引進甘薯品種為主的格局,但是目前的檢測遺傳多樣性的有效手段,但在甘薯中應(yīng)用較[2-4][17]推廣品種中存在遺傳基礎(chǔ)狹窄的問題,不利于甘少。本研究采用分子標記和農(nóng)藝性狀相結(jié)合的方薯品種的遺傳改良。為了拓寬

4、甘薯育種的遺傳背景,法,利用SRAP標記和5個甘薯重要農(nóng)藝性狀對國內(nèi)篩選優(yōu)良親本,提高育種效率,近年來不少學(xué)者利用同48份主要甘薯種質(zhì)資源進行遺傳多樣性分析,旨在從[5][6-17][14,18-19][3]工酶、分子標記、農(nóng)藝性狀、主成分分子水平探討分析甘薯種質(zhì)資源之間的親緣關(guān)系和遺等對甘薯種質(zhì)資源的遺傳多樣性進行了研究。甘薯遺傳差異,為甘薯遺傳改良及親本組配提供重要依據(jù)。傳背景復(fù)雜,農(nóng)藝性狀的觀察和分析難以真實反映其同時對利用兩種方法進行遺傳多樣性分析進行了比親緣關(guān)系,DNA分子標記穩(wěn)定性好,不受環(huán)境影響,已較,尋找較為準確的甘薯親本聚類方法。經(jīng)成為植物種質(zhì)資源研究的重

5、要手段。在分子標記方面,國內(nèi)外應(yīng)用較多的分子標記方法有RAPD、AFLP、1材料與方法[6-17]ISSR等,而應(yīng)用SRAP標記研究甘薯遺傳多樣性[4][20]的報道較少。SRAP標記通過獨特的引物設(shè)計對1.1試驗材料ORFs(Openreadingframes)進行擴增,目前在馬鈴薯、供試甘薯品種(系)由西南大學(xué)薯類作物研究所水稻、柑橘、蘋果、萵苣、大蒜、玉米、丹參等多種植物中和中國南方甘薯研究中心提供,共計48份(表1)。[21][22]應(yīng)用于圖譜構(gòu)建、比較基因組學(xué)、遺傳多樣性分1.2材料種植收稿日期:2012-05-10接受日期:2013-01-21基金項目:國家自然

6、科學(xué)基金(31101192),中央高?;究蒲袠I(yè)務(wù)費專項(XDJK2011C004),重慶市科技攻關(guān)項目(cstc2010AB1053),西南大學(xué)博士基金(SWU110031)作者簡介:張凱(1981-),女,山東濰坊人,博士,講師,研究方向為薯類分子育種。Tel:023-68250469;E-mail:zhangkai2010s@163.com通訊作者:王季春(1964-),男,四川南充人,教授,碩士生導(dǎo)師,研究方向為薯類作物耕作與栽培。Tel:023-68250469;E-mail:wangjichun_mail@163.com唐道彬(1974-),男,重慶榮昌人,實驗

7、師,研究方向為薯類作物耕作栽培與育種。E-mail:tdbin741023@163.com5期甘薯種質(zhì)資源的SRAP鑒定及遺傳多樣性分析569田間試驗于2009-2010年在西南大學(xué)薯類作物研究所歇馬試驗基地進行。試驗采用隨機區(qū)組設(shè)計,2結(jié)果與分析重復(fù)3次,2壟區(qū),壟距0.76m,株距0.22m,每壟22-22株,4000株·667m試驗中施肥以每667m純氮(尿2.1SRAP分子標記的系統(tǒng)聚類分析素,含N46%):有效磷(過磷酸鈣,含P2O516%):有效選用37對SRAP引物,對48份種質(zhì)材料的基因鉀(硫酸鉀,

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