真核生物和原核生物比較

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1、第四節(jié)真核生物轉(zhuǎn)錄后的加工(Pre-RNAprocessinginEukaryotes)多數(shù)轉(zhuǎn)錄的初始產(chǎn)物無生物活性,在生物體內(nèi)進(jìn)行加工處理后才具有生物活性。轉(zhuǎn)錄后加工(post-transcriptionalprocessing):是指將各種前體RNA(Pre-RNA)分子加工轉(zhuǎn)變成有功能的、成熟的各種RNA(mRNA,rRNA或tRNA等)的過程。Pre-RNAMatureRNA加帽(Capping)加尾(Tailing)剪接(Splicing)堿基修飾(Basesmodification)編輯(Editing)轉(zhuǎn)錄后加工的主要方式

2、:RNA加工修飾主要對象:hnRNA:mRNA前體pre-rRNA:rRNA前體pre-tRNA:tRNA前體一、tRNA前體的加工(一)真核生物tRNA基因結(jié)構(gòu)真核tRNA的基因成簇排列,基因間有間隔區(qū),是一種重復(fù)序列;前體分子tRNA是單順反子;前體分子tRNA中含有內(nèi)含子;前體分子tRNA中沒有3′-CCA序列。(二)tRNA前體的加工剪接內(nèi)含子;柄部結(jié)構(gòu)的加工:加上CCA-OH的3′末端,完成柄部結(jié)構(gòu);堿基修飾。(三)tRNA前體的加工過程1、內(nèi)含子剪接①位置相同,都在反密碼子環(huán)的下游;②不同tRNA的內(nèi)含子長度和序列各異;③外

3、顯子和內(nèi)含子交界處無保守序列,內(nèi)含子的剪切是依靠RNase異體催化,進(jìn)行剪接;④內(nèi)含子和反密碼子配對形成莖環(huán)結(jié)構(gòu),保護(hù)了反密碼子,使其免受酶的降解。tRNA內(nèi)含子特點(diǎn):酵母tRNAPhe內(nèi)含子的結(jié)構(gòu)(引自B.Lewn,2000)剪接過程:第一步:核酸酶切割釋放一條線狀內(nèi)含子和兩個(gè)“tRNA半分子”第二步:RNA連接酶連接斷端切除tRNA內(nèi)含子的核酸酶很特殊,產(chǎn)生2′-3′環(huán)磷酸和5′-OH,因此不能直接連接。3′端需通過環(huán)磷酸二酯酶(Phosphodiesterase)將2′-3′環(huán)磷酸打開,形成3′-OH。5′端需在激酶作用下將5′-

4、OH磷酸化。再通過連接酶將兩個(gè)半分子連接起來。哺乳動(dòng)物的tRNA連接酶可將2′-3′環(huán)磷酸與5′-OH直接連接起來。剪接特點(diǎn):(1)真核tRNA內(nèi)含子的精確剪切不依賴內(nèi)含子的一級(jí)序列和大小,剪切反應(yīng)的識(shí)別信號(hào)是“三葉草”的二級(jí)結(jié)構(gòu);(2)不是轉(zhuǎn)酯反應(yīng);(3)RNase異體催化剪切內(nèi)含子。2、柄部結(jié)構(gòu)加工-----加上CCA-OH的3′末端tRNA核苷轉(zhuǎn)移酶tRNAnucleotidyltransferase3、堿基修飾(1)(1)(3)(2)(4)(2)還原反應(yīng)如:U?DHU(3)核苷內(nèi)的轉(zhuǎn)位反應(yīng)如:U?ψ(4)脫氨反應(yīng)如:A?I如:A

5、?Am(1)甲基化D臂反密碼子臂額外臂TψC臂受體臂補(bǔ)充:原核生物tRNA前體的加工(一)原核生物tRNA基因結(jié)構(gòu)原核的tRNA初始轉(zhuǎn)錄本多為多順反子(polycistron),少數(shù)的tRNA前體為單順反子(monocistron)?;蚪Y(jié)構(gòu)具體有三種不同的情況:1、幾個(gè)tRNA分子串連在一起串聯(lián)的;①串聯(lián)的tRNA分子都是相同的;②串聯(lián)的tRNA分子是不同的;2、由tRNA和rRNA串聯(lián)組成;3、tRNA前體為單順反子原核生物中三種tRNA前體分子(二)原核生物tRNA前體的加工tRNA的加工分成3個(gè)階段:(1)“斬頭”,形成5′末端

6、。RNaseP是由蛋白和RNA組成的復(fù)合體,分子量為130kDa,其RNA長375nt。RNaseP具有內(nèi)切酶的活性,可切除前體tRNA5′端的前導(dǎo)序列,此酶不識(shí)別特殊的序列,而識(shí)別二級(jí)結(jié)構(gòu)——發(fā)夾所組成的tRNA。(2)“去尾”,形成3′-OH末端。此過程由內(nèi)切酶RNaseF和外切酶的共同參與。前者識(shí)別發(fā)夾結(jié)構(gòu),后者識(shí)別CCA序列。對于具有CCA末端的1型tRNA前體修整3′端的外切酶是RNaseD,在CCA末端它一次切除(或逐步切除)3′的堿基。對于沒有CCA序列的2型tRNA前體分子來說,還不清楚是通過何種RNase外切酶來切。但

7、是,當(dāng)前體切除3′端附加序列后,必須外加CCA。“斬頭”“去尾”RNaseFRNaseF(3)修飾:在前體tRNA的一些專一部位的堿基需要通過甲基化酶,硫醇酶,假尿嘧啶核苷化酶等的作用進(jìn)行修飾成為特殊的堿基,如氨基酸臂上5′的4-硫尿苷(4tu),D臂上的2甲基鳥苷(2mG),TψC臂上的假尿苷(ψ)以及反密碼子環(huán)上的2異戊腺苷(2ipA)tRNA前體分子的加工a、切除tRNA前體兩端多余的序列:5’—端切除幾到10個(gè)核苷酸。b、末端添加:3’-端添加CCA序列。c、修飾:形成稀有堿基如DH2。RNAasePRNAaseFRNAaseP

8、RNAaseFRNAaseDRNAase?ACC???表示核酸內(nèi)切酶的作用表示核苷酸轉(zhuǎn)移酶的作用表示核酸外切酶的作用表示異構(gòu)化酶的作用-CCA二、rRNA前體的加工(一)真核生物rRNA基因結(jié)構(gòu)真核生物的1

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