美國國立生物技術(shù)信息中心(ncbi)的數(shù)據(jù)庫資源

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1、美國國立生物技術(shù)信息中心(NCBI)的數(shù)據(jù)庫資源生命學(xué)院生物技術(shù)專業(yè)2002級周帥學(xué)號021402142[摘要]除了提供GenBank核酸序列數(shù)據(jù)庫以外,美國國家生物技術(shù)信息中心還提供對于GenBank中數(shù)據(jù)的分析,檢索資源,另外還通過其網(wǎng)站提供一系列的有價值的生物數(shù)據(jù)及信息。NCBI數(shù)據(jù)的檢索資源包括Entrez,PubMed,LocusLink以及Taxonomy瀏覽器。數(shù)據(jù)分析資源包括BLAST,電子PCR,開放閱讀框?qū)ひ捚?,序列提交工具,唯一人類基因序列集合,基因同源物?shù)據(jù)庫,單核苷酸多態(tài)性數(shù)據(jù)庫(d

2、bSNP),人類基因組測序,人類基因組基因圖譜,分類學(xué)瀏覽器,人-鼠同源基因圖譜,異常癌癥基因組計劃(CCAP),Entrez基因組,垂直同源基因簇(COGs)數(shù)據(jù)庫,反轉(zhuǎn)錄病毒基因分類工具,癌癥基因組剖析計劃(CGAP),基因表達連續(xù)分析圖譜(SAGEmap),綜合性基因表達(GEO),在線孟德爾人類遺傳(OMIM),三維蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的分子模型數(shù)據(jù)庫(MMDB)以及保守序列數(shù)據(jù)庫(CDD)。BLAST程序通過增加一些網(wǎng)站的應(yīng)用程序?qū)崿F(xiàn)搜索某些特殊數(shù)據(jù)的最優(yōu)化方式。所有的資源可以通過NCBI的首頁得到:http

3、://www.ncbi.nlm.nih.gov。引言作為美國國家衛(wèi)生研究院(NIH)的國立醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)的一個分支,美國國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)成立于1988,其目標是發(fā)展新的信息學(xué)技術(shù)來幫助對那些控制健康和疾病的基本分子和遺傳過程的理解。除了提供由各個科研院所直接提供的GenBank核酸序列數(shù)據(jù)庫以外,NCBI還提供對于GenBank中數(shù)據(jù)檢索系統(tǒng)和計算工具以幫助分析GenBank的數(shù)據(jù)以及其他的NCBI提供的可利用的生物信息數(shù)據(jù)。NCBI首頁(http://www.ncbi.nlm.nih.

4、gov)所提供的可用數(shù)據(jù)涵蓋了部分基因的代表性短序列、完整的基因組、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)以及一些遺傳疾病的臨床描述。NCBI提供了一系列的計算工具以幫助分析各種類型的數(shù)據(jù)。總體來說,NCBI的整套數(shù)據(jù)庫資源分為7大類:數(shù)據(jù)庫檢索系統(tǒng),相似序列檢索程序,基因序列分析數(shù)據(jù)庫,染色體序列數(shù)據(jù)庫,基因組分析數(shù)據(jù)庫,基因表達與顯型分析數(shù)據(jù)庫,以及蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和建模數(shù)據(jù)庫。數(shù)據(jù)庫檢索工具EntrezEntrez是一個綜合的數(shù)據(jù)庫檢索系統(tǒng),可以通過三維蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的分子模型數(shù)據(jù)庫(MMDB)搜索到DNA和蛋白質(zhì)序列、基因組圖譜、人類數(shù)據(jù)

5、以及蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)并通過深入鏈接到NCBI的分類中的PubMed以及在線孟德爾人類遺傳(OMIM)搜索生物醫(yī)學(xué)文獻。Entrez中的序列數(shù)據(jù),尤其是蛋白質(zhì)序列,是通過各種數(shù)據(jù)庫資源(包括GenBank蛋白質(zhì)翻譯,蛋白質(zhì)鑒別數(shù)據(jù)庫(4),SWISS-PROT(文本術(shù)語)(5),蛋白質(zhì)研究基礎(chǔ),蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(6)以及數(shù)據(jù)庫參考序列(7))獲得的,并且因此比單獨的GenBank擁有更多的序列數(shù)據(jù)。loanmanagement(post)review:1,approvalcriteriahavebeenimplement

6、ed;2,thecontractiscorrect;3,inlinewiththecontract,payment;4,noothermajorcasesagainstloansecurity;、Reviewedby:dateofrecordform9:qilubankborrowingbysingleyearsofmaximumamountamaximumno-loanborrowers:borrowers:...Borrowernamenumber,lineofcreditexpirydateyearmo

7、nthdaytoyearmonthdaymaximumnumberofyearsintheloancontractarethetoplineopened,theborrowedandrequestedyourbankopenedcreditlinesabove,isherebyrequested.Borrowersignature:dateagreedtoopencreditlines.CustomerManagersignature:dateagreedtoopencreditlines.Loanrevie

8、wsignature:datelinecancellation-Ididnotusetheloanamount,yourbankcreditlinestobecancelled.-Creditloanprincipalrepayment,yourbankcreditlinestobecancelled.Borrowersignature:date-unusedcreditlines,agreetow

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