hyperchem學(xué)習(xí)

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1、Hyperchem學(xué)習(xí)小組成員：胡非非王珊珊張鵬程楊素鄧超張春洪花木興李慶湖龍繼亮概況：HyperChem用戶界面的介紹討論如何使用工具、菜單和菜單項(xiàng)建立、編輯、顯示和操縱分子學(xué)習(xí)內(nèi)容：打開——打開、關(guān)閉某一文件，使用標(biāo)簽和分子效果圖基本繪圖和編輯——畫圖、選擇、復(fù)制及刪除原子連接創(chuàng)建小分子的2D和3D模型——繪制和編輯2D圖將其轉(zhuǎn)為3D模型交換、旋轉(zhuǎn)、縮放分子——移動和操縱分子測量結(jié)構(gòu)屬性——測量和調(diào)整分子幾何結(jié)構(gòu)創(chuàng)建一個多肽——創(chuàng)造生物聚合物，學(xué)會使用氨基酸和酸數(shù)據(jù)庫*打開文件File→Open→Hyperchem→Samples→c60.hin→*使用laberDisplay→La

2、bels→*使用不同MoleculerRenderingsDisplay→Rendering→Balls↓←一、打開二、基本繪圖和編輯DrawingAtomsDrawingBondsSelectingAtomsSelectingGroupsofAtomsDeletingAtomsCopyingAtomstotheClipboard*畫原子Build→DefaultElement→↓←PropertiesOk←*畫原子Ok→工作區(qū)→左鍵→*連接將鼠標(biāo)移動至某一畫好的碳原子上，按住鼠標(biāo)將其拖至另一相連的碳原子上邊，放開鼠標(biāo)，則：*選擇原子Select→Atoms→TurnoffMultipl

3、eSelections→↓將鼠標(biāo)移動至想要的原子或者其他原子上面則可對相應(yīng)原子進(jìn)行選擇*多原子的選擇Select→TurnoffSelectSphere→同時點(diǎn)擊鼠標(biāo)的左右鍵，圈出想要的多個原子→Select→TurnonMultipleSelections→同時點(diǎn)擊鼠標(biāo)的左右鍵→放開鼠標(biāo)*刪除原子將鼠標(biāo)移動至點(diǎn)擊左鍵選擇所要刪除的原子或者鍵型右擊鼠標(biāo)*復(fù)制原子到Clipboard將鼠標(biāo)移動至點(diǎn)擊左鍵將鼠標(biāo)移動至某一原子或鍵型，點(diǎn)擊左鍵三、小分子的2D和3D模型1，畫2D圖2，保存文件3，改變鍵型連接4，制作苯環(huán)5，標(biāo)記原子6，編輯個人原子7，調(diào)用模型生成器*畫2D圖Build→Turn

4、onArbitrayValence→TurnoffExplicitHydrogens→DefaultElement→ElementTable→選擇原子→→畫圖如下*保存文件File→SaveAs→保存←*改變鍵型連接將鼠標(biāo)移動至需要修改鍵型的原子上面，左擊鼠標(biāo)同時移動至另一個原子上面，則*制作苯環(huán)用鼠標(biāo)單擊環(huán)形結(jié)構(gòu)中的任一原子，則可畫出苯環(huán)*標(biāo)記原子Display→Labels→→Symbol→OK↓↑↓↑↑→→↑*編輯個人原子雙擊鼠標(biāo)左鍵→ElementTable→選擇原子→關(guān)閉ElementTable→將鼠標(biāo)移動至想要編輯的原子上面，單擊左鍵，則該原子變?yōu)樽约汉竺嫠x原子，如*選用模

5、型生成器Build→AddHandModelBuild→如果沒有顯示相應(yīng)原子，則進(jìn)入Display→ShowHydrogens四、交換、旋轉(zhuǎn)、縮放分子XY軸工具的使用Z軸工具的使用縮放工具的使用定心和縮放XY軸旋轉(zhuǎn)Z軸旋轉(zhuǎn)Z軸剪輯*XY軸工具的使用→工作區(qū)→移動鼠標(biāo)，則所畫圖像隨著移動→雙擊↓輸入XY軸的變化量如：←↓OK*Z軸工具的使用Display→Rendering→→VectorandLineOptions→→TurnonPerspective↓移動鼠標(biāo)←←確定↓←*縮放工具的使用按著鼠標(biāo)左鍵移動鼠標(biāo)*定心和縮放DisplaySelecttoFit恢復(fù)原來大小*XY軸轉(zhuǎn)換移動鼠標(biāo)

6、可進(jìn)行XY軸的旋轉(zhuǎn)*Z軸的旋轉(zhuǎn)將鼠標(biāo)移動至工作區(qū)，則可以對分子進(jìn)行旋轉(zhuǎn)*Z軸的剪輯雙擊移動兩側(cè)紅框部分注意觀察變化OK五、測量結(jié)果屬性創(chuàng)建2D結(jié)構(gòu)編輯此結(jié)構(gòu)建立3D框架查看某個原子鍵長鍵角測量*創(chuàng)建2D結(jié)構(gòu)*編輯此結(jié)構(gòu)雙擊環(huán)狀結(jié)構(gòu)BuildDefaultElementN將一個碳原子換成氧原子，同時點(diǎn)擊DISPLAY接著點(diǎn)擊Labers選擇Symbol*建立3D框架Build→TurnoffExplicitHydrogens→雙擊*查看某個原子Select→關(guān)閉Atoms和MultipleSeltctions→點(diǎn)擊氧原子注意此處*鍵長單擊碳氧鍵鍵長表示在此處*鍵長測量Select→Turn

7、onMultipleSelections→右擊鼠標(biāo)（選中所有原子）→左擊鼠標(biāo)兩個原子→原子間距離顯示在狀態(tài)欄*鍵角測量按住鼠標(biāo)左鍵從碳原子拖到氫原子，接著放開鼠標(biāo)則鍵角顯示六、創(chuàng)建多肽AminoAcids對話框的使用創(chuàng)建一個多肽創(chuàng)建一個兩性分子位點(diǎn)專一誘變*AminoAcids對話框的使用Databases→AminoAcids→構(gòu)造α折疊折疊片β折疊不同氨基酸結(jié)構(gòu)Ala為丙氨酸Val為纈氨酸Gly為甘氨酸*創(chuàng)建一個多肽進(jìn)入Amin