化學化工常用軟件介紹

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1、主講:譚世語重慶大學化學化工學院化學化工 常用軟件介紹化學化工常用軟件介紹本講主要內容1.數據處理工具2.分子模擬計算軟件3.輔助設計軟件4.過程模擬軟件5.虛擬儀器平臺6.化工物性數據網站1數據處理工具1.1MATLABMATLAB是一種用于算法開發(fā)、數據可視化、數據分析以及數值計算的高級技術計算語言和交互式環(huán)境。MATLAB是矩陣實驗室的簡稱,和Mathematica、Maple并稱為三大數學軟件。MATLAB是一種由美國MathWorks公司出品的商業(yè)數學軟件,是一種數值計算環(huán)境和編程語言,主要包括MATLAB和Simulink兩大部分。MATLAB可以進行矩陣運算

2、、繪制函數和數據圖、實現(xiàn)算法、創(chuàng)建用戶界面、連接其他編程語言的程序等,主要應用于工程計算、控制設計、信號處理與通訊、圖像處理、信號檢測等。MATLAB的基本數據單位是矩陣,它的指令表達式與數學,工程中常用的形式十分相似,可支持和調用C,F(xiàn)ORTRAN,C++,JAVA。MATLAB窗口MATLAB的圖形功能強大1.2OriginOrigin為OriginLab公司出品的較流行的專業(yè)函數繪圖軟件,是公認的簡單易學、操作靈活、功能強大的軟件,既可以滿足一般用戶的制圖需要,也可以滿足高級用戶數據分析、函數擬合的需要。Origin具有兩大主要功能:數據分析和繪圖。Origin的數

3、據分析主要包括統(tǒng)計、信號處理、圖像處理、峰值分析和曲線擬合等各種完善的數學分析功能。Origin的繪圖是基于模板的繪圖,它本身提供了幾十種二維和三維繪圖模板而且允許用戶自己定制模板。用戶可以自定義數學函數、圖形樣式和繪圖模板;可以和各種數據庫軟件、辦公軟件、圖像處理軟件等方便的連接;可導入包括ASCII、Excel、pClamp在內的多種數據;可以把Origin圖形輸出到多種格式的圖像文件,譬如JPEG、GIF、EPS、TIFF等等。Origin窗口Origin圖形在Word中的編輯2分子模擬軟件6.2.1HyperCam6.2.2ChemOffice6.2.3Gauss

4、ian6.2.4GAMESS2.1HyperCamHyperCam是一款以高質量,靈活易操作而聞名的分子模擬軟件。通過利用3D對量子化學計算,分子力學及動力學進行模擬動畫,HyperCam為您提供比其它Windows軟件更多的模擬工具。圖形界面,有半經驗方法(AM1,PM3等),UHF,RHF和CI和7.0版新增加的密度泛函??蛇M行單點能,幾何優(yōu)化,分子軌道分析,預測可見-紫外光譜,蒙特卡羅和分子力學計算。功能包括:1.結構輸入和對分子操作。2.顯示分子。3.化學計算。用量子化學或經典勢能曲面方法,進行單點、幾何優(yōu)化和過渡態(tài)尋找計算。可以進行的計算類型有:單點能,幾何優(yōu)化

5、,計算振動頻率得到簡正模式,過渡態(tài)尋找,分子動力學模擬Langevin動力學模擬,MetropolisMonteCarlo模擬。支持的計算方法有:從頭計算,半經驗方法,分子力學,混合計算。4.可以用來研究的分子特性有:同位素的相對穩(wěn)定性;生成熱;活化能;原子電荷;HOMO-LUMO能量間隔;電離勢;電子親和力;偶極矩;電子能級;MP2電子相關能;CI激發(fā)態(tài)能量;過渡態(tài)結構和能量;非鍵相互作用能;UV-VIS吸收譜;IR吸收譜;同位素對振動的影響;對結構特性的碰撞影響;團簇的穩(wěn)定性。2.1HyperCam5.支持用戶定制的外部程序。6.其它模塊:RAYTRACE模塊,RMS

6、Fit,SEQUENCE編輯器,晶體構造器;糖類構造器,構像搜尋,QSAR特性,腳本編輯器。7.新的力場方法:Amber2,Amber3,用于糖類的Amber,Amber94,Amber96。8.ESR譜(電子自旋共振)。9.電極化率。10.二維和三維勢能圖。11.蛋白質設計。12.電場。13.梯度的圖形顯示。14.新增功能:密度泛函理論(DFT)計算;NMR模擬;數據庫;Charmm蛋白質模擬;半經驗方法TNDO;磁場中分子計算;激發(fā)態(tài)幾何優(yōu)化;MP2相關結構優(yōu)化;新的芳香環(huán)圖;交互式參數控制;增強的聚合物構造功能;新增基組。HyperCam窗口2.2ChemOffic

7、eChemoffice分為功能不同的幾個版本。其ChemOfficeUltra版本包含了:ChemDrawUltra(化學結構繪圖)、Chem3DUltra(分子模型及仿真)和ChemFinderPro(化學信息搜尋整合系統(tǒng))。此外還加入了E-NotebookUltra8.0,BioAssayPro8.0,量化軟件MOPAC、Gaussian和GAMESS的界面,ChemSARServerExcel,CLogP,CombiChem/Excel等等,ChemOfficePro還包含了全套ChemInfo數據庫,有ChemACX和

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