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《鈣黏素家族相關(guān)基因與涎腺腺樣囊性癌轉(zhuǎn)移的關(guān)系》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在工程資料-天天文庫。
1、鈣黏素家族相關(guān)基因與涎腺腺樣囊性癌轉(zhuǎn)移的關(guān)系作者:佘林,丁林燦,王錦鋒,盧友光【摘要】 目的篩選與涎腺腺樣囊性癌轉(zhuǎn)移相關(guān)的鈣黏素(CDH)家族基因。方法對涎腺腺樣囊性癌轉(zhuǎn)移能力不同的兩個細胞株的基因表達譜進行生物信息學(xué)分析,篩選出可能與轉(zhuǎn)移相關(guān)的CDH家族基因,通過熒光實時定量PCR技術(shù)對相關(guān)基因的表達差異進行驗證,并用免疫組織化學(xué)技術(shù)研究有差異的CDH基因在臨床樣本中的表達及其與轉(zhuǎn)移的關(guān)系。結(jié)果生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),表達譜中有14個CDH家族基因在兩個細胞株中的表達有差異,實時定量PCR驗證發(fā)現(xiàn)CDH4、CDH5、CDH12在兩細胞株之
2、間的表達差別有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),免疫組織化學(xué)發(fā)現(xiàn)CDH12在有轉(zhuǎn)移的臨床標本中的表達高于沒有轉(zhuǎn)移的標本((P<0.05)。結(jié)論CDH12可能與涎腺腺樣囊性癌的高轉(zhuǎn)移能力有關(guān)。【關(guān)鍵詞】癌,腺樣囊性;涎腺腫瘤;鈣黏著糖蛋白類;聚合酶鏈反應(yīng);免疫組織化學(xué) ABSTRACT:ObjectiveToexploretherelationshipoftheexpressionofcadherinfamilygenesandthemetastasisofadenoidcysticcarcinoma.MethodsThegenes
3、ofadenoidcysticcarcinomaaticsanalysisfromACC2andACCMgeneexpressionspectra.ThecorrelativegenesinvolvingCDHfamilyined.RealtimePCRinethemRNAlevelofthesegenesintheACC2andACCM.Thenimmunohistochemicalmethodsa.ResultsForteenkindsofgenesgeneexpressionprofile.RealtimePCRdemo
4、nstratedthattheexpressionofCDH4andCDH12inACCMetastasisandrecurrencethanayplayanimportantroleinthemetastasisofadenoidcysticcarcinoma. KEY和低轉(zhuǎn)移細胞株ACC2由上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第九人民醫(yī)院口腔頜面外科腫瘤實驗室惠贈。其中ACCM為ACC2經(jīng)過裸鼠體內(nèi)連續(xù)傳代培養(yǎng)分離出的高轉(zhuǎn)移細胞株。免疫組織化學(xué)標本為1998-2008年福建醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院和福建醫(yī)科大學(xué)附屬協(xié)和醫(yī)院手術(shù)切除并經(jīng)病理確診
5、為涎腺腺樣囊性癌的腫瘤石蠟組織標本,其中發(fā)生轉(zhuǎn)移的23例,未轉(zhuǎn)移57例?! ?.1.2主要試劑 Trizol試劑(美國Invitrogen公司)、PrimeScriptRTreagentKit(日本TaKaRa公司)、SYBRPremixExTaq(日本TaKaRa公司)、CDH12抗體(美國RD公司)、UltraSensitiveSP超敏試劑盒、磷酸鹽緩沖液PBS、檸檬酸鹽抗原修復(fù)液、加強型DAB顯色試劑盒(福州邁新生物技術(shù)開發(fā)有限公司)?! ?.1.3主要儀器 梯度PCR儀(MastercyclerGradient5331,德國
6、Eppendorf公司)、熒光定量PCR儀(TP800,日本TaKaRa公司)、GeneSnap凝膠成像系統(tǒng)(InGeniusLHR,英國SynGene公司)、石蠟自動包埋脫水機(H2245,德國LEIca公司)?! ?.2方法 1.2.1篩選CDH家族基因 根據(jù)盧友光等構(gòu)建的涎腺腺樣囊性癌基因表達譜,進行生物信息學(xué)分析,使用圖像分析軟件測量出所有片段在凝膠上的遷移距離[5]。SAS統(tǒng)計軟件進行曲線擬合,找出最佳擬合曲線,計算各片段bp值。根據(jù)擬合結(jié)果,以片斷大小和所在“表達窗”作參數(shù),按2%容許誤差從數(shù)據(jù)庫(QbiogeneInc
7、.&MPBiomedicalsInc公司提供)確定其所對應(yīng)的基因,每個片段數(shù)據(jù)均與NCBIGeneBank直接鏈接,從而對涎腺腺樣囊性癌的基因表達譜進行分析初步得出與CDH家族相關(guān)基因14種。通過NCBIGenebank和UCSC查詢14種基因的序列,使用Primer3(v.0.4.0)在線設(shè)計引物(表1),引物委托上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。表114種基因以及內(nèi)參照引物(略),Tab114kindsofgenesandinternalreferenceprimer(略)?! ?.2.2實時定量熒光PCR 通過Trizol法抽
8、提RNA,用紫外分光光度儀檢測RNA純度和濃度。純度和濃度達到實驗要求后,將各個樣品總RNA稀釋至相同濃度,使用PrimeScriptRTreagentKit逆轉(zhuǎn)錄試劑盒逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。熒光