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《橡膠草種質(zhì)資源ssr分子標(biāo)記遺傳多樣性分析》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫(kù)。
1、橡膠草種質(zhì)資源SSR分子標(biāo)記遺傳多樣性分析摘要橡膠草為多年生草本植物,菊科蒲公英屬,在我國(guó)的新疆、東北、華北及西北等地區(qū)都有分布。橡膠草根部含有天然橡膠,是重要的產(chǎn)膠作物,美國(guó)和歐盟已將其作為生產(chǎn)天然橡膠的戰(zhàn)略作物。橡膠草遺傳多樣性研究是遺傳改良的基礎(chǔ),對(duì)橡膠草種質(zhì)資源的保存和利用具有重要意義。本研究利用基于網(wǎng)上公布的644個(gè)橡膠草EST序列,篩選到的33個(gè)具有多態(tài)性的SSR標(biāo)記,對(duì)來(lái)自山西、海南、新疆、甘肅、美國(guó)、俄羅斯等共8個(gè)不同生態(tài)環(huán)境的48份材料進(jìn)行遺傳多樣性分析。結(jié)果如下:(1)SSR標(biāo)記多態(tài)性分析結(jié)果顯示,標(biāo)記WJ-5、JJ-27、JJ-28和JJ-3
2、5J的多態(tài)性較好,其中JJ-27表現(xiàn)最為突出。(2)48份橡膠草群體間的遺傳相似系數(shù)(GS),平均值為0.7279,范圍在0.2989-1之間,其中A3與A7的遺傳相似系數(shù)為1,相似度高,可能為姐妹系;B2與B3的遺傳相似系數(shù)為0.9547,遺傳關(guān)系較相近;A2與301的遺傳相似系數(shù)最?。?.2989),說(shuō)明二者的遺傳距離比較遠(yuǎn);美國(guó)材料間遺傳相似系數(shù)平均為0.851,且與其它材料遺傳差異較大,為單獨(dú)類群;來(lái)自俄羅斯的兩個(gè)材料(301和302)間遺傳相似系數(shù)為0.6826,差異較大,其中302與美國(guó)材料間遺傳關(guān)系較近;對(duì)照蒲公英(P)和白色蒲公英分屬不同類群,遺傳
3、關(guān)系較遠(yuǎn),遺傳相似系數(shù)為0.6808;美國(guó)橡膠草材料和俄羅斯的302材料與做為對(duì)照的蒲公英(P)和白色蒲公英(BP)間遺傳距離遠(yuǎn);俄羅斯的301材料和國(guó)內(nèi)山西、海南、新疆、甘肅、U-2和做為對(duì)照的白色(BP)間親緣關(guān)系較近。(3)遺傳變異分析和AMOVA分析發(fā)現(xiàn),橡膠草材料地區(qū)間,材料間和材料內(nèi)均對(duì)橡膠草的遺傳變異產(chǎn)生重要影響,其中材料間對(duì)其的影響最大,占40%;其次為材料內(nèi)變異,占32%;最后為橡膠草材料地區(qū)間,占28%。(4)綜合橡膠草種質(zhì)的表型特征和本研究SSR標(biāo)記分析結(jié)果:來(lái)源于美國(guó)的材料(共21份)和自來(lái)俄羅斯的302可能是優(yōu)良的橡膠草種質(zhì)。關(guān)鍵詞:橡膠
4、草;種質(zhì)資源;SSR標(biāo)記;遺傳多樣性i萬(wàn)方數(shù)據(jù)華中農(nóng)業(yè)大學(xué)2015屆專業(yè)學(xué)位碩士研究生學(xué)位論文AbstractTaraxacumKok-saghyzRodin(TKS),Russiandandelion,isakindofasteraceaeperennialherbplants,widelydistributedinthenortheast,northornorthwestofxinjiangregionsofChina.TherootofTaraxacumKok-saghyzRodincontainsnaturalrubber.Asanimportantrub
5、berproducingstrategiccrops,ithasbeengivenwidelyattentionintheUnitedStatedandEurpopeanUnion.TaraxacumKok-saghyzRodindiversityresearchisthebasisofgeneticimprovement,andisofsignificanceforTKSgermplasmresourcesconservationandinnovation.Inthisresearch,combinedwithmorphologicalcharacteristi
6、csresults,thegeneticdiversityofthe48TaraxacumKok-saghyzRodinvarietiesfrom8differentlocationswasanalyzed,using33effectiveSSRmarkerswhichdesignedbasedonthe644ESTsequencesavailableonthenet.Themainresultsthatachievedinthisresearchareshownasfollows:(1)4ofthe33SSRmarkers,WJ-5,JJ-27,JJ-28and
7、JJ-35,areofbetteramplifiedpolymorphismaccordingtotheanalysisresultofSSRamplifiedpolymorphismmarkers,especiallyJJ-27standoutinthe4ofthem.(2)Theaveragevalueofthegeneticsimilaritycoefficientamongthe48TaraxacumKok-saghyzvarietiesis0.7279,thegeneticsimilaritycoefficientbetweenA3andA7is1whi
8、chimp