流感嗜血桿菌菌毛基因簇的生物信息學(xué)分析與分析軟件測評

流感嗜血桿菌菌毛基因簇的生物信息學(xué)分析與分析軟件測評

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1、流感嗜血桿菌苗毛基因的生物信息學(xué)分析及分析軟件測評第一章引言1.1關(guān)于流感嗜血桿菌(Hi)1.1.1Hi概述流感嗜血桿菌(Haemoph/lusinF]uenzae,彪)是一類革蘭氏陰性小桿菌,大小為(O.3~O.5)×(1.0~1.5)um。流感嗜血桿菌屬于巴斯德(氏)菌科(Pasteure]]aceae),嗜血桿菌屬(Haemophilus),巴斯德(氏)菌科與弧菌科(Vibrionaceae)和腸道桿菌(Enterobacteriaceae)屬于同一分類等級,這一家族還包括另外兩個動物寄生蟲的細菌屬,巴斯德桿菌(Pasteure]]a)

2、和放線桿菌(Actinobaci]]us)。表卜lTIGR注釋的流感嗜血桿菌RdKw20的分類Table1—1TaxonomyofHaemophilusSnf]uenzaeKW20RdfromTIGRKingdom:BacteriaIntermediateRankl:ProteobacteriaIntermediateRank2:GammaproteobacteriahtermediateRank3:PasteurellalesInterntediateRank4:PasteurellaceaeIntermediateRank6:Haemop

3、hilusinfluenzaeGenus:HaemophllusSpecies:InfluenzaeStrainRdKw20嗜血桿菌屬(Haemophius)為一群沒有動力、無芽孢、菌體呈球桿狀的革蘭氏陰性小桿菌,生長要求較高,在人工培養(yǎng)時需要新鮮血液才能生長(新鮮血液中含有豐富的x和V因子),,投稱嗜血桿菌。所有細菌均為寄生性,主要寄生于上呼吸道,多數(shù)是致病菌。嗜血桿菌屬中使人感染的細菌主要有:流感嗜血桿菌(尼influenzae)、副流感嗜血桿菌(丘parainf]uenzae)、杜克嗜血桿菌(世ducreyi)、嗜沫嗜血桿菌(尼aphr

4、ophilus)。4中出丈學(xué)壤jj學(xué)位論空流感嗜姐桿菌是該屬中最常導(dǎo)致人類感染的致瘸菌之一。1930以前一直被談?wù)J為是流感的病原體,以麟才知道流感熄由病毒引起的,但流感嚼瓶桿菌的名稔僚整‘}下來。獲弦脊?jié)L孛箍墩靜滾鎣嚼纛釋墓翡毒爽貘菌探是蘧耱薤,長菠麩0.2um~O.Sum都有,它們在形態(tài)學(xué)上與釋致百日咳的酉臼咳博德特氏菌(BordetellapertussYs)相似;從唾液中提取的無英膜的樣本是多晶體并通常掇疆長夔線獲袋絲凌。在熱長瓣框絮中,葳睡滾孛據(jù)激翡流感爝巍釋驀呈理孳蘭氏兩極染色,這種情況常常導(dǎo)致與肺炎鏈球菌屬(Streptococc

5、uspneumon]ae)的錯誤的鑒別03。圍卜1痰液中提取的滾麟嬉盤抒鎣革蘭援姓蓮Figurel—lGramstainofHaemophiIusinfluenzaefromsputum流感嗜呶杼菌生長需求較高,在人工培養(yǎng)時需加入新鮮血液才能生長,故名嚼斑釋菌搿。入炎是流感嘻巍桿菌的理憋宿主,大約75%的健康Jb囂和成人靜爨咽部都有Hi寄生?。根據(jù)葵袋豹糙多耱成分霹憋流感嗜巍耪莛分為a、b、£、d、e釃f等6個蠹圖卜2流感嗜血桿菌b型菌(科學(xué)圖片庫,英國)Figure1-2Haemophilusinfluenzaetypebbacteda.(

6、SciencePhotoIAbrary,uIC)5流感嗜擻軒蓮蓬毛蒸程豹生耱?;菡品州嫾皠葺嬡涐尠曛?jǐn)濾型,箕巾b型(Haemophilusinfluenza,etypeh,Hib)致疲力最強,主要致病物質(zhì)為英膜、菌毛與內(nèi)海素等。Bib猩l隘床上可弓f超嚴(yán)重感縶,可致d,JL肺炎、腦膜炎、骨髓炎、黢血癥等痰病,嚴(yán)熬影響贅兒童的健康成長:其中,肺炎是我國嬰幼兒死亡豹第一位病因。Hib是細菌性肺炎鞍為常見的病因,僅次子肺炎鏈球菌。Hif—LKP在糨寐土在屁童孛主簧弓l超蠡奉炎、會獲炎、孛耳灸簿疾?。涸诔扇酥幸鹣潞粑栏腥荆貏e是老年人的慢性、反復(fù)

7、發(fā)作的支氣管炎。1892華,波蘭科學(xué)家Pfeiffer從流感患者的彝粘膜中首次分離出流感嗜血桿藏。一直爨寒發(fā)逸爨家一豢在致力手玨i豹磷究工鋒。1932年Smith等迂實羚囂為流行性感冒的病原菌,但譙流感發(fā)生時常弓I起繼發(fā)性感染,亦可引起其他化膿性黲縶。1971年Rodrigues等系統(tǒng)掇鋒了Hib葵驥多耱螢蕾鶼提取、縫純及耪瑾億學(xué)性質(zhì),并選擇其為小兒免疫菌苗在人體上進行試用研究。近十多年來,眾多學(xué)者成功的研涮出了第二代Hib蛋自結(jié)合菌苗,并進行了大量試用研究。取褥了良好效果。1995年,熒國基閼組研究所(TheInstituteforGeno

8、micResearch,TIGR)的Fleischmann等采用了鳥槍法(shotgun)的測序策略,酋次對流感嗜血轷蘊Rd型KW20揀瓣基因綴進行了測旁,勢發(fā)表了

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