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《科學(xué)研究動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)快報(bào)-上海圖書館》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在工程資料-天天文庫。
1、中國科學(xué)院國家科學(xué)圖書館科學(xué)研究動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)快報(bào)2012年7月1日第13期(總第182期)生命科學(xué)專輯?NatureBiotechnology:數(shù)據(jù)共享的未來趨勢(shì)及面臨的挑戰(zhàn)?NIH生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)管理報(bào)告對(duì)NIH生物醫(yī)學(xué)研究數(shù)據(jù)共享提出重要建議?英國投資7500萬英磅新建一個(gè)生物信息技術(shù)中心?美國紐約科學(xué)院“營(yíng)養(yǎng)生物標(biāo)記物:研究與應(yīng)用新前沿”會(huì)議主題介紹?Science:全基因組測(cè)序應(yīng)用于臨床面臨的挑戰(zhàn)?NatureBiotechnology:新一代納米藥物的特點(diǎn)?BIO報(bào)告:全球生物技術(shù)如何受益于知識(shí)
2、產(chǎn)權(quán)中國科學(xué)院規(guī)劃戰(zhàn)略局中國科學(xué)院上海生命科學(xué)信息中心═══════════════════════════════════════════════════════中國科學(xué)院上海生命科學(xué)信息中心上海市岳陽路319號(hào)郵編:200031電話:021-54922966電子郵件:csd@sibs.ac.cn生命科學(xué)專輯2012年第13期(總182期)目錄熱點(diǎn)關(guān)注數(shù)據(jù)共享的未來趨勢(shì)及面臨的挑戰(zhàn)................................................1政策導(dǎo)向美國國立衛(wèi)
3、生研究院發(fā)布生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)管理報(bào)告........................5英國加大投資生物信息基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)............................................7營(yíng)養(yǎng)生物標(biāo)記物:研究與應(yīng)用的新前沿........................................8技術(shù)前沿全基因組測(cè)序應(yīng)用于臨床面臨的挑戰(zhàn)............................................9新一代納米藥物研究.................
4、.....................................................10產(chǎn)業(yè)動(dòng)態(tài)BIO報(bào)告:全球生物技術(shù)如何受益于知識(shí)產(chǎn)權(quán)..........................12專輯主編:孫繼林執(zhí)行主編:徐萍責(zé)任編輯:阮梅花王小理出版日期:2012年7月1日熱點(diǎn)關(guān)注按:2012年6月出版的NatureBiotechnology雜志刊登了一篇題名為“Mydataareyourdata”的文章,介紹了數(shù)據(jù)共享的未來趨勢(shì),并分析了數(shù)據(jù)共享面臨的挑戰(zhàn),本文介紹其主要內(nèi)
5、容。數(shù)據(jù)共享的未來趨勢(shì)及面臨的挑戰(zhàn)生命科學(xué)領(lǐng)域擁有成千上萬個(gè)數(shù)據(jù)庫,300多個(gè)術(shù)語系統(tǒng)和120多種交換格式。在目前數(shù)據(jù)推動(dòng)的大科學(xué)時(shí)代,不斷增加的數(shù)據(jù)共享是科學(xué)進(jìn)步的核心,并吸引著來各方關(guān)注。而且,數(shù)據(jù)共享領(lǐng)域也出現(xiàn)一些新的趨勢(shì),主要表現(xiàn)在共享的數(shù)據(jù)形式更加多元化,共享的層次更加深入。然而,要實(shí)現(xiàn)更廣泛、更深入的數(shù)據(jù)共享,需要克服技術(shù)障礙和人的影響因素。1數(shù)據(jù)共享的必要性共享在科學(xué)界一直是美德。雖然許多科學(xué)家接受研究數(shù)據(jù)共享的想法,認(rèn)為需要共享研究數(shù)據(jù),但是很少人將其付諸實(shí)踐。隨著生命科學(xué)研究產(chǎn)生
6、各種類型的大數(shù)據(jù)集,傳統(tǒng)的通過HTML和PDF格式在網(wǎng)上傳送研究論文的共1享方法即將過時(shí)。另一方面,數(shù)據(jù)也擁有更長(zhǎng)的尾巴:假設(shè)和爭(zhēng)論、元數(shù)據(jù)、方法、軟件代碼和工具、多媒體、工作流程和模式等。這些挑戰(zhàn)激發(fā)了一些新的數(shù)據(jù)共享行動(dòng)計(jì)劃,例如Biosharing項(xiàng)目、其他幾個(gè)非營(yíng)利項(xiàng)目和商業(yè)項(xiàng)目,從而使共享更易實(shí)現(xiàn)、更受歡迎(見表1)。專家們認(rèn)為,共享是必需的。如果不共享數(shù)據(jù)和方法,會(huì)存在重復(fù)研究的風(fēng)險(xiǎn),也會(huì)錯(cuò)過一些新的發(fā)現(xiàn)。表1目前重要的數(shù)據(jù)共享行動(dòng)計(jì)劃項(xiàng)目名稱共享功能共享趨勢(shì)商業(yè)項(xiàng)目在谷歌云端建立用戶
7、界面和鏡像擁有NCBI序列閱讀檔案(mirrors)300-400TB的SRA數(shù)據(jù)(SRA),用于下一代測(cè)序DNAnexus(無醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)),提供擁有知識(shí)產(chǎn)權(quán)平臺(tái)中產(chǎn)生的原始序列數(shù)據(jù)的基于云的分析與可視化工具,這些分析工具可共享給用戶基礎(chǔ)空間(BaseSpace),位于亞馬遜Illumina的平臺(tái)用戶產(chǎn)生的AWS云設(shè)施中的基因組學(xué)數(shù)據(jù)共享Illumina基礎(chǔ)空間數(shù)據(jù)共享、分析與儲(chǔ)存空間,目前處于β-版測(cè)試階段,需要用戶注冊(cè)。LifeTechnologiesIon用戶門戶,共享數(shù)據(jù)、協(xié)議共享門戶Ion
8、Torrent社區(qū)要求注冊(cè)TorrentCommunity和代碼1關(guān)于長(zhǎng)尾,請(qǐng)參考《長(zhǎng)尾理論》、《長(zhǎng)尾理論2.0》兩本書,以及“海量數(shù)據(jù)如何挖掘長(zhǎng)尾”,http://yubosun.akcms.com/product/hailiang-wajue-changwei.htm。1完整基因組學(xué)提供測(cè)序服務(wù)、數(shù)據(jù)管理與下游分析與數(shù)據(jù)共享服務(wù),進(jìn)入軟件(CompleteGenomics分析,結(jié)果共享服務(wù)提供商的市場(chǎng))對(duì)流程用戶和能力用戶定位于制藥外包和公私合作項(xiàng)目,如基因數(shù)據(jù)(power-u