日本血吸蟲轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究

日本血吸蟲轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究

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1、博士學(xué)位論文日本血吸蟲轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究所院:姓名:導(dǎo)師:指導(dǎo)教師:學(xué)科專業(yè):研究方向:完成日期:病原生物學(xué)研究所劉帥洪濤院士陳啟軍教授病原生物學(xué)分子寄生蟲學(xué)2012年5月31日獨創(chuàng)性聲明IIIIlllllllll(1lllll(1<((UllllflllY2123833本人聲明所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。論文中除了特別加以標(biāo)注和致謝的地方外,不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果,也不包含為獲得其他教育機構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料。與我一同工作的同志對本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說明并表示謝意。學(xué)

2、位論文作者簽名:簽字日期:≯夕位年歹月歲/日學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本學(xué)位論文作者完全了解j匕塞跡塑醫(yī)堂瞳有關(guān)保存、使用學(xué)位論文的管理辦法。有權(quán)保留并向國家有關(guān)部門或機構(gòu)送交論文的復(fù)印件和磁盤,允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)j星塞拯塑醫(yī)堂院可以將學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索,可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。(保密的學(xué)位論文在解密后適用本授權(quán)書)學(xué)位論文作者簽名:妒導(dǎo)師簽名:遞f弩簽字日期:7.夕/2年y月≥f日簽字日期:夕汐厶2年.歹月羅J日學(xué)位論文作者畢業(yè)后去向:工作單位:通訊地址:電話:郵編:目錄摘要??

3、????????????????????????.1Abstract?????????????????.????????????..3前言??????????????????????????????5日IJ舌??????????????????????????????)一、血吸蟲與血吸蟲病概述?????????????????????5二、血吸蟲基因組最新研究進(jìn)展???????????????????7三、血吸蟲轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究進(jìn)展???????????????????12材料與方法????????????????????.19一、實驗材料?????

4、?????????????????????19二、實驗方法??????????????????????????21實驗結(jié)果??????????????????????????..241.日本血吸蟲蟲體總RNA質(zhì)檢結(jié)果?????????????????242.日本血吸蟲寡核苷酸芯片的序列及探針信息?????????????303.日本血吸蟲寡核苷酸芯片可靠性分析????????????????304.日本血吸蟲看家基因分析?????????????????????365.日本血吸蟲基因組預(yù)測基因的qPCR驗證??????????????476.日本

5、血吸蟲不同發(fā)育階段蟲體差異表達(dá)基因分析???????????487.雌雄成蟲差異表達(dá)基因分析????????????????????558.不同終宿主體內(nèi)成蟲基因組表達(dá)譜比較分析?????????????599.日本血吸蟲全基因組蛋白酶表達(dá)譜分析???????????????61討論?????????????????????????????66總結(jié)??????????????????????????????69參考文獻(xiàn)?????????????????????..70附錄???????????????????????????80附錄I英語縮略詞列

6、表???????????????????????80附錄11日本血吸蟲249個蛋白酶基因的表達(dá)譜數(shù)據(jù)???????????81附錄III在學(xué)期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文???????????????????90致謝???????????????????????????????91摘要血吸蟲病是一種嚴(yán)重危害人類健康的寄生蟲疾病,主要流行于熱帶和亞熱帶的76個國家及地區(qū),我國流行的是日本血吸蟲病。2009年,日本血吸蟲和曼氏血吸蟲基因組草圖公布,為實現(xiàn)世界范圍控制和消除血吸蟲病的戰(zhàn)略目標(biāo)提供了前所未有的生物信息資源和平臺。本研究依據(jù)最新公布的日本血吸蟲基因組序

7、列信息構(gòu)建寡核苷酸芯片,并將其應(yīng)用于蟲卵、尾蚴、肝期童蟲和成蟲四個發(fā)育階段的基因表達(dá)譜解析研究,為從分子水平揭示血吸蟲生長發(fā)育機制、致病機理以及血吸蟲與宿主相互作用機理奠定基礎(chǔ),為尋找新的抗血吸蟲病藥物標(biāo)靶及疫苗候選分子提供思路;同時,應(yīng)用該芯片比較分析了我國血吸蟲病主要傳染源宿主.水牛體內(nèi)成蟲與日本血吸蟲病研究常用實驗動物.新西蘭大白兔、BALB/c小鼠以及C57BL/6d、鼠體內(nèi)成蟲基因表達(dá)譜差異,為血吸蟲病動物模型研究成果轉(zhuǎn)化應(yīng)用于家畜血吸蟲病的預(yù)防治療提供理論依據(jù)。所取得的研究結(jié)果如下:1.日本血吸蟲寡核苷酸芯片構(gòu)建及可靠性分析本研究首次

8、利用最新公布的日本血吸蟲基因組序列構(gòu)建了目前為止包含日本血吸蟲基因信息量最大的寡核苷酸芯片。對14組血吸蟲樣本各進(jìn)行三次生物學(xué)重復(fù)雜交實

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