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《基于小鼠基因的基因預(yù)測算法研究》由會員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、萬方數(shù)據(jù)ANAPPROACHTOGENEPREDICTIONBASEDONMUSMUSCULUSGENESByHuLianguoSupervisedbyViceProf.LiQiangATHESiSSubmittedtoNanjingAgriculturalUniversityInPartialFulfillmentoftheRequirementsFortheMasterDegreeCompleteinMay,2014CommencementinMay,2014萬方數(shù)據(jù)原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明:所呈交的學(xué)位論文,是本人在導(dǎo)師的指
2、導(dǎo)下,獨(dú)立進(jìn)行研究工作所取得的成果。除文中已經(jīng)注明引用的內(nèi)容外,本論文不包含任何其他個人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的作品成果。對本文的研究做出重要貢獻(xiàn)的個人和集體,均已在文中以明確方式標(biāo)明。本人完全意識到本聲明的法律結(jié)果由本人承擔(dān)。學(xué)位論文作者(需親筆)簽名:埽噍襞掃ltf年r月沖日學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本學(xué)位論文作者完全了解學(xué)校有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定,同意學(xué)校保留并向國家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版,允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)南京農(nóng)業(yè)大學(xué)可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索,可以采用影印、縮印
3、或掃描等復(fù)制手段保存和匯編學(xué)位論文。保密口,在——年解密后適用本授權(quán)書。本學(xué)位論文屬于不保密眥(請?jiān)谝陨戏娇騼?nèi)打“√”)學(xué)位論文作者(需親筆)簽名:請?jiān)獙?dǎo)師(需親筆)簽名:≥眵年s月1日沙I嘩f月叼目萬方數(shù)據(jù)目錄摘要?????????????????????????????????????????????????IABSTRACT?????????????????????????????.??????????????.III第一章緒論?????????????????????????????????11.1生物信息學(xué)簡介???
4、?????????????????????????l1.2基因預(yù)測的研究背景和意義???????????????????????21.3基因預(yù)測的國內(nèi)外研究現(xiàn)狀???????????????????????41.4論文主要工作及安排??????????????????????????5第二章DNA序列的數(shù)值化???????????????????????????72.1真核生物的基因結(jié)構(gòu)??????????????????????????.72.2DNA序列的常用數(shù)值化映射???????????????????????82.2.
5、1Voss映射????????????????????????????.82.2.2Z.curve映射???????????????????????????92.2.3正四面體映射?????????????????????????..102.2.4復(fù)數(shù)法映射??????????????????????????..1l2.2.5實(shí)數(shù)法映射??????????????????????????一122.2.6PN法映射????_??????????????????????..122.3小結(jié)???????????????????????
6、????????????????????13第三章編碼區(qū)序列的統(tǒng)計特征????????????????????????153.13-周期性???????????????????????????????153.2平均互信息?????????????????????????????..173.3Z—curve特征?????????????????????????????173.4EQ(ElectricQuantity)?????????????????????????????????.173.5起始子與終止子特征??????????
7、???????????????.193.6其他統(tǒng)計特征及小結(jié)?????????????????????????.19第四章分類器模型?????????????????????????????214.1Fisher判別分類法的原理????????????????????????214.2Fisher判別分類法在基因識別中的具體應(yīng)用????????????????23第五章基于堿基3.周期性的小鼠基因預(yù)測???????????????????..275。l功率譜???????????????????????????????..275
8、.1.1容量法功率譜?????????????????????????..275.1.2優(yōu)化容量法功率譜???????????????????????..285.13堿基分布法功率譜????????????????????????285.2小鼠基因預(yù)測過程???