胃癌組織中microrna-200a的表達(dá)及靶基因預(yù)測

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1、目錄fNilIIIIIIIIIIIIIIIIIlfllIIIIIIfY2337682中文摘要???????????????????????????1英文摘要???????????????????????????3研究論文胃癌組織中MicroRNA．200a的表達(dá)及靶基因預(yù)測前’言?一????一?一????????．．????????一”?6刖舌?”“???“??””?????”?”??一“?“一???”?材料與方法????????????????????????6結(jié)果????????????????·??”?????

2、?“·12附圖???????????··??·?????·???······?一14附圖??????????????????????????17討論???????????···?????·????????··23結(jié)論???????????????????·??????··28參考文獻(xiàn)????????????????????????28綜述腫瘤相關(guān)的MicroRNA的研究進(jìn)展????????????32致謝??”????一“?“”?．．”?????一“““?????一“一”43個人簡歷?????????????????

3、?????????44中文摘要胃癌組織中MicroRNA．200a的表達(dá)及靶基因預(yù)測摘要目的：胃癌是源于胃粘膜上皮的惡性腫瘤，發(fā)病率及死亡率均很高。中國是胃癌高發(fā)的國家，發(fā)病率及死亡率均高于世界平均水平。雖然目前采取了包括手術(shù)、放療、化療及生物治療等綜合性治療，但治療的效果仍不十分理想，五年總生存低下。胃癌的發(fā)生有多種癌基因及抑癌基因的參與，揭示這些基因的變化規(guī)律，有助于闡明胃癌的發(fā)病機(jī)制，還能協(xié)助腫瘤的治療及預(yù)后。隨著近幾年對胃癌研究的深入，人們逐漸意識到胃癌發(fā)生的機(jī)制比想象的更加復(fù)雜。微小RNA(microRNA

4、，miRNA)是一類內(nèi)源性的長約21．25nt的非編碼單鏈RNA。研究發(fā)現(xiàn)，細(xì)胞的所有生物學(xué)過程幾乎都有miRNA參與，包括細(xì)胞的發(fā)育、增殖、凋亡等。miRNA在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中可能發(fā)揮著致癌或抑癌的作用。目前miRNA與腫瘤的關(guān)系逐漸受到重視，但其與胃癌的關(guān)系尚不明確。本研究通過Real．timePCR技術(shù)檢測miRNA一200a在胃癌患者的癌組織及癌旁正常組織中的表達(dá)情況，探討其表達(dá)情況與臨床病理因素間的相關(guān)性。并利用生物信息學(xué)方法探索miRNA．200a的相關(guān)靶基因。從而為闡明miR-200a在胃癌發(fā)生及發(fā)展中

5、的作用機(jī)制提供理論依據(jù)。方法：1收集2011年3月至6月于我院外科手術(shù)的，27例胃癌組織標(biāo)本及癌旁正常組織標(biāo)本。運(yùn)用定量Real．timePCR方法檢測miRNA．200a在胃癌組織及癌旁正常胃組織中的表達(dá)情況。采用配對t檢驗(yàn)分析miRNA一200a的表達(dá)在胃癌組織癌旁組織中的差異。2收集標(biāo)本的臨床病理資料，包括性別、年齡、腫瘤大小、浸潤深度、TNM分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、Borrmann分型和組織學(xué)分化程度等，然后采用單因素方差分析的統(tǒng)計(jì)學(xué)方法分析miRNA一200a在胃癌組織中的表達(dá)水平與胃癌臨床病理特征間的相關(guān)性。3

6、應(yīng)用生物信息學(xué)軟件PicTar、MiRanda冪13TargetScan對miRNA一200a的靶基因進(jìn)行預(yù)測，篩選共同的靶基因?；贕eneOntology數(shù)據(jù)庫，對共同的靶基因進(jìn)行GO分類，并對其進(jìn)行顯著性篩選，迸一步縮小靶基因中文摘要的范圍。結(jié)果：1Real．timePCR技術(shù)檢測27對胃癌及其癌旁正常組織miRNA．200a的相對表達(dá)量，結(jié)果顯示22例(81％)miRNA．200a在癌組織中的表達(dá)水平顯著低于癌旁正常組織，5例(29％)高于癌旁正常組織。在胃癌組織中相對表達(dá)量RQ值為0．334-0．01，對應(yīng)

7、癌旁正常組織為0．784-0．15，結(jié)果顯示miRNA．200a在胃癌組織中表達(dá)顯著下調(diào)，有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(尸O．05)。3運(yùn)用生物信息學(xué)軟件PicTar、MiRanda和TargetScan分析，預(yù)選出miRNA．200a靶基因的數(shù)目分別為430個、7645個和363個。發(fā)現(xiàn)交集靶基因共38個，包括KHDR

8、BS2、GNBl、加ⅥGBl、NOVAl、PAFAHlBl、PELll等?；贕eneOntology數(shù)據(jù)庫，對共同的靶基因進(jìn)行GO分類，并對其進(jìn)行顯著性篩選，提示部分靶基因參與信號的轉(zhuǎn)導(dǎo)、蛋白質(zhì)磷酸化、細(xì)胞增殖、遷移、凋亡等生物學(xué)過程。結(jié)論：1MiRNA．200a在胃癌組織中表達(dá)呈顯著下調(diào)，顯著低于癌旁正常組織中的表達(dá)。2MiRNA．200a