玉米穗部低氮響應(yīng)可變剪接的鑒定

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5、物學(xué)基礎(chǔ)培養(yǎng)單位：作物科學(xué)研究所中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院研究生院2015年11月Secrecy:No.ChineseAcademyofAgriculturalSciencesDissertationCharacterizationofAlternativeSplicinginResponsetoLow-nitrogeninMaizeEarsM.S.Candidate：YangHailongAdvisor：Prof.XieChuanxiaoMajor：CropGeneticsandBreedingSpecialty：BiologicalBasisforLow

6、-nitrogenToleranceinMaizeNovember2015摘要可變剪接是高等植物基因轉(zhuǎn)錄后表達(dá)調(diào)控的重要方式之一，在植物發(fā)育、逆境適應(yīng)性等方面扮演著重要角色。目前，可變剪接響應(yīng)低氮適應(yīng)性的調(diào)節(jié)還未得到鑒定。因此，本研究以氮敏感自交系掖478和耐低氮自交系許178為材料，分別于授粉前后進(jìn)行氮處理，對(duì)穗部進(jìn)行RNA測(cè)序與可變剪接分析。通過對(duì)不同處理樣本的可變剪接生物信息學(xué)分析，結(jié)論如下：1.內(nèi)含子保留是玉米穗部可變剪接的主要類型。八種樣品中，內(nèi)含子保留事件所占的比例最高，約為50%-60%。玉米中基因發(fā)生內(nèi)含子保留事件多為一到兩次，發(fā)

7、生次數(shù)越高，所占的比例越少。2.授粉前低氮條件下，許178和掖478分別有20.83%、26.66%的低氮響應(yīng)內(nèi)含子保留基因。GO生物過程分類中分別有222、275個(gè)基因表現(xiàn)與氮代謝過程有關(guān)，196、272個(gè)基因表現(xiàn)與生物合成過程有關(guān)，146、186個(gè)基因與逆境響應(yīng)有關(guān)，此外還有基因與蛋白修飾、形態(tài)建成、生殖發(fā)育過程有關(guān)。授粉后10天低氮條件下，許178和掖478分別有26.17%、25.44%的低氮響應(yīng)內(nèi)含子保留基因。GO生物過程分類中分別有255、240個(gè)基因表現(xiàn)與氮代謝過程有關(guān)，241、224個(gè)基因表現(xiàn)與生物合成過程有關(guān)，218、177個(gè)基

8、因與逆境響應(yīng)有關(guān)，此外還有基因與碳水化合物代謝、蛋白修飾、氨基酸代謝、酯類代謝、轉(zhuǎn)運(yùn)、催化過程、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、形態(tài)建成、胚胎發(fā)育、生殖發(fā)育過