河南省3種鱸形目魚類自然居群的遺傳多樣性分析

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1、單位代碼10476學(xué)號(hào)1204180328分類號(hào)Q38K南_筘夫寒碩士學(xué)位論文河南省3種鱸形目魚類自然居群的遺傳多樣性分析學(xué)科、專業(yè);遺傳學(xué)研究方向:魚類遺傳申請(qǐng)學(xué)位類別:理學(xué)碩士申請(qǐng)人:劉芳指導(dǎo)教師:楊太有教授二〇一五年五月獨(dú)創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明:所呈交的學(xué)位論文是我個(gè)人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。盡我所知,除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外,論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫的研究成果,也不包含為獲得河南師范大學(xué)或其他教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書所使用過(guò)的材料。與我一同工作的同志對(duì)本研究所做的任何貢獻(xiàn)均己在論文中作了明確的說(shuō)明并表示

2、了謝意。作者簽名:日期:M1〇關(guān)于論文使用授權(quán)的說(shuō)明本人完全了解河南師范大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定,即:有權(quán)保留并向國(guó)家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和磁盤,允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)河南師范大學(xué)可以將學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索,可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。(保密的學(xué)位論文在解密后適用本授權(quán)書)STUDYONTHEGENETICDIVERSITYOFTHREEPERCIFORMESNATURALPOPULATIONINHENANADissertationSubmittedtotheGra

3、duateSchoolofHenanNormalUniversityinPartialFulfillmentoftheRequirementsfortheDegreeofMasterofScienceByLiuFangSupervisor:Prof.YangTaiyouMay,2015摘要本研究以河南省鱸形目Perciformes魚類中烏鱧(Channaargus)、鱖魚(Sinipercachuatsi)和斑鱖(Sinipercascherzeri)的自然居群為研究對(duì)象,利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)其遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,旨在為河南省

4、鱸形目魚類種質(zhì)資源評(píng)價(jià)、保護(hù)、遺傳育種和可持續(xù)利用提供理論依據(jù)。主要結(jié)果如下:(1)利用正交設(shè)計(jì)試驗(yàn)方法,建立3種魚的ISSR-PCR最佳反應(yīng)體系。其中烏鱧的最佳反應(yīng)體系:25μl反應(yīng)體系中含60ng模板DNA,2.5mmol/LMg2+,0.3μmol/L引物,0.2mmol/LdNTPs,0.5UTaqDNA聚合酶;鱖魚和斑鱖的最佳反應(yīng)體系:25μl反應(yīng)體系中含80ng模板DNA,2mmol/LMg2+,0.4μmol/L引物,0.2mmol/LdNTPs,0.75UTaqDNA聚合酶。在此基礎(chǔ)上確立了烏鱧、鱖魚和斑鱖的ISSR-PCR的

5、最佳擴(kuò)增條件。(2)篩選出15個(gè)ISSR引物對(duì)丹江口水庫(kù)、淇河和南灣水庫(kù)3個(gè)烏鱧自然居群的基因組DNA進(jìn)行ISSR-PCR擴(kuò)增,共檢測(cè)到141個(gè)位點(diǎn),多態(tài)位點(diǎn)53個(gè),多態(tài)性比例為37.59%;利用POPGENE軟件分析其遺傳多樣性指標(biāo),其多態(tài)位點(diǎn)比例(PPB)分別為19.86%、25.53%和29.79%,觀測(cè)等位基因數(shù)(Na)分別為1.1986、1.2553和1.2979,有效等位基因數(shù)(Ne)分別為1.1239、1.1745和1.1976,Nei’s基因多樣度(h)分別為0.0712、0.0976和0.1123,Shannon’s信息指數(shù)

6、(I)分別為0.1057、0.1428和0.1653,平均遺傳距離(D)分別為0.0628、0.0800和0.1016。上述結(jié)果表明,河南省烏鱧居群的遺傳多樣性保持在一定水平,3居群的遺傳多樣性水平依次為南灣水庫(kù)居群>淇河居群>丹江口水庫(kù)居群?;赟hannon’s信息指數(shù)分析烏鱧居群的變異來(lái)源,23.14%存在于居群間,76.86%變異來(lái)源于居群內(nèi);基于Nei’s基因多樣性數(shù)據(jù)計(jì)算的居群間遺傳分化系數(shù)Gst為0.1984,居群間基因流Nm為2.0199,基因流水平較高。說(shuō)明烏鱧居群間在自然選擇的作用下發(fā)生了較大的遺傳分化,其遺傳分化主要來(lái)自

7、于居群內(nèi)。(3)用15個(gè)ISSR引物對(duì)南灣水庫(kù)和丹江口水庫(kù)2個(gè)鱖魚自然居群的基因組DNA進(jìn)行ISSR-PCR擴(kuò)增,共檢測(cè)到148個(gè)位點(diǎn),多態(tài)位點(diǎn)79個(gè),多態(tài)性比例為53.38%;2個(gè)鱖魚居群內(nèi)的PPB值分別為28.38%和27.70%,Na值分別為1.2838和1.2770,Ne值分別為1.2022和1.1507,h值分別為0.0896和0.1115,I值分別為0.1358和0.1615,平均D值分別為0.0818和0.0996。綜合分析上述結(jié)果表明,河南省鱖魚總居群的遺傳多1樣性較為豐富,居群內(nèi)的遺傳多樣性豐度也保持在較高水平,但低于總居群

8、水平,2居群的遺傳多樣性水平差別不大。利用Shannon’s信息指數(shù)分析居群的變異來(lái)源:47.09%存在于居群間,居群內(nèi)的遺傳變異占52.91%,說(shuō)明鱖魚遺傳分化在

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