大針茅響應羊啃食的轉錄組學分析

大針茅響應羊啃食的轉錄組學分析

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1、分巧號Q57學?;a10129UDC己77學號2013211047義走落嗦乂#碩±學位論文大針茅響應羊哨食的轉錄組學分析Thetranscrit;omeanalsisof況Z幻ra巧成文resonsetosheeeatinpy女各ppg申請人:李春瑞學位類別;工程碩±領域:生物工程指導教師:韓冰教授論文提交日期-:二〇五年六月巧蒙古農業(yè)大學研究生學位論文獨創(chuàng)聲明本人申明所呈交的學位論文是我本人在導師指導下進行的研究工作及取得的研究成果。據我所知,除了文中特別加L義標注和致謝的地方外

2、,論文中不包括其他人巴經發(fā)表或撰寫過的研究成果,也不包括為獲得我?;蚱渌逃龣C構的學位或證書而使用過的材料一同工作的同志對本研究所做的任何貢獻均已在,與我論文中作了明確的說明并表示謝意。一申請學位論文與資料若有不實之處,本人承擔切相關責任。〕.忘日期.b論文作者簽名:寺啼:?。ぃ牐埽崳妰让晒呸r業(yè)大學硏究生學位論文版權使用授權書本人完全了解內蒙古農業(yè)大學有關保護知識產權的規(guī)定:,巧研究生在攻讀學位期間論文工作的知識產權單位屬內蒙古農業(yè)大學。本人保證畢業(yè)離校后,發(fā)表論文或使用論文王作成果時署省單位為內蒙古農業(yè)大學,且導師為通訊作者

3、,通訊作者單位亦署名為內蒙古農業(yè)大學。學校有權保留并向國家有關部口或機構送交論文的復印件和電^公布學位論文的全部或部。1子文檔,允許論文被查閱和借閱學??蓙V分內容,采用影印、縮印或其他手段保存論文。(保密內容除外)論文作者簽《:凈秦蛛指導教師簽名:媒赤1曰^僅期:2i摘要大針茅(漢皆曰gran油?0,屬于針茅屬光芒組(iSecf.Ca護7/細曰6),是多年生密叢型旱生未本科牧草,主要分布于我國內蒙古中東部、東北、寧夏、甘肅和青海境內,由于其基生葉豐富且能很好的保存至冬春,因而是牲畜喜好也是非常重要的牧草之0,進行羊哨食

4、控制實驗2本研究^1大針茅為研究材料。對大針茅受到羊哨食后小時的DS(實驗組)與未哨食處理的大針茅DD(對照組)葉片做的高通量轉錄組測序(RNAsequences),對得到的轉錄組數據庫隨機挑選5個基因,運用實時夷光定量PCR手段對其表達量變化進行驗證。對轉錄組數據進行數據統(tǒng)計、差異表達基因分析、〇〇和〇〇〇功能分析,^及對轉錄組中的薦糖和淀粉代謝通路相關酶基1^因表達分析。對大針茅受到羊哨食后化、4h、8h、1化和24h和未哨食處理作為對照,分析類黃麗代謝通路中的5個關鍵基因甘、C甘/、護好、¥CL和化:¥甘,利用實時夷光定量PC民對其進行

5、相對表達量的測定。研究得到如下結果:1W羊哨食后的大針茅為材料,提取總RNA進行Ilhimina平臺的轉錄組測序,共得到147561個reads,組裝成64738條Unigenes,Unigenes平均長度為1367.2化口,N50為2017b,構建轉錄組數據庫p。25-隨機選取轉錄組數據庫中的個基因,萌發(fā)素類蛋白、葉綠素ab結合蛋白-3c-a、葉綠素ab結合蛋白2、酷氨酸激酶和松油醇合成酶,通過qRTPC民檢測,5個基因上下調趨勢與轉錄組測序結果相符,證明轉錄組測序結果可靠。3DS(實驗組)與DD(對照組)共有64199個基因表達,其

6、中DS與DD相比.,有49844個基因共同表達,占所有基因的7762%DS(;只在實驗組)中的表達基因有3273個,占所有基因的5.1%;只在DDC對照組)中的表達基因有11093<=>=如<=..i.個,占所有基因的1728%。轉錄組數據庫中滿足p001&&ratio2orro05()17513301914494的差異表達的基因共有個,其中上調的基因有個,下調的有個。'4類黃麗代謝通路中的5個基因C4町、0?/、巧5町、C化和化乂巿在24小時之,內均表現為在羊哨食處理的葉片中基因表達量下調;與類黃酬含量相關性分析表明,’’Fj5甘和斯

7、王為黃麗類化合物代謝通路中的關鍵調節(jié)酶。5羊哨食后大針茅中類黃麗的含量與對照組相比均有所下降,表明大針茅響應羊哨食次生代謝物質含量下降,與昆蟲哨食植物后的應微反應不同。關鍵詞:大針茅;羊哨食;轉錄組測序;實時夷光定量;類黃麗Thetranscritomeanalsisof汾'如ra巧cforesonsesheeeatinpygppgAbstract況少幻raMfi/5isadenseclu巧erteeren打ialherb,belo打i打to口gyppg

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