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《大針茅響應羊啃食的轉錄組學分析》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關內容在學術論文-天天文庫。
1、分巧號Q57學?;a10129UDC己77學號2013211047義走落嗦乂#碩±學位論文大針茅響應羊哨食的轉錄組學分析Thetranscrit;omeanalsisof況Z幻ra巧成文resonsetosheeeatinpy女各ppg申請人:李春瑞學位類別;工程碩±領域:生物工程指導教師:韓冰教授論文提交日期-:二〇五年六月巧蒙古農業(yè)大學研究生學位論文獨創(chuàng)聲明本人申明所呈交的學位論文是我本人在導師指導下進行的研究工作及取得的研究成果。據我所知,除了文中特別加L義標注和致謝的地方外
2、,論文中不包括其他人巴經發(fā)表或撰寫過的研究成果,也不包括為獲得我?;蚱渌逃龣C構的學位或證書而使用過的材料一同工作的同志對本研究所做的任何貢獻均已在,與我論文中作了明確的說明并表示謝意。一申請學位論文與資料若有不實之處,本人承擔切相關責任。〕.忘日期.b論文作者簽名:寺啼:?。ぃ牐埽崳妰让晒呸r業(yè)大學硏究生學位論文版權使用授權書本人完全了解內蒙古農業(yè)大學有關保護知識產權的規(guī)定:,巧研究生在攻讀學位期間論文工作的知識產權單位屬內蒙古農業(yè)大學。本人保證畢業(yè)離校后,發(fā)表論文或使用論文王作成果時署省單位為內蒙古農業(yè)大學,且導師為通訊作者
3、,通訊作者單位亦署名為內蒙古農業(yè)大學。學校有權保留并向國家有關部口或機構送交論文的復印件和電^公布學位論文的全部或部。1子文檔,允許論文被查閱和借閱學??蓙V分內容,采用影印、縮印或其他手段保存論文。(保密內容除外)論文作者簽《:凈秦蛛指導教師簽名:媒赤1曰^僅期:2i摘要大針茅(漢皆曰gran油?0,屬于針茅屬光芒組(iSecf.Ca護7/細曰6),是多年生密叢型旱生未本科牧草,主要分布于我國內蒙古中東部、東北、寧夏、甘肅和青海境內,由于其基生葉豐富且能很好的保存至冬春,因而是牲畜喜好也是非常重要的牧草之0,進行羊哨食
4、控制實驗2本研究^1大針茅為研究材料。對大針茅受到羊哨食后小時的DS(實驗組)與未哨食處理的大針茅DD(對照組)葉片做的高通量轉錄組測序(RNAsequences),對得到的轉錄組數據庫隨機挑選5個基因,運用實時夷光定量PCR手段對其表達量變化進行驗證。對轉錄組數據進行數據統(tǒng)計、差異表達基因分析、〇〇和〇〇〇功能分析,^及對轉錄組中的薦糖和淀粉代謝通路相關酶基1^因表達分析。對大針茅受到羊哨食后化、4h、8h、1化和24h和未哨食處理作為對照,分析類黃麗代謝通路中的5個關鍵基因甘、C甘/、護好、¥CL和化:¥甘,利用實時夷光定量PC民對其進行
5、相對表達量的測定。研究得到如下結果:1W羊哨食后的大針茅為材料,提取總RNA進行Ilhimina平臺的轉錄組測序,共得到147561個reads,組裝成64738條Unigenes,Unigenes平均長度為1367.2化口,N50為2017b,構建轉錄組數據庫p。25-隨機選取轉錄組數據庫中的個基因,萌發(fā)素類蛋白、葉綠素ab結合蛋白-3c-a、葉綠素ab結合蛋白2、酷氨酸激酶和松油醇合成酶,通過qRTPC民檢測,5個基因上下調趨勢與轉錄組測序結果相符,證明轉錄組測序結果可靠。3DS(實驗組)與DD(對照組)共有64199個基因表達,其
6、中DS與DD相比.,有49844個基因共同表達,占所有基因的7762%DS(;只在實驗組)中的表達基因有3273個,占所有基因的5.1%;只在DDC對照組)中的表達基因有11093<=>=如<=..i.個,占所有基因的1728%。轉錄組數據庫中滿足p001&&ratio2orro05()17513301914494的差異表達的基因共有個,其中上調的基因有個,下調的有個。'4類黃麗代謝通路中的5個基因C4町、0?/、巧5町、C化和化乂巿在24小時之,內均表現為在羊哨食處理的葉片中基因表達量下調;與類黃酬含量相關性分析表明,’’Fj5甘和斯
7、王為黃麗類化合物代謝通路中的關鍵調節(jié)酶。5羊哨食后大針茅中類黃麗的含量與對照組相比均有所下降,表明大針茅響應羊哨食次生代謝物質含量下降,與昆蟲哨食植物后的應微反應不同。關鍵詞:大針茅;羊哨食;轉錄組測序;實時夷光定量;類黃麗Thetranscritomeanalsisof汾'如ra巧cforesonsesheeeatinpygppgAbstract況少幻raMfi/5isadenseclu巧erteeren打ialherb,belo打i打to口gyppg