擬南芥轉(zhuǎn)錄因子GRAS家族基因群響應(yīng)滲透和干旱脅迫的初

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1、植物學(xué)報(bào)ChineseBulletinofBotany2009,44(3):290-299,www.chinbullbotany.comdoi:10.3969/j.issn.1674-3466.2009.03.005.研究報(bào)告.擬南芥轉(zhuǎn)錄因子GRAS家族基因群響應(yīng)滲透和干旱脅迫的初步探索1,3?2?2222221*2*郭華軍,焦遠(yuǎn)年,邸超,姚冬霞,張蓋華,鄭雪,劉嵐,張群蓮,郭藹光,蘇震123西北農(nóng)林科技大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,楊凌712100;中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)生物學(xué)院,北京100193;山西農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,太谷030801摘要GRAS家族是一類植物特有的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子,已有報(bào)道

2、表明該家族基因在植物生長(zhǎng)發(fā)育和光信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過程中具有重要作用。目前在擬南芥(Arabidopsisthaliana)基因組中已鑒定了33個(gè)GRAS家族基因。利用功能基因組學(xué)和生物信息學(xué)手段,通過基因芯片數(shù)據(jù)挖掘和基因功能預(yù)測(cè),對(duì)擬南芥GRAS家族基因在滲透和干旱脅迫過程中的應(yīng)答模式進(jìn)行了初步探索,提出了一類響應(yīng)滲透脅迫和干旱脅迫的擬南芥GRAS家族基因。以SCL13為例,利用基因芯片相關(guān)性和GO分析,對(duì)其在滲透脅迫信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過程中可能的調(diào)控機(jī)制進(jìn)行了預(yù)測(cè)和分析。這一研究將為闡明GRAS家族基因參與水分脅迫的分子機(jī)制提供新的思路,同時(shí)也為植物抗逆分子育種提供候選基因。關(guān)鍵詞

3、干旱脅迫,表達(dá)譜分析,GRAS家族基因,滲透脅迫,SCL13郭華軍,焦遠(yuǎn)年,邸超,姚冬霞,張蓋華,鄭雪,劉嵐,張群蓮,郭藹光,蘇震(2009).擬南芥轉(zhuǎn)錄因子GRAS家族基因群響應(yīng)滲透和干旱脅迫的初步探索.植物學(xué)報(bào)44,290-299.轉(zhuǎn)錄因子也稱反式作用因子,是能夠與真核基因啟物抗逆及在高等植物改良上的應(yīng)用均證明其在基因的表動(dòng)子區(qū)域中順式作用元件發(fā)生特異性相互作用的DNA達(dá)調(diào)控以及高等植物的整個(gè)生命過程中都起著關(guān)鍵作結(jié)合蛋白,通過它們之間以及與其它相關(guān)蛋白之間的相用。通過遺傳學(xué)和分子生物學(xué)研究,表明許多轉(zhuǎn)錄因子互作用,激活或抑制轉(zhuǎn)錄。在轉(zhuǎn)錄水平上與DNA發(fā)生及其基因

4、家族在響應(yīng)外界環(huán)境脅迫時(shí)起重要調(diào)控作用。相互作用的蛋白質(zhì)分子中,最具有多樣性的便是轉(zhuǎn)錄因改變這些轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)可以大大提高植物的抗性,說子。植物感受外界干旱、高鹽、激素、病害及體內(nèi)明轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控是保護(hù)植物免受外界環(huán)境影響的一個(gè)重細(xì)胞發(fā)育等信號(hào),通過一系列傳遞(鈣含量變化、第二信要調(diào)控機(jī)制。在轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控基因表達(dá)可以影響許多使、磷酸化和脫磷酸化等)激發(fā)轉(zhuǎn)錄因子(即反式作用因生命活動(dòng)過程,不同的基因表達(dá)常常通過不同的轉(zhuǎn)錄因子),反式作用因子與順式作用元件結(jié)合后,激活RNA聚子來(lái)控制,因此轉(zhuǎn)錄因子成為許多科學(xué)家研究的重點(diǎn)。合酶轉(zhuǎn)錄復(fù)合物,從而啟動(dòng)基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá),最后通過基植

5、物各類轉(zhuǎn)錄因子的作用主要與抗逆性和生長(zhǎng)發(fā)育調(diào)控因產(chǎn)物的作用對(duì)外界信號(hào)在生理生化等方面作出適合的有關(guān)(MartinandPaz-Ares,1997;Chenetal.,2002;Singh調(diào)節(jié)反應(yīng)(Chenetal.,2002;Singhetal.,2002;etal.,2002;ChenandZhu,2004;GuoandEcker,2004;Davulurietal.,2003;Matysetal.,2003;ChenandBroun,2004;Chenetal.,2005;Etheridgeetal.,2005;Zhu,2004;Broun,2004;Gray,2

6、005;Guoetal.,2005;Gray,2005;Kurataetal.,2005;Braam,2005;Kurataetal.,2005;Tsunoyama,2005;QuandZhu,Tsunoyama,2005;Maizel,2006;NardmannandWerr,2006;NardmannandWerr,2007;Balazadehetal.,2007;Tranetal.,2007;Balazadehetal.,2008)。從轉(zhuǎn)2008)。轉(zhuǎn)錄因子與植物生長(zhǎng)發(fā)育和形態(tài)建成、與植錄層面上來(lái)說,同一種脅迫可能會(huì)同時(shí)激活多條途徑(多個(gè)收稿日期:2008-11

7、-25;接受日期:2009-01-22基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金(No.90817006)?共同第一作者。*通訊作者。E-mail:zhensu@cau.edu.cn;guoaiguang@yahoo.com.cn郭華軍等:擬南芥轉(zhuǎn)錄因子GRAS家族基因群響應(yīng)滲透和干旱脅迫的初步探索291轉(zhuǎn)錄因子)。例如低溫、干旱可以誘導(dǎo)擬南芥2007;Laajanenetal.,2007;Leeetal.,2008;Fodeet(Arabidopsisthaliana)的CBF1(Stockingeretal.,1997)al.,2008;Gallagherand

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