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《雙翅目常見有瓣蠅類28SrRNA基因分子進(jìn)化與系統(tǒng)學(xué)研究》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、雙翅目常見有瓣蠅類28SrRNA基因分子進(jìn)化與系統(tǒng)學(xué)研究中文摘要雙翅目昆蟲是昆蟲綱中物種最豐富的類群之一,目前對其形態(tài)學(xué)、分類學(xué)、生態(tài)學(xué)、生理學(xué)、生物地理學(xué)等多方面進(jìn)行過研究。在分子系統(tǒng)學(xué)方面,國外研究者利用線粒體DNA(mtDNA)的Cytb、COI、COII和16SrRNA基因及核糖體的18SrRNA基因?qū)﹄p翅目部分類群進(jìn)行過系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的研究,我國在這方面的研究很少,而用28SrRNA基因序列對有瓣蠅類間的不同類群進(jìn)行分子系統(tǒng)學(xué)研究在國內(nèi)尚無報道。本研究以核糖體的28SrRNA基因作為分子遺傳標(biāo)記,用昆蟲28SrRNA基因的特異性引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增及DNA測序,獲得雙翅目有瓣
2、蠅類6科15種28SrRNA基因部分序列,并結(jié)合GenBank中登錄的5科6種有瓣蠅類昆蟲的28SrRNA序列片段組合成7科21種,進(jìn)行同源性比較,獲得692bp序列。利用分子生物學(xué)軟件進(jìn)行序列組成分析并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,從分子水平上對有瓣蠅類常見類群科間的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系進(jìn)行了研究,得到以下結(jié)果:1.在不包括外群在內(nèi)的所有種類的21條28SrRNA基因序列中,A+T平均含量為68.8%,G+C平均含量為31.2%,表現(xiàn)出A+T含量遠(yuǎn)高于G+C含量(有瓣蠅類7科21種:A=34.6%、T=34.296、C=12.996、G=18.3%),密碼子的堿基使用頻率存在明顯的偏向性。2.在所研究
3、的2l條28SrRNA基因序列中核苷酸的替換總體表現(xiàn)為轉(zhuǎn)換略高于顛換(轉(zhuǎn)換與顛換得比值R=1.1)。不同密碼子位點的核苷酸替換具有明顯的差異,轉(zhuǎn)換主要是T與C之間的轉(zhuǎn)換,而顛換主要是A與T之間。3.對有瓣蠅類7科21種蠅類用幾種建樹方法所產(chǎn)生的分子系統(tǒng)樹的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)大致相似,基本分為2大分支,麗蠅科的種類優(yōu)先相聚,再和寄蠅科、麻蠅科的種類相聚,反應(yīng)了這3科的親緣關(guān)系較近;蠅科與花蠅科相聚在一起,獨立為一枝,位于系統(tǒng)樹的基部;而廁蠅科和糞蠅科的種類與麗蠅科、寄蠅科和麻蠅科聚在了一起,這與目前的分類系統(tǒng)應(yīng)與蠅科和花蠅科相聚不一致,因此,這兩個科的歸屬問題值得商榷。4.運用28SrRNA基
4、因?qū)τ邪晗夘惒糠诸惾哼M(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進(jìn)行研究時發(fā)現(xiàn),該基因在解決科屬間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系是一個有效的分子標(biāo)記,但在解決屬以下階元之間的關(guān)系時存在一定不足。關(guān)鍵詞:雙翅目,有瓣蠅類,28SrRNA基因,系統(tǒng)發(fā)育,分子進(jìn)化MoIecuIarEVolutionandPhyIogeneticanalysiSofcommonCaIyptratae們ies(Insecta:Diptera)basedonpartiaISeqUenCeof28SrRNAgeneAbstractDipteraisoneofthemostspecies—rich鯽pofhsecta.DipterahaVebeenstud
5、ied肋m跚chfields弱Mo叩hology'Taxonomy,Ecology,Behavioral觚dBiogeo鯽hyetC.,nlephylogeneticrelationshipofDipterahavebeenstudiedbyusinggenesofCytb,COI,CoII柚d16SrRNAinmitochondrialD№~柚d18Sr】心姨inribosomalDNAbutthisfieldh弱aHttlestudiesinChina,whneinCalyptrat∞,studiesof28S㈣ge∞havenotbe叻dealt研thinCh血I.28Sr】
6、臥潑is∞eofmolecularmarke瑙whichusedin鋤inalmolecularphylogeneticstudies.Oneprimerpairsofi璐eCtwereusedt0amplifya_bout692bp’sscquenceof28Sr】RNAg∞e弱amolecularmarkert0analyzephylogeneticrelationsllipof21speCieswhichbelongtoCalyptrat神.Cuttingoffprimersequencesof5’鋤d3’,90tsegmentsof692bp.DNAsequenceswer
7、ealignedbyusingso腳are.Themolecularphylogenticn.eesweregot.IIleachtIee·buildingmethod,measuresofa190rithmsof∞VeralparametersofdistanCewereused,butallthetree—buildin筍showexadlythes鋤eresults,theresultsasf.0llows:1.28srRNAge∞sequenCes(692bp