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《基于加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的腫瘤中特異表達(dá)基因篩選方法研究》由會員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、分類號：密級：ＵＤＣ：編號：專業(yè)碩士學(xué)位論文基于加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的腫瘤中特異表達(dá)基因篩選方法研究碩士研究生：劉毅指導(dǎo)教師：趙新華副教授企業(yè)導(dǎo)師：王天高級工程師工程領(lǐng)域：控制工程論文主審人：哈爾濱工程大學(xué)２０１８年０６月分類號：密級：UDC：編號：專業(yè)碩士學(xué)位論文（工程碩士）基于加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的腫瘤中特異表達(dá)基因篩選方法研究碩士研究生：劉毅指導(dǎo)教師：趙新華副教授學(xué)位級別：工程碩士工程領(lǐng)域：控制工程所在單位：自動化學(xué)院論文提交日期：2018年5月論文答辯日期：2018年6月學(xué)位授予單位：哈爾濱工
2、程大學(xué)ClassifiedIndex:U.D.C:ADissertationfortheProfessionalDegreeofMaster（MasterofEngineering）ResearchonScreeningMethodsforSpecificExpressedGenesinTumorBasedonWeightedGeneCo-expressionNetworkCandidate:LiuYiSupervisor:AssociateProf.ZhaoXinHuaAcademicDegreeAppliedfor:MasterofEngi
3、neeringEngineeringField:ControlEngineeringDateofSubmission:May.2018DateofOralExamination:June.2018University:HarbinEngineeringUniversity摘要腫瘤是目前危害到生物體健康的疾病之一，威脅到生命有機(jī)體的生存，其發(fā)病的概率不低，我國的患病人數(shù)占到了全球總患病人數(shù)的一半。各種各樣類型的腫瘤都是由普通的細(xì)胞所轉(zhuǎn)變得到的，腫瘤是缺少了部分正常功能和擁有異常的流動性的細(xì)胞形成的?；蛴羞x擇性的表達(dá)導(dǎo)致了細(xì)胞存在各種各樣的表型，
4、與此同時，當(dāng)基因的表達(dá)出現(xiàn)異常情況時，這就為腫瘤細(xì)胞的產(chǎn)生提供了基礎(chǔ)。而基因的表達(dá)水平之間的差異能夠被檢測到，分析這些表達(dá)差異的基因，從中尋找到具有生物學(xué)意義的信息，為進(jìn)一步研究相關(guān)基因在腫瘤產(chǎn)生發(fā)展的過程中的發(fā)揮的作用提供了基礎(chǔ)，也為進(jìn)一步的治療疾病、挖掘基因靶點(diǎn)提供了線索。本文利用GEO（TheGeneExpressionOmnibus）數(shù)據(jù)庫編碼為GES5847基因表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)研究腫瘤組織與正?；|(zhì)細(xì)胞之間的表達(dá)差異，以此來研究這些差異在腫瘤發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮的作用和意義，期望對挖掘腫瘤的生物學(xué)過程有所幫助。加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析（Weig
5、htedgeneco-expressionnetworkanalysis,WGCNA）通過建立分子網(wǎng)絡(luò)的思想，利用不同組別基因表達(dá)的差別，把網(wǎng)絡(luò)中表達(dá)關(guān)聯(lián)程度高的基因分到同一個模塊中，挖掘出隱含在其中的信息。這里以腫瘤樣本和癌旁正常組織樣本中的基因表達(dá)作為數(shù)據(jù)信息，篩選出差異表達(dá)的基因做分析，得到8個基因模塊。在這個基礎(chǔ)上，將基因模塊和樣本的表型信息數(shù)據(jù)結(jié)合起來，從中挖掘出和腫瘤分期關(guān)聯(lián)程度高的基因模塊，并進(jìn)一步研究模塊內(nèi)部信息，挖掘出不僅僅和腫瘤分期關(guān)聯(lián)程度高而且在模塊內(nèi)部連接廣泛的特異表達(dá)基因26個，得到的特異表達(dá)基因在腫瘤的產(chǎn)生變異等過程
6、中發(fā)揮著不可忽視的影響，與細(xì)胞骨架、轉(zhuǎn)錄因子活性、RNA剪接活動密切相關(guān)?；诩訖?quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析方法得到的基因模塊進(jìn)行研究能夠發(fā)掘出隱含在其中的特異表達(dá)基因、重要的信號通路、基因之間的調(diào)控關(guān)系等，有利于進(jìn)一步揭開腫瘤的作用機(jī)理。關(guān)鍵詞：共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析；差異基因；基因模塊；分層聚類；無尺度分布；ABSTRACTTumorsareoneofthediseasesthatcurrentlyendangerthehealthoforganisms,andtheythreatenthesurvivaloflivingorganisms.Itsinci
7、denceisnotlow.Thenumberofpatientsinourcountryaccountsforhalfofthetotalnumberofpatientsintheworld.Varioustypesoftumorsaretransformedfromordinarycells.Tumorsareformedbycellsthatlacksomeoftheirnormalfunctions.Theselectiveexpressionofgenesresultsinavarietyofphenotypesincells.Whe
8、nabnormalexpressionofgenesoccurs,thisprovidesthebasisforthegenerationoftumo
