牡丹土壤細菌多樣性研究現(xiàn)狀及進展

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1、本科學(xué)生畢業(yè)論文(設(shè)計)題目學(xué)院專業(yè)學(xué)生姓名學(xué)號指導(dǎo)教師職稱論文字數(shù)完成日期年月日牡丹土壤細菌多樣性研究現(xiàn)狀及進展摘要:土壤細菌是土壤生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分,在土壤有機物質(zhì)分解和養(yǎng)分釋放、能量轉(zhuǎn)移等生物地化循環(huán)中起著重要作用。隨著人們對生物多樣性重要性認識的不斷深入及研究方法的不斷改進,土壤細菌多樣性,尤其是功能多樣性的研究工作逐漸受到生態(tài)學(xué)家的重視。本文從土壤細菌多樣性的影響因素以及研究方法等方面闡述了目前國內(nèi)外土壤細菌多樣性的研究現(xiàn)狀,并對其未來研究方向進行了展望。關(guān)鍵詞:土壤;細菌;多樣性;展望Thecurrentsituatio

2、nandprogressofpeonysoilbacterialdiversityAbstractSoilbacteriaareanimportantcomponentofsoilecosystem,soilorganicmatterdecompositionandnutrientrelease,energytransferandotherbiologicalgeochemicalcycleplaysanimportantrole.Withthedeepeningofthepeople'sunderstandingoftheimport

3、anceofbiodiversityandthecontinuousimprovementofresearchmethods,soilbacterialdiversity,especiallythefunctionaldiversityofresearchworkgraduallytotheattentionoftheecologist.Thisarticlefromtheinfluencefactorsofsoilbacterialdiversityandresearchmethodsathomeandabroadisexpounde

4、dtheresearchstatusofsoilbacterialdiversity,andthefutureresearchdirectionwasprospected.Keyword:soil;bacteria;diversity;prospected.目錄摘要2Abstract2一.研究方法2二.影響牡丹土壤細菌多樣性的因素32.1.牡丹本身32.2土壤類型32.3溫度和水分42.4管理方式4三.研究現(xiàn)狀5四.牡丹土壤細菌多樣性研究進展54.1新技術(shù)新方法的應(yīng)用。54.2各種研究方法有機結(jié)合。54.3對土壤細菌功能多樣性和功能群的

5、研究54.4將細菌多樣性與地區(qū)、區(qū)域及全球范圍的生態(tài)學(xué)動態(tài)分析結(jié)合起來。6致謝6參考文獻6一.研究方法隨生化、分子遺傳學(xué)和分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,一些全新的方法應(yīng)用于土壤細菌研究。這些新的方法對多樣性的分析提高到遺傳多樣性的水平上。有多種行之有效的分子生物學(xué)技術(shù)(ZhouJ.Z.a(chǎn)ndTiedje,1995;HolbenandJanssonetal.,1988)。除了分子雜交、16SrRNA序列分析外,常用的還有如RFLPs、RAPD、REP-PCR、ERIC-PCR等方法。這些分子基因技術(shù)能夠?qū)⒛切┮驗椴荒鼙慌囵B(yǎng)而不能用通常方法鑒定的生

6、物種類篩選出來。利用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴增16SrRNA的方法最常用到。由于16SrRNA基因比較保守,通過分析能夠基本反映土壤細菌的多樣性(WardandWeller,1990)。其方法步驟可簡單概括為,采集土壤樣品,在液氮中研磨,提取DNA,得到DNA粗提物,利用凝膠電泳加微型過濾柱或其他的方法進行純化。然后將純化的DNA作為進行聚合酶鏈反應(yīng)的模板,對目標DNA進行擴增放大并經(jīng)過電泳檢測。用限制性內(nèi)切酶對克隆產(chǎn)物進行消化,電泳分離,應(yīng)用分析軟件對電泳膠片進行分析,將相同的基因型聚合到一起,各不相同的基因型為惟一的基因型,每一個惟

7、一基因型為一個操作分類單位(OTU)。盡管這項技術(shù)不須進行特定生物體的描述,但要弄清楚環(huán)境中細菌的數(shù)量和聯(lián)系,特別是與已知序列的基因相似性。而且需要一個大的數(shù)據(jù)庫,也不適合數(shù)百個樣本的分析(Colwell.R.R.a(chǎn)ndD.L.Hawkworth,RFLPs即限制性片段長度多態(tài)性。最早Grodzicker用在adenoviyuses溫度敏感株的突變基因上。其做法一般是通過限制性內(nèi)切酶識別雙鏈DNA分子中的特定序列,并在特定位點將DNA切開。各種原因造成的DNA的微小改變會造成限制性內(nèi)切酶識別序列的改變,即消除和產(chǎn)生新的特定酶切位點。另外

8、,大片段的缺失或轉(zhuǎn)移也會造成某些酶切條帶的改變。這樣對兩個個體的DNA分子特定的酶就會在DNA不同的位點切割,DNA分子酶解后,形成不同長度的DNA片段。這些大小不等的片段通過凝膠電泳時會形成不同的帶。用分

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