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1、1.首先需要明確,DEPC(焦碳酸二乙酯)是一種油狀液體,跟水難容。故配置時(shí)室溫通風(fēng)櫥中完成,常常需要放置過夜。DEPC在高壓下會(huì)分解為CO2和乙醇,所以,如果你的DEPC水是用來處理實(shí)驗(yàn)器具的,就不能高壓;如果你的DEPC水是用來配制試劑的,那么你就可以高壓。不過不管你配制DEPC水的目的是什么,在配制DEPC水時(shí)的雙蒸水都不需要高壓滅菌,因?yàn)榧幢闶悄阌脕硖幚砥骶撸谂葸^DEPC水之后還必須要經(jīng)過高壓滅菌滴。泡實(shí)驗(yàn)器具的DEPC水的配制(0.1%):1000ml雙蒸水中加1mlDEPC,放在1
2、000ml容量瓶中靜置4小時(shí)后或過夜備用。保存方法:封閉冷藏備用。最好分裝小瓶來用,盡量避免污染。畢竟搞一次也不容易。配試劑的DEPC水的配制(0.1%):100ml鹽水瓶內(nèi)裝40ml雙蒸水,加40ulDEPC,37℃過夜,高壓處理121c,25minDEPC分解成二氧化碳和酒精,封閉冷藏備用。最好分裝小瓶來用,盡量避免污染。搞一次也不容易。2.焦碳酸二乙酯(DEPC)DEPC即diethylpyrocarbonate。分子式為C6H10O5,分子量為162.14,無色、澄清透明的液體。是一種強(qiáng)
3、烈但不徹底的RNA酶抑制劑。它通過和RNA酶的活性基團(tuán)組氨酸的咪唑環(huán)結(jié)合使蛋白質(zhì)變性,從而抑制酶的活性。DEPC可以抑制植物細(xì)胞上的NSCC,是常用的NSCC抑制劑.DEPC毒性1.DEPC(diethypyrocarbonate,焦碳酸二乙酯)是一種高效烷化劑。DEPC不穩(wěn)定,在水溶液中會(huì)分解成乙醇和二氧化碳,155℃時(shí)也會(huì)分解。DEPC遇到氨水會(huì)發(fā)生反應(yīng)產(chǎn)生氨基甲酸乙酯。2.DEPC有刺激性,對(duì)眼睛和氣道粘膜有強(qiáng)刺激,在操作中應(yīng)盡量在通風(fēng)的條件下進(jìn)行,DEPC毒性并不是很強(qiáng),但吸入的毒性是最
4、強(qiáng)的,使用時(shí)戴口罩,不小心沾到手上注意立即沖洗。3.DEPC是一種潛在的致癌物質(zhì),主要是能生成乙酯基衍生物和乙酯類衍生物,其中尿烷是一種已知的致癌物質(zhì)。DEPC在水中的半衰期:25℃、磷酸緩沖液中其半衰期為4min(pH6)、9min(pH7)。Tris緩沖液中DEPC的降解會(huì)加快,25℃時(shí),半衰期為1.25min(pH7.5)、0.37min(pH8.2)。DEPC加入到水中之后并不會(huì)立即溶解,而是形成小的球狀液滴(類似于油滴),需要徹底攪拌直至液滴消失才算混合均勻。此時(shí)的溶液才可以拿去高溫除
5、菌除DEPC。一般滅菌15min即可將DEPC徹底除去。(試驗(yàn)所用試劑也可用DEPC處理,加入DEPC至0.1%濃度,然后劇烈振蕩10分鐘,再煮沸15分鐘或高壓滅菌以消除殘存的DEPC,否則DEPC也能和腺嘌呤作用而破壞mRNA活性。)配置加0.1%DEPC到去離子水中,混勻過夜,然后高溫高壓121℃,20min,DEPC即降解成二氧化碳和水,無毒。用途DEPC是一種有效的核酸酶抑制劑,它能夠與很多酶的-NH,-SH或-OH等基團(tuán)發(fā)生反應(yīng),從而破壞酶的活性位點(diǎn)。一般,常用濃度為0.1%(1L水中
6、加入1mLDEPC)的DEPC來作為RNA酶的抑制劑。比如,進(jìn)行RNA實(shí)驗(yàn)時(shí),要用DEPC處理實(shí)驗(yàn)所用的水和各種溶液。我們通常所說的DEPC(處理)水是指用DEPC處理過并經(jīng)高溫高壓消毒的MiliQ純水。DEPC(處理)水可以用于RNA沉淀的溶解,含有RNA的各種反應(yīng)體系如反轉(zhuǎn)錄、siRNA的退火等,以及其它各種要求無RNase、DNase和proteinase的反應(yīng)體系。使用注意事項(xiàng)1、DEPC可能溶解掉某些塑料槍頭,因此,量取DEPC時(shí)要用玻璃器具。2、DEPC處理后的溶液要去除殘余的DEP
7、C,一般121℃滅菌15min即可,也可以將其煮沸15min以達(dá)到去除的效果??赡軙?huì)殘留些許氣味,可以放心使用。3、因?yàn)镈EPC在Tris、HEPES等緩沖液中極易分解,因此不能直接用DEPC來處理Tris、HEPES等緩沖液。這種情況下,要先用DEPC處理水,然后再用DEPC處理過的水來配制緩沖液。4、AlthoughH2OpreparedwithreverseosmosissystemslikeMilli-QisfreeofRNases,itcanbecontaminatedbymicrob
8、ialgrowthifthemachineandpipingarenotwellmaintained.Thisisespeciallyproblematicincentralisedwatersystemswithmetresofpiping.5、ThefruitysmellcomingfromageingDEPC-containingsolutionsstemsfromtheestersthataregeneratedwhenethanolproducedfromhydrolysisreact