SSR分子標(biāo)記技術(shù)在生物遺傳學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用

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1、萬(wàn)方數(shù)據(jù)安徽農(nóng)業(yè)科學(xué)。JournalofAnhuiAgn．Sci．2012，40(2)：640—642責(zé)任編輯朱瓊瓊責(zé)任校對(duì)盧瑤SSR分子標(biāo)記技術(shù)在生物遺傳學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用楊文柱1，焦燕孫(1．內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院，內(nèi)蒙古呼和浩特010019；2．內(nèi)蒙古師范大學(xué)化學(xué)與環(huán)境科學(xué)學(xué)院，內(nèi)蒙古呼和浩特010022)摘要$SR(sirepiesequencerepeats)分子標(biāo)記技術(shù)作為一種新世紀(jì)遺傳學(xué)研究工具，已被廣泛應(yīng)用于生物遺傳多樣性、遺傳圖譜構(gòu)建、基因定位、分子標(biāo)記輔助育種、種質(zhì)真?zhèn)魏图兌辱b定等研究中，成為生物資源利用、開(kāi)發(fā)和保護(hù)常用

2、的方法和技術(shù)。關(guān)鍵詞SSR；分子標(biāo)記；生物遺傳學(xué)；應(yīng)用中圖分類號(hào)Q756文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼A文章編號(hào)0517—6611(2012)02一00640—03ApplicationofSSRMolecularMarkerTechniqueintheFieldofBiogeneticsYANGWen-zhuetal(CollegeofAgronomy，InnerMongoliaAgriculturalUniversity，Hohhot，InnerMongolia010019)AbstractAsageneticresearchtoolinthene

3、wcentury，SSRmolecularmarkerstechniquehasbeenwidelyadoptedintheresearchondiversityofbiogeneties，constructionofthegeneticlinkagemap，locationofgenes，molecularmark—assistedselectionandpuritycontrollingofeultivars，ithasbeencommonlyusedfortheutilization，developmentandprotect

4、ionofbiologicalresources．KeywordsSSR；Molecularmarker；Biogenetics；Application簡(jiǎn)單重復(fù)序列(simplesequencerepeats，SSRs)又稱短串聯(lián)重復(fù)序列(shorttandemrepeats，STRs)或微衛(wèi)星DNA(Mi—crosatelliteDNA)，主要由串聯(lián)重復(fù)單元組成，每個(gè)單元長(zhǎng)度一般在1～6bp之間。1989年，Litt和Luty擴(kuò)增到了人類基因組SSR序列，并把這種序列正式定義為微衛(wèi)星(microsat—dire)’1J。目前常用的

5、分子標(biāo)記有SSR、RAPD、AFLP、RFLP等。后兩者操作較復(fù)雜，而RAPD穩(wěn)定性和重復(fù)性較差。SSR與它們相比，具有穩(wěn)定可靠、操作簡(jiǎn)單等優(yōu)點(diǎn)。1SSR標(biāo)記概述1．1SsR標(biāo)記膽oSSR標(biāo)記是當(dāng)今流行的分子標(biāo)記技術(shù)之一。盡管SSR分布于基因組的不同位置，但其兩端多是保守的單拷貝序列，因此可以根據(jù)兩端的序列設(shè)計(jì)一對(duì)特異引物，通過(guò)PCR技術(shù)將其擴(kuò)增出來(lái)，利用電泳分析技術(shù)獲得長(zhǎng)度多態(tài)性，即SSR標(biāo)記。1．1．1SSR的分布。3o。SSR廣泛存在于真核生物基因組中，少數(shù)原核生物基因組中也有。真核生物基因組中SSR的分布是隨機(jī)的，大約每隔1

6、0～50kb就有1個(gè)SSR。它既可以存在于內(nèi)含子中，又可存在于外顯子中。在不同的生物體間，SSR的數(shù)量、重復(fù)次數(shù)和單位、拷貝數(shù)變異及染色體分布等有著很大的差別。在真核生物基因組中，二核苷酸微衛(wèi)星序列最豐富，三核苷酸微衛(wèi)星的含量比二核苷酸低約10倍，而四核苷酸微衛(wèi)星序列則相對(duì)較少。在植物基因組中(AT)。最多。1．1．2SSR標(biāo)記的主要特點(diǎn)。SSR分子遺傳標(biāo)記總體來(lái)講分為單位點(diǎn)分子遺傳標(biāo)記和多位點(diǎn)分子遺傳標(biāo)記。當(dāng)前提到的SSR遺傳標(biāo)記一般是指單位點(diǎn)分子遺傳標(biāo)記，其特點(diǎn)主基金項(xiàng)目國(guó)家自然科學(xué)基金(41165010)；國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展

7、計(jì)劃973項(xiàng)目(2007CBl06806)；國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開(kāi)放課題研究項(xiàng)目(LAPC．KF-2008-03)。作者簡(jiǎn)介楊文柱(1977一)，男，內(nèi)蒙古呼和浩特人，碩士研究生，研究方向：甜菜生理與分子生物學(xué)，E．mail：yangwzh@imnu．edu．cn。t通訊作者，副教授，博士，從事溫室氣體與全球變化方面的研究，E．mail：jiaoyan@imnu．edu．cn。收稿日期201l-10-18要有Ho：(DSSR引物能直接從已發(fā)表的文獻(xiàn)資料或查找近緣種SSR引物來(lái)獲得，也能夠使用經(jīng)典的分子生物學(xué)方法克隆，可節(jié)約大量的時(shí)間和精力

8、；②在分子遺傳學(xué)的研究中，相對(duì)來(lái)說(shuō)，SSR分子標(biāo)記容易擴(kuò)增，且大多都有相應(yīng)的軟件支持系統(tǒng)，使得微衛(wèi)星分析變得更加容易；③檢測(cè)手段簡(jiǎn)單，規(guī)模小，可以進(jìn)行非損傷取樣且可在無(wú)放射性的實(shí)驗(yàn)室中進(jìn)行；④試驗(yàn)的重復(fù)性高，便于進(jìn)行數(shù)據(jù)比較；⑤不同等