赤麂線粒體全基因組測(cè)序與比較進(jìn)化分析

赤麂線粒體全基因組測(cè)序與比較進(jìn)化分析

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1、英文摘要COWandsheep),thephylogenetictreewasconstructedbasedontheirconcatenatedscqtlonccsof3protein-codinggenes.Theresultsshow:@thosespeciesaredividedinto3cladeswhichareamuntjak—sheep—COWclade,apig—alpacacladeandahippopotamus—whaleclade;Qthedivergencebetweenthemuntjaka

2、ndsheeplineagesoccurredat14.7millionyearsagoandthedivergencebetweenthemuntjakandCOWlineagesoccurredat16.0millionyearsago;@thereisacloserrelationshipbetweenmuntjakandsheepthanthatbetweenmuntjakandCOW.[Keywordslmuntjak,Mitochondrialgenome,Phylogeneticrelationshipres

3、earch主旦查至生墅蔞——符號(hào)、變量、縮略詞等本論文專用術(shù)語的注釋表縮寫詞ATPbpCOXCRCvtBD·loopkbMDⅪMEMPmtDNAMYBPND加AHNJPCRRFLPrRNATmtRNAUPGMA英文蛆PsynthaseFOsubunitbasepairsCytochromeoxidasesubunitControlregeionCytochromebDisplacementLoopkilobasepairsMultidrugresistantMinimumEvolutionMaximumParsimonym

4、ethodMitochondrialDNAmillionyearsbeforepresentNADHdehydrogenasesubunitNeighbor-joiningmethodPolymeraseChainReactionRestrictionFragmentLengthPolymorphismRibosomalRNAmeltingtemperatureTransferRNAgeneUnwei【ghtedPairGroupMethodwithArithmaticMearlVlI中文ATP合成酶亞基堿基對(duì)細(xì)胞色素氧化

5、酶業(yè)璀控制區(qū)/D—loop區(qū)細(xì)胞色素B編碼基因D—loop區(qū)/控制區(qū)千堿基對(duì)多藥耐藥基因最小進(jìn)化法最大簡(jiǎn)約性法線粒體DNA百萬年自Ⅱ脫氫酶亞基鄰位相連法聚合酶鏈反應(yīng)限制性內(nèi)切酶圖譜核糖體RNA基因解鏈溫度轉(zhuǎn)運(yùn)RNA基因非加權(quán)成刈中均數(shù)法倘i十義虬劉t上前言日!J舌線粒體基因組(Mitochondrialgenome)是共價(jià)閉合的雙鏈DNA,大小在16.5kb左手^每個(gè)細(xì)胞有1000~10000個(gè)拷貝,線粒體基因組結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單穩(wěn)定,很少受到序列甄排的影?,并呈母系遺傳,由于這些特點(diǎn)線粒體基因組成為研究分子進(jìn)化的重要手段flll2

6、1。同時(shí)隨著分j7牛物學(xué)和生物信息學(xué)的發(fā)展,大片斷序列的測(cè)序和序列分析已比較容易實(shí)現(xiàn),因而利用線粒體序列研究進(jìn)化關(guān)系的方法得到越來越多研究者的青睞。赤麂(Muntiacusmuntja_j})是鹿科(Cervidae)麂亞科(Muntiacinae)動(dòng)物,主要分布在尼泊爾、錫金、印度東北部、緬甸西部和我國(guó)云南地區(qū)及華南、東南和西南部分地區(qū)【3】,是體型最大的一種麂,同時(shí)也是目前已知的哺乳動(dòng)物中染色體最少的動(dòng)物,其核型為2n=6早,7d【4】。國(guó)內(nèi)自70年代以來有眾多實(shí)驗(yàn)室用赤麂細(xì)胞株研究細(xì)胞周期、染色體進(jìn)化及遺傳毒理,是公

7、認(rèn)的一種模式動(dòng)物‘31’而赤麂的起源和進(jìn)化關(guān)系一直是令人迷惑而又是個(gè)很有意義的研究課題15]【6I。前人已經(jīng)從考古學(xué)‘w、分支分類學(xué)‘81、細(xì)胞遺傳學(xué)【q1、mtDNA多念性‘101等多力’?做過川究,但難以得到一致的結(jié)論。也有些學(xué)者利用線粒體部分序列(如Ctyb、12SrRNA等)對(duì)麂屬動(dòng)物做過進(jìn)化研究?】,但由于信息量太少,所以得出的結(jié)論也有限‘12】,如要得出更準(zhǔn)確的結(jié)論還需要更多的線粒體序列信息?;诖宋覀儨y(cè)定了小麂的線粒體全基因組之后又測(cè)定了赤麂的線粒體全基因組并進(jìn)行了基因定位和序列分析,并利用GenBm3k得到

8、一些物種的線粒體序列。我們討論了赤麂在麂亞科、鹿科、鯨偶蹄類中進(jìn)化地位以及其他相關(guān)物種的進(jìn)化關(guān)系,以期為麂亞科動(dòng)物資源保護(hù)提供基礎(chǔ)資料,為鹿科動(dòng)物及鯨偶蹄類動(dòng)物遺傳多樣性提供科學(xué)依據(jù)。東南入學(xué)碩士學(xué)位論文赤麂進(jìn)化地位研究進(jìn)展文獻(xiàn)綜述關(guān)鍵詞:赤麂,線粒體基因組,進(jìn)化分析摘要:麂亞科動(dòng)物赤麂由于_是目前已知

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