分子診斷學(xué)筆記

分子診斷學(xué)筆記

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1、[1]原核生物基因組原核生物主要包括、細(xì)菌、支原體、立克次體、衣原體、螺旋體、放線菌、藍(lán)綠藻等有關(guān)質(zhì)粒按質(zhì)粒的功能分類:致育質(zhì)粒F質(zhì)粒)編碼性菌毛,介導(dǎo)細(xì)菌Z間的接合傳遞;耐藥性質(zhì)粒R質(zhì)粒)編碼細(xì)菌對(duì)抗菌藥物或巫金屬鹽類的耐藥性;毎力質(zhì)粒Vi質(zhì)粒)編碼與該菌致病性有關(guān)的毎力因子;細(xì)菌素質(zhì)粒編碼細(xì)菌產(chǎn)生細(xì)菌素;代謝質(zhì)粒編碼產(chǎn)牛:相關(guān)的代謝酶。按復(fù)制機(jī)制分類:1、嚴(yán)緊控制型拷貝數(shù)少,一般〈10個(gè),分子量大;調(diào)節(jié)因子是蛋白質(zhì),復(fù)制受限,受染色體IKA復(fù)制系統(tǒng)的控制;嚴(yán)謹(jǐn)控制機(jī)理(低拷貝原因),認(rèn)為是該質(zhì)粒可以產(chǎn)生阻遏蛋白

2、,反饋抑制£1身DNA合成。2、松弛控制型拷貝數(shù)多,10-200個(gè),分子量??;調(diào)節(jié)因子是RNA,復(fù)制不受染色體DNA復(fù)制系統(tǒng)限制基因T程使用松弛型(高拷貝數(shù))質(zhì)粒,以獲得較多的基因產(chǎn)物。性質(zhì):1、轉(zhuǎn)移性:可以通過轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)導(dǎo)或接合作用而由一個(gè)細(xì)菌細(xì)胞轉(zhuǎn)移到另一個(gè)細(xì)菌細(xì)胞中,使兩個(gè)細(xì)胞都成為帶有質(zhì)粒的細(xì)胞;質(zhì)粒轉(zhuǎn)移時(shí),它可以單獨(dú)轉(zhuǎn)移,也可以攜帶著染色體(片段)一起進(jìn)行轉(zhuǎn)移,所以它可成為基因工程的載體。2、質(zhì)粒具有選擇性標(biāo)記:質(zhì)粒有抗藥性基I人1、營養(yǎng)缺陷型基因、抗重金屈鹽基因等多種選樣性標(biāo)記;3、質(zhì)粒的不相容性:同一類

3、群的不同質(zhì)粒-?般不能在同一菌株內(nèi)穩(wěn)圧共存;4、自主復(fù)制性:能獨(dú)立于宿主染色體DNA外獨(dú)立復(fù)制(但也必須在宿主細(xì)胞內(nèi)才能復(fù)制);質(zhì)粒己成為分子克隆的有用工具,是目的DNA的載體。載體質(zhì)粒人多是在天然質(zhì)?;A(chǔ)上經(jīng)人工構(gòu)建而成,質(zhì)粒的一些特點(diǎn):1、有限制性核酸內(nèi)切酶單一切口,可用以重紐外源DNA;2、有篩選標(biāo)記,如抗藥基因等;3、插入外源DNA后,仍能轉(zhuǎn)化宿主細(xì)胞,并能復(fù)制。質(zhì)?;蜣D(zhuǎn)移的方式:1、接合作用當(dāng)細(xì)胞與細(xì)胞、或細(xì)菌通過菌毛相互接觸時(shí),質(zhì)粒DA從一個(gè)細(xì)胞(細(xì)菌)轉(zhuǎn)移至另一細(xì)胞(細(xì)菌)的DNA轉(zhuǎn)移稱為接合作用

4、2、轉(zhuǎn)化作用通過自動(dòng)獲取或人為地供給外源DM,使細(xì)胞或培養(yǎng)的受體細(xì)胞獲得新的遺傳表型,稱為轉(zhuǎn)化作用3、轉(zhuǎn)導(dǎo)作用當(dāng)病毒從被感染的(供體)細(xì)胞釋放出來、再次感染另一(受體)細(xì)胞時(shí),發(fā)生在供體細(xì)胞與受體細(xì)胞Z間的DNA轉(zhuǎn)移及基因重組即為轉(zhuǎn)導(dǎo)作用4、轉(zhuǎn)染作用通過感染方式將外來DNA引入宿主細(xì)胞,并導(dǎo)致宿主細(xì)胞遺傳性狀改變的過程稱為轉(zhuǎn)染(transfection)。轉(zhuǎn)染是轉(zhuǎn)化的一種特殊形式。完整的病毒顆粒包括:衣殼、基因組(DNA或RA)、被膜、病毒顆粒中的其他內(nèi)容物病毒分段基因組:流感病毒屬分段R7A病毒意義:a)降低包

5、裝壓力b)降低了造成斷裂的可能性,提高編碼能力c)有分段基因組的病毒一般感染效率較低,只有全部基因組核酸片段存在時(shí),病毒才具有感染能力。植物病毒d)由于分段基因組易發(fā)生重組,故病莓容易變異。病毒基因紐?特點(diǎn):1、5'的帽子和3,的poly(A)尾結(jié)構(gòu)2、末端重復(fù)序列結(jié)果:粘性末段、止/反向互補(bǔ)序列、長末端重復(fù)序列;3、高效基因組:排列緊密很少間隔區(qū),不僅非編碼用列少,而且冇重蔭基因的存在;4、分段基因組:易重組,是病毒易變異的原因。真核生物基因組染色體的包裝:(1)染色體的一級(jí)結(jié)構(gòu)一核小體(2)染色體的二級(jí)結(jié)構(gòu)一螺

6、線管(3)染色體的三級(jí)結(jié)構(gòu)一超螺線管(4)染色體的四級(jí)結(jié)構(gòu)一染色單體真核生物染色體基因組一般特征1、真核生物的基因組比餃龐大;2、線性雙鏈DNA和二倍體;3、真核細(xì)胞基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為單順反子。4、存在重復(fù)序列,覓復(fù)次數(shù)可達(dá)百萬次以上5、基因是不連續(xù)的(斷裂基因)重復(fù)序列:指多拷貝的相同或近似序列的DNA片段一、高度重復(fù)序列,按其結(jié)構(gòu)特點(diǎn)分為三種:1、反向重復(fù)序列2、衛(wèi)星DNA山于這類用列的堿基組成不同于具他部份,可用等密度梯度離心法將具巧主體DNA分開,I大I而稱為衛(wèi)星DMA(或隨體DNA)3、較復(fù)雜的重復(fù)單位組成的

7、重復(fù)順序二、中度重復(fù)順序:依據(jù)重復(fù)順序的長度,中度重復(fù)順序可分為:短散布元件和氏散布元件Alu家族:是哺乳動(dòng)物基因組屮含量最豐富的一種屮度重復(fù)順序家族(短分散元件),Alu家族毎個(gè)成員的長度約300bp,每個(gè)單位長度屮有一個(gè)限制性內(nèi)切酶AluI的切點(diǎn)(AGICT),Alu可將其切成長130和170bp的兩段,因而定名為Alu序列(或Alu家族)線粒體DNA的遺傳特性:母系遺傳、突變率高、異質(zhì)性、閾值效應(yīng)、半自助復(fù)制與協(xié)同效應(yīng)閾值效應(yīng):mtDNA突變導(dǎo)致氧化磷酸化水平降低,半突變的mtDNA達(dá)到一定比例時(shí),使得線粒體

8、總的能量供應(yīng)降低到維持組織止常功能所需能量的最低值時(shí),才可能引起某組織或器官的功能異常而出現(xiàn)臨床癥狀。DNA分子多態(tài)性的主耍方式:微衛(wèi)星DNA多態(tài)性(同一位點(diǎn)不同個(gè)體之間有不同長度的微衛(wèi)星DNA,STR)、單個(gè)核昔酸的變界一單核昔酸多態(tài)性(SNP)等1、微衛(wèi)星DNA乂稱短串聯(lián)覓復(fù)STR,指以1—6個(gè)堿皋為核心單位串聯(lián)重復(fù)血成的一類序列。微衛(wèi)星DNA結(jié)構(gòu)用列山

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