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《2012_2013年新流行豬偽狂_省略_及其gE_TK_gD基因序列分析_余秋穎.pdf》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫(kù)。
1、中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào)2014年10月第34卷第10期ChinJVetSciOct.2014Vol.34No.1015732012-2013年新流行豬偽狂犬病病毒的分離鑒定及其gE、TK、gD基因序列分析*,明星,鄭關(guān)民,張玉娟,韓莎,王川慶(河南農(nóng)業(yè)大學(xué)牧醫(yī)工程學(xué)院,余秋穎,常洪濤,陳文定,陳陸河南鄭州450002)摘要:2012年伊始,豬偽狂犬病(pseudorabies,PR)在河南省部分地區(qū)再次暴發(fā)。為探尋其中緣由,對(duì)2012年3月至2013年6月間采集的疑似PR病料接種Vero細(xì)胞并經(jīng)PCR鑒定,分離到4株偽狂犬病病毒(pseudorabies
2、virus,PRV)。同時(shí)對(duì)該4株病毒的gE、TK和gD基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增、克隆、測(cè)序及分析。序列分析顯示:4株PRV河南分離株的gE、TK、gD基因有些核苷酸及氨基酸發(fā)生變化,不同于參考毒株;遺傳進(jìn)化分析顯示:4株PRV河南分離株形成單獨(dú)1個(gè)小亞群,與中國(guó)其他地區(qū)分離株之間的親緣關(guān)系較近,與歐洲、南美洲分離株之間的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),推測(cè)此4株河南分離毒株是新型國(guó)內(nèi)流行株。關(guān)鍵詞:偽狂犬病病毒;分離鑒定;gE、TK、gD基因;序列分析中圖分類(lèi)號(hào):S852.65文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A文章編號(hào):1005-4545(2014)10-1573-06Isolatio
3、nandidentificationofpseudorabiesvirusprevailingfrom2012to2013andsequenceanalysisofgE,TK,gDgene*,MINGXing,ZHENGGuan-min,YUQiu-ying,CHANGHong-tao,CHENWen-ding,CHENLuZHANGYu-juan,HANSha,WANGChuan-qing(CollegeofAnimalHusbandryandVeterina-ryMedicine,HenanAgriculturalUniversity,Zh
4、engzhou450002,China)Abstract:Pseudorabies(PR)hasre-emergedwithdevastatingimpactinHenansinceearly2012.Toinvestigateandanalyzethereasonofthisoutbreak,fourstrainsofpseudorabiesvirus(PRV)wasi-solatedfromPRVsuspectedtissuesfromdifferentareasofHenanduringMarch2012toJune2013through
5、passagesinVerocell.ThegE,TKandgDgenesofPRVisolates,wereamplifiedbypoly-merasechainreaction,cloned,sequenced,andanalyzed.SequenceanalysisshowedthatthegE、TKandgDgenesoffourPRVisolatesfromHenanhadspecificchangesofnucleotidesandaminoacidswhichweredifferfromthereferencePRVstrains
6、;phylogeneticanalysisrevealedthatfourstrainsofPRVisolateswereespeciallycloselyrelatedtootherstrainsfromChina,butdiffergeneticallyfromEuropeanandSouthAmericastrains.Theseresultsdemonstratedthatthefourstrainsofiso-lateswerenewPRVprevailingstrainsinHenan.Keywords:pseudorabiesvi
7、rus(PRV);isolationandidentification;gE-gene,TK-gene,gD-gene;se-quencinganalysis*Correspondingauthor,E-mail:chenluhau@126.com[2]偽狂犬病病毒(pseudorabiesvirus,PRV)屬于G+C含量高達(dá)73%?;蚪M由獨(dú)特長(zhǎng)區(qū)段皰疹病毒科α-皰疹病毒亞科,又稱(chēng)豬皰疹病毒I(UL)、短區(qū)段(US)、及短區(qū)段2側(cè)的末端重復(fù)序列[1]型。PRV基因組為線狀雙鏈DNA,長(zhǎng)約143kb,(TR)和內(nèi)部重復(fù)序列(IR)組成,基因組
8、可編[3]碼70~100種蛋白。gE和TK基因均是PRV的收稿日期:2013-10-29主要毒力基因和病毒增殖的非必需基因,編碼的蛋基金項(xiàng)目:國(guó)家自然