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《轉錄組學主要技術和其應用研究》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關內容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、轉錄組學主要技術及其應用研究姓名:梁迪專業(yè):微生物學年級:2013學號:3130179二零一四年六月十五日轉錄學主要技術及其應用研究摘要:轉錄組(transcriptome)是特定組織或細胞在某一發(fā)育階段或功能狀態(tài)下轉錄出來的所有RNA的集合。轉錄組學研究能夠從整體水平研究基因功能以及基因結構,揭示特定生物學過程以及疾病發(fā)生過程中的分子機理。目前,轉錄組學研究技術主要包括兩種:基于雜交技術的微陣列技術(microarray)和基于測序技術的轉錄組測序技術,包括表達序列標簽技術(ExpressionSequenceTagsTechnology,EST)、基
2、因表達系列分析技術(Serialanalysisofgeneexpression,SAGE)、大規(guī)模平行測序技術(Massivelyparallelsignaturesequencing,MPSS)、以及RNA測序技術(RNAsequencing,RNA-seq)。文章主要介紹了以上轉錄組學主要研究技術的原理、技術特點及其應用,并就這些技術面臨的挑戰(zhàn)和未來發(fā)展前景進行了討論,為其今后的研究與應用提供參考。關鍵詞:轉錄組學;微陣列技術;轉錄組測序技術;應用Studyonthemaintechnologiesoftranscriptomicsandtheir
3、applicationAbstract:Thetranscriptomeisthecompletesetoftranscriptsforcertaintypeofcellsortissuesinaspecificdevelopmentalstageorphysiologicalcondition.Transcriptomeanalysiscanprovideacomprehensiveunderstandingofmolecularmechanismsinvolvedinspecificbiologicalprocessesanddiseasesfrom
4、theinformationongenestructureandfunction.Currently,?transcriptomicstechnologymainlyincludesmicroarry-basedonhybridizationtechnologyandtranscriptomesequencing-basedonsequencingtechnology,involvingExpressionsequencetagstechnology,Serialanalysisofgeneexpression,Massivelyparallelsign
5、aturesequencingandRNAsequencing.Thedetailedprinciples,technicalcharacteristicsandapplicationsofthemaintranscriptomicstechnologiesarereviewedhere,andthechallengesandapplicationpotentialsofthesetechnologiesinthefuturearealsodiscussed.Thiswillpresenttheusefulinformationforotherresea
6、rchers.Keywords:transcriptomics;microarray;transcriptomesequencing;application隨著后基因組時代的到來,轉錄組學、蛋白質組學、代謝組學等各種組學技術相繼出現,其中轉錄組學是率先發(fā)展起來以及應用最廣泛的技術[1]。1轉錄組和轉錄組學轉錄組概念是最先由Veclalesuc和Kinzler等人于1997年提出[2]。轉錄組(transcriptome)廣義上是指某個組織或細胞在特定生長階段或生長條件所轉錄出來的RNA總和,包括編碼蛋白質的mRNA和各種非編碼RNA,如rRNA、tRNA
7、、snoRNA、snRNA、microRNA及其他非編碼RNA等。但狹義上通常僅以mRNA為研究對象。由轉錄組的定義可見,其包含了特定的時間和空間限定,這與基因組的概念不同。因此,同一組織或細胞在不同生長條件、生長階段,其轉錄組是不同的。通過遺傳學中心法則我們可以知道,遺傳信息的傳遞是以信使RNA(mRNA)為“橋梁”,從DNA傳遞到蛋白質。由此可見,轉錄組的研究不僅可以解釋細胞或組織的基因組的功能元件,揭示分子成分,還可以用來認識生物學進程和疾病發(fā)生機制[3,4]。轉錄組學(transcriptomics)是功能基因組學(FunctionalGenom
8、ics)研究的重要組成部分,是一門在整體水平上研究細胞中所有基因轉錄及轉錄調控規(guī)