水稻長芒基因AWN-2的定位與克隆.pdf

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1、巧古學(xué)位論義水稻長芒基因＾ＷＶ－２的定位與／克?。崳姡崳?、韋敏益■．－．．■＇．．■？．ｒ‘’＇?wèi)簦?，，＜，、？．Ｉ．’＇＞．．，－－。．？?wèi)Ｉ巧Ａｆ二〇—六年六月＾■■＾＾Ｖ＇．．—二．．．．一—，，？？？？．．■．，．．＂．＇．■．分類號Ｓ３％密級公開ＵＤＣ碩±學(xué)位論文水稻長芒基因４ＷＶ－２的定位與克隆ｖ

2、韋敏益學(xué)科專業(yè)作物學(xué)作物遺傳育種指導(dǎo)教師李容柏研究員論文答辯日期２０１６年５月１９日學(xué)位授予日期２０１６年６月３０日答辯委員會主席周瑞陽教授論文評閱人雙盲評審廣西大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性和使用授權(quán)聲明本人聲明所呈交的論文，是本人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下獨(dú)立進(jìn)行研巧所取得的研究成果。除已特別加Ｗ標(biāo)注和致謝的地方外，論文不包含任何其他個人或集體己經(jīng)發(fā)表或撰寫的研究成果，也不包含本人或他人為獲得廣西大一學(xué)或其它單位的學(xué)位而使用過的材料。與我同工作的同事對本論文的研究工作所

3、做的貢獻(xiàn)均己在論文中作了明確說明。本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下所完成的學(xué)位論文及相關(guān)的職務(wù)作品，知識產(chǎn)權(quán)歸屬廣西大學(xué)。本人授權(quán)廣西大學(xué)擁有學(xué)位論文的部分使用權(quán)，目Ｐ；學(xué)校有權(quán)保存并向國家有關(guān)部口或機(jī)構(gòu)送交學(xué)位論文的復(fù)印件和電子版，允許論レ文被查閱和借閱，可ッ將學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行。檢索和傳播，可Ｗ采用影印、縮印或其它復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文本學(xué)位論文屬于：在年解密后適用授權(quán)。０＾保密。＂＂請?jiān)讠欹蒙舷鄳?yīng)方框內(nèi)打Ｖ（）論文作者簽名：例＾少０期

4、：指導(dǎo)教師簽名部日期作者聯(lián)系電話；電子郵箱；水稻長芒基因＾Ｗ－２？Ｖ的定位與克?。崳娬崳娝臼鞘澜缟献钤珩Z化的重要糧食作物之一而來，栽培稻是由野生稻馴化一個漫長的過程的，這經(jīng)歷了。芒是水稻中重要的馴化性狀，它在野生稻中普遍存在，但在水稻馴化和人工選擇的過程中，對野生稻的野外生存和擴(kuò)散至關(guān)重要逐漸被淘汰，目前大部分栽培稻都是短光芒或無芒的，開展芒相關(guān)基因的定位克隆及遺傳機(jī)理等方面的研究顯得尤為重要。本研究從Ｗ廣西普通野生稻ＤＰ３０為供體、釉稻９３１１為受體構(gòu)建

5、的染色體片段代換系中篩選獲得１份穩(wěn)定遺傳具有長芒表型的材料ＣＳＳＬ５，并對其中的長芒基因進(jìn)行了定位和克隆，有關(guān)研究如下：（１）對ＣＳＳＬ５與受體親本９３１１進(jìn)行表型鑒定，發(fā)現(xiàn)兩者的株型、穗型并無顯著差異，ＣＳＳＬ５３１１，調(diào)查統(tǒng)計(jì)分析發(fā)現(xiàn)與９平均芒長和芒著生比例的差異均達(dá)到了極顯著。而且，ＣＳＳＬ５與９３１１的稻芒表面結(jié)構(gòu)也有明顯差異，長芒的ＣＳＳＬ５芒表面粗糖，布滿了芒刺：而短芒的９３１１稻芒表面光滑，無芒刺。（２）分析９３１１／ＣＳＳＬ５衍生ＢＣｓＦ和ＢＣ５Ｆ２群體

6、，發(fā)現(xiàn)其Ｆ代巧粒的芒表ｉｉ５類，型與ＣＳＳＬ似；卡方分析表明其Ｆ２群體中長芒和短芒株數(shù)符合３：１的分離比，表明ＣＳＳＬ５的長芒性狀受１對顯性主效核基因控制，本研巧將該基因命名－為ＡＷＮ２。（３）從１６６３對分子標(biāo)記中篩選出在ＤＰ３０和９３１１間有多態(tài)的標(biāo)記４０８對，這些標(biāo)記基本覆蓋了水稻１２條染色體；利用篩選出來的多態(tài)標(biāo)記，對ＣＳＳＬ５進(jìn)行供體代換片段的檢測，發(fā)現(xiàn)ＣＳＳＬ５中有５個來自供體ＤＰ３０的代換片段，連鎖分析發(fā)現(xiàn)與第４染色體上的分子標(biāo)記ＭＹ］、ＭＹ２連鎖，且位

7、于兩個標(biāo)記之間。繼續(xù)利用這兩個標(biāo)記及其之間的３對多態(tài)標(biāo)記對９６株短芒表型的單－株進(jìn)行分析，將＾胃２定位于分子標(biāo)記Ｍｌ和Ｍ６之間，物理距離約為１．３２Ｍｂ。Ｉ一Ｆ６（４）進(jìn)步擴(kuò)大群體獲得３分離群體，同時在初定位標(biāo)記之間發(fā)展了對新的多態(tài)標(biāo)記，利用Ｆ３群體中５４８０個短芒株系將基因精細(xì)定位在Ｍ７和Ｍ８之間，物理距離約為１２．１４Ｋｂ。（５）在日本晴基因組注釋數(shù)據(jù)庫中１２．１４Ｋｂ的范圍內(nèi)只有１，這個注釋基因，即賴氨酸脫簇酶化餐４３Ｓ４０），我們對這個基因進(jìn)行了測序

8、比對分析，，結(jié)果發(fā)現(xiàn)與栽培稻日本晴、９３１１相比ＣＳＳＬ５的化基因在５心了民２區(qū)有２９個堿基的缺失及個堿基的置換。因此，我們推測化０餐知３４０可能是控制ＣＳＳＬ５長芒表型的候選基因。；水稻關(guān)鍵詞；長芒；馴化；染色體片段代換系；基因定位；克?。崳姡桑桑崳姡停幔玻牐悖铮睿簦颍铮穑穑椋睿幔睿洌牐悖欤铮睿椋睿铮妫粒祝危欤欤椋睿欤铮睿幔鳎睿牐椋睿牐颍椋悖澹崳姡纾牐纾牐纾牐纾牐祝澹椋牐停椋睿椋崳姡ㄈ剩铮欤欤澹纾澹牐铮妫粒牐纾颍椋悖酰欤簦酰颍?，ＧｕａｎｇｘｉＵ打ｉｖｅｒｓ