進(jìn)化樹分析軟件MEGA的用法.doc

《進(jìn)化樹分析軟件MEGA的用法.doc》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫(kù)。

1、1.將clustal排好的序列轉(zhuǎn)成MEGA格式2.打開MEGA格式的文件，點(diǎn)PHYLOGENY，要建BOOTSTRAP檢驗(yàn)的樹，如下圖。有四種建樹方法，NJ，MP，ME，andUPGMA。后面以NJ為例。3。點(diǎn)擊NJ后如下圖。點(diǎn)擊綠色方格可以改變BOOTSTRAP中重復(fù)的次數(shù)（＞１００），GAP是pairwise還是completedeletion?。ㄒ话氵xＰＡＩＲＷＩＳＥ）,適合你數(shù)據(jù)的替換模型（有ＭＯＤＥＬＴＥＳＴ可以檢驗(yàn)）。（一定要根據(jù)自己的數(shù)據(jù)來(lái)設(shè)這些值）4。一切就緒后，點(diǎn)擊COMPUTE。結(jié)果如下，紅圈中的數(shù)字就是boot

2、strap值，一般大于７０％的枝認(rèn)為比較有意義．5。如果有外類群，你可以直接點(diǎn)擊你的外類群，得到有根樹6?；具^(guò)程就是這樣，MEGA還有其他一些功能，希望大家繼續(xù)補(bǔ)充。