資源描述：
《蘿卜屬抽薹開花相關(guān)基因FLC的預(yù)測及分析.pdf》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在應(yīng)用文檔-天天文庫。
1、浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報ActaAgriculturaeZhefiangensis，2014，26(3)：656—660http：／／www．zjnyxb．en郭軍，祖艷俠，吳永成，等．蘿卜屬抽薹開花相關(guān)基因FLC的預(yù)測及分析[J]．浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報，2014，26(3)：656—660．DOI：10．3969／j．issn．1004—1524．2014．03．21蘿卜屬抽薹開花相關(guān)基因FLC的預(yù)測及分析郭軍，祖艷俠，吳永成，鄭佳秋，梅黻(江蘇沿海地區(qū)農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所，江蘇鹽城224002)摘要：以控制擬南芥春化途徑的關(guān)鍵基因FLC全長CDS為參考序列，在蘿
2、卜屬(Raphanus)EST數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行BLASTN檢索，得到具備Score≥100、E—value≤10。和coverage≥70％條件的70條蘿卜ESTs作為候選的擬南芥FLC基因的同源ESTs，并進(jìn)行序列聚類拼接、注釋及分析。結(jié)果顯示：在普通蘿卜和野生蘿卜中各發(fā)現(xiàn)兩個旁系同源基因(凡和RsFLCb及RrFLCa和RrFLCb)。RFLCs與擬南芥FLC間在核酸水平上的一致性為78．7％～86．9％；RFLCs旁系同源基因問的一致性為75．9％一93．4％；RFLCs與蕓薹屬FLC直系同源基因間的一致性絕大多數(shù)維持在85％以上，且高于
3、與擬南芥直系同源基因間的一致性。系統(tǒng)進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn)，與白菜、甘藍(lán)及甘藍(lán)型油菜中FLC多拷貝產(chǎn)生的機(jī)制可能類似，蘿卜屬FLC基因的多拷貝現(xiàn)象可能也是伴隨蘿卜基因組的多倍化而產(chǎn)生的。關(guān)鍵詞：十字花科；蘿卜屬；開花時間基因中圖分類號：S631．1；Q943．2文獻(xiàn)標(biāo)志碼：A文章編號：1004—1524(2014)03—0656-05PredictionandanalysisoffloweringrelatedgenesRFLCsinRaphanusspeciesGUOJun，ZUYan—xia，WUYong—cheng，ZHENGJia—qiu，M
4、EIYi(InstituteofAgriculturalSciencesofJiangsuCoastalArea，Yancheng224002，China)Abstract：FLC(FL0WERINGLOCUSC)inRaphanusspecieswereidentifiedusingdataminingmethodti’omRaphanusESTdatabase．ThefulllengthCDSsequenceofArabidopsisthalianavernalizationpathwaykeygeneFLCwasusedasrefer
5、eneetosearchthehomologousESTsinRaphanusESTdatabase．SequenceswithScore≥100．E—value≤10一andcoverage>t70％wereconsideredasthecandidateFLC—gene—likeESTs，whichwereassembledandannotatedinthefollowinganalysis．Theresultsshowedthat70FLC—gene—likeESTswereidentifiedinRaphanus，andfourFL
6、CcandidategenesRsFLCn。RsFLCb，RrFLCaandRrFLCbwerepredicted，amongwhichRsFLCnandFLCbwereoriginatedfromRaphanussativus．a(chǎn)ndtheothertwowereoriginatedfromRaphanusraphanistrum．ThehomologousFLCgenesinRaphanusandArabidopsisthalianashared78．7％一86．9％nucleotidesequenceidentity．a(chǎn)ndparal
7、ogsFLCgenesinRaphanusshared75．9％一93．4％nucleotidesequenceidentity．IdentitiesofFLCorthologsbetweenRaphanusandBrassicaweremorethan85％，whichwashigherthanthatbetweenRaphanusandA．thaliana．Moreover，phylogeneticanalysissuggestedthatmulti—copyofFLCgenesinRaphaa~maybecorrespondedwit
8、hgenomepolyploidyofRaphanusspieces，whichwassimilartothatofFLCgenesinBrassicaspecies．Keywo
