紅外-拉曼光譜.ppt

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1、紅外、拉曼色譜在蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)測定中的作用拉曼散射光譜的基本概念一束頻率為V0的入射光,照射到氣體液體或透明晶體樣品上,絕大部分可以透過,大約有0.1%的入射光光子與分子發(fā)生碰撞后向各個(gè)方向散射。有一部分散射光發(fā)生了光子與分子之間的能量交換,即非彈性碰撞,散射的頻率不再等于V0,而是Vi,這種散射現(xiàn)象稱為拉曼散射。根據(jù)這個(gè)原理所獲得的散射光譜,稱為拉曼光譜。若入射光與基態(tài)分子相碰撞而發(fā)生拉曼散射,分子從光子那里獲得能量,從振動(dòng)基態(tài)躍遷到振動(dòng)的激發(fā)態(tài),而散射光子的能量減小,散射光的頻率低于入射光的頻率,這種形式的拉曼散射稱為Stokes輻射,相應(yīng)的光譜線稱為

2、Stokes線。如果與入射光相碰撞的分子是處于振動(dòng)的激發(fā)態(tài),結(jié)果分子交出能量給光子,散射光子的能量增強(qiáng),散射光的頻率大于入射光的頻率,這種形式的拉曼散射稱為反-Stokes輻射,相應(yīng)的譜線為反-Stokes線。在振動(dòng)光譜中有九個(gè)譜峰,按波數(shù)遞減的方向命名為酰胺A、B及酰胺I至VII帶,各種酰胺(Amide)頻率:在3000cm-1以上,有酰胺A(3280cm-1)及酰胺B(3090cm-1);在1700cm-1以下有酰胺Ⅰ(1650cm-1)酰胺Ⅱ(1550cm-1)酰胺Ⅲ(1300~1250cm-1)酰胺Ⅳ(627cm-1)酰胺Ⅴ(725cm-1)酰胺Ⅵ

3、(600cm-1)及酰胺Ⅶ(206cm-1)。拉曼散射光譜的應(yīng)用酰胺A3280cm-1酰胺B3090cm-1酰胺Ⅰ1650cm-1酰胺Ⅱ1550cm-1酰胺Ⅲ1300~1250cm-1C=O伸縮、C—N伸縮和N—H面內(nèi)彎曲振動(dòng)N—H面內(nèi)變形及C—N伸縮振動(dòng)C—H伸縮振動(dòng)振動(dòng)譜帶振動(dòng)波數(shù)歸屬N-H伸縮N-H伸縮(費(fèi)米共振)酰胺Ⅳ627cm-1O=C—N面內(nèi)彎曲振動(dòng)酰胺Ⅴ725cm-1N—H面外彎曲酰胺Ⅵ600cm-1C=O面外彎曲酰胺Ⅶ206cm-1C—N扭曲振動(dòng)振動(dòng)譜帶振動(dòng)波數(shù)歸屬此外,還有可能存在C—CH3伸縮振動(dòng)頻率(910~890cm-1)以及骨架振

4、動(dòng)頻率(500cm-1以下)。酰胺I帶各子峰所對應(yīng)的二級(jí)結(jié)構(gòu):Table2FT-RamanfrequenciesofproteinamideIbandsandtheirassignmentstodifferentsecondarystructure此外,Lippert等人用已知二級(jí)結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)(聚-L-賴氨酸)的拉曼光譜得到一組強(qiáng)度參數(shù),然后用蛋白質(zhì)拉曼光譜的酰胺III和酰胺I′(重水溶液)譜帶強(qiáng)度建立了一組聯(lián)立方程,從而求解蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)。根據(jù)Lippert等的方法,以聚-L-賴氨酸的三種構(gòu)象為模型,利用四階聯(lián)立方程組:聚-L-賴氨酸三種構(gòu)象的酰胺譜帶

5、(1240,1632,1660)對CH21448cm-1模式的相對強(qiáng)度數(shù)據(jù)水溶液重水溶液124016321660聚-L-賴氨酸,α-螺旋0.000.800.55聚-L-賴氨酸,β-折疊1.200.720.88聚-L-賴氨酸,無序0.600.080.78注:這些數(shù)據(jù)是Lippert等的修正值另外,在多肽和蛋白質(zhì)的拉曼光譜中,譜帶850和830是酪氨酸殘基的對未取代基的有關(guān)振動(dòng)。由于環(huán)的呼吸振動(dòng)和面外彎曲振動(dòng)倍頻之間的費(fèi)米共振,它們總是成雙成對的出現(xiàn),而且這兩譜帶的強(qiáng)度比可表征酪氨酸殘基所處的環(huán)境,并定量的表示它呈“暴露式”或“埋入式”。0.5Nbury+1.

6、25Nexpo=I850/I830Nbury+Nexpo=1紅外光譜的應(yīng)用蛋白質(zhì)主要表現(xiàn)出九個(gè)吸收譜帶,其中酰胺I(1600~1700cm-1)是C=O伸縮、C—N伸縮和N—H面內(nèi)彎曲振動(dòng)的貢獻(xiàn),對蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的研究最有價(jià)值,其振動(dòng)頻率受C=O和N—H之間氫鍵的影響,通過這個(gè)可以測定氨基酸鏈的二級(jí)結(jié)構(gòu)。酰胺I帶的歸屬:1650~1658α-螺旋1640~1610β-折疊1700~1660β-轉(zhuǎn)角1650~1640無規(guī)卷曲但是H2O在1640附近的吸收對其造成很大影響,目前可以采用吹掃,差減及氘代等方法消除水的干擾。自然界存在的蛋白質(zhì)是許多種不同構(gòu)象的多縮

7、氨基酸,這樣就會(huì)使蛋白質(zhì)的酰胺I很復(fù)雜,主要是α-螺旋,β鏈和無規(guī)則多肽片段引起的峰重疊。由于這種重疊組分帶的帶寬很大,使人們不可能從測出譜帶中鑒定。酰胺III帶由于信號(hào)較弱,過去很少應(yīng)用于蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)測定,但由于水再次吸收帶沒有吸收峰,解決了嚴(yán)重的水汽干擾,不同二級(jí)結(jié)構(gòu)在III帶的光譜性質(zhì)特征明顯,擬合過程中易于將其分開。尤其對于I帶中因峰重疊而難以區(qū)分的螺旋和無規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu),在III帶中得以明顯的分離。酰胺III帶譜峰歸屬:1330~1290α-螺旋1295~1265β-轉(zhuǎn)角1270~1245無規(guī)卷曲1250~1220β-折疊其中1290~1295,

8、1265~1270及1245~1250三個(gè)區(qū)域?yàn)橄噜彾?jí)結(jié)構(gòu)的交蓋

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