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《壇紫菜的分類學(xué)研究》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在應(yīng)用文檔-天天文庫(kù)。
1、壇紫菜(Pyropiahaitanensis)核糖體基因簇序列的測(cè)定張皓何淵沈頌東蘇州大學(xué)醫(yī)學(xué)部基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與生物科學(xué)學(xué)院郵編:215123作者簡(jiǎn)介:張皓(1985-),男,江蘇太倉(cāng)人,碩士,主要研究方向?yàn)榛鶎俞t(yī)學(xué)與養(yǎng)殖E-mail:richard02@163.com何淵(1990-),男,江蘇太倉(cāng)人,碩士,主要從事藻類細(xì)胞發(fā)育與分子機(jī)理研究。E-mail:756072102@qq.com。通信作者:沈頌東(1968-),男,博士,教授,主要從事藻類細(xì)胞發(fā)育與分子機(jī)理研究。E-mail:shensongdong@suda.edu.cn摘要:壇紫菜是我國(guó)獨(dú)有的栽培紫菜物種,而目前對(duì)壇紫菜分類
2、學(xué)層面上仍缺乏有效的分子鑒定技術(shù)。本研究通過(guò)PCR方法,對(duì)采自福建省莆田海區(qū)壇紫菜樣品核糖體基因簇序列進(jìn)行了測(cè)定,目的是為壇紫菜分類及種質(zhì)鑒定提供分子生物學(xué)證據(jù)。測(cè)定結(jié)果表明,壇紫菜樣品的18SrDNA的全長(zhǎng)序列長(zhǎng)度為2953bp;28SrDNA部分序列3603bp,且不含內(nèi)含子;5.8SrDNA長(zhǎng)度為158bp,該區(qū)域的5’端和3’端十分保守,在紫菜屬中差異較小;ITS1的長(zhǎng)度為334bp;ITS2為678bp。已經(jīng)測(cè)定IGS區(qū)的部分長(zhǎng)度為3555bp,該區(qū)域存在復(fù)雜二級(jí)結(jié)構(gòu)。通過(guò)對(duì)壇紫菜核糖體基因簇序列的分析表明,其能夠成為紫菜分類鑒定與系統(tǒng)演化的分子標(biāo)記。關(guān)鍵詞:壇紫菜;核糖體;
3、順反子;系統(tǒng)演化ThenuclearribosomalDNA(nrDNA)cistronsequenceofPyropiahaitanensis(Bangiales,Rhodophyta)HaoZhang,YuanHe,SongdongShenSchoolofBiologyandBasicMedicalSciences,SoochowUniversity,Suzhou215123,ChinaAbstract:PyropiahaitanensisisauniquecultivatedlaverinChina,whilethelackofeffectivemolecularidenfiti
4、cationtechnologyaffectsthetaxonomyofP.haitanensis.ThestudysequencedthenuclearribosomalDNA(nrDNA)cistronsequenceofP.haitanensisfromPutian,FujiangProvincebypolymerasechainreaction(PCR),inordertoprovidemolecularbiologicalevidienceforclassificationandgermplasmidentificationofP.haitanensis.Resultssho
5、wnthateachunitiscomposedofthesmall-subunit(SSU)rRNAgeneofwhichthefulllengthis2953bp;thepartialsequenceofthelarge-subunit(LSU)rRNAgeneofwhichthelengthis3603bpwithoutanyintrons;thelengthofthe5.8SrRNAgeneis158bp,the5’and3’terminalsequencesofthegenicregionsoftheribosomalcistronareextremelyconservati
6、veamonggenusofPyropia;thelengthofITS1is334bpandITS2is678bp;thepartialsequenceofIGSis3555bp,duetoacomplicatedsecondarystructureexsitsinIGSregionmakessequencinguntoward.ThoughtheanalysisofnuclearribosomalDNAsequence,itcanbeamolecularmakerforthetaxonomicidentificationofPyropia.KeywordsPyropiahaitan
7、ensis;ribosome;cistron;systemevolution引言紫菜廣泛分布于世界各地,自然生長(zhǎng)的紫菜數(shù)量十分有限,因此目前用作食用以及研究的紫菜主要是通過(guò)人工養(yǎng)殖,我國(guó)紫菜產(chǎn)量居世界首位,紫菜已成為重要的經(jīng)濟(jì)海藻之一[1]。壇紫菜(Pyropiahaitanensis)隸屬于紅藻門(Rhodophyphyta),原紅藻綱(Protoflorideophyceae),紅毛菜目(Bangiales),紅毛菜科(Bangiaceae