微衛(wèi)星dna標(biāo)記在家畜遺傳育種上的研究現(xiàn)狀

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1、微衛(wèi)星DNA標(biāo)記在家畜遺傳育種上的研究現(xiàn)狀微衛(wèi)星DNA標(biāo)記在家畜遺傳育種上的研究現(xiàn)狀　1微衛(wèi)星DNA標(biāo)記　　隨著分子克隆、DNA重組技術(shù)在分子生物學(xué)領(lǐng)域的不斷完善，加之另一類重要的遺傳標(biāo)記多態(tài)DNA分子標(biāo)記圖相.L.繼出現(xiàn)，使我們?cè)谝欢l件下可以操作某些DNA片段進(jìn)行遺傳分析研究。目前重要的遺傳標(biāo)記主要包括限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)、隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)DNA(RAPD)、小衛(wèi)星DNA和微衛(wèi)星DNA。而微衛(wèi)星DNA在度量品種遺傳多樣性及構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹，其顯示出分布廣泛、多態(tài)性豐富、易于檢測(cè)等特點(diǎn)，被認(rèn)為是各類遺傳標(biāo)記中最有價(jià)值的一種?！　　?/p>

2、　2微衛(wèi)星DNA標(biāo)記的研究方法　　在使用微衛(wèi)星方法之前，如何獲得所需要的微衛(wèi)星位點(diǎn)？大致有三條途徑：第一、尋找已存在的微衛(wèi)星引物；第二、使用與所研究物種親緣關(guān)系較近物種的引物；第三、用經(jīng)典分子生物學(xué)方法克隆所需要的微衛(wèi)星位點(diǎn)。一旦擁有微衛(wèi)星位點(diǎn)，便可自行選擇作探針或作引物。因此獲得所需要的微衛(wèi)星位點(diǎn)后，就可以進(jìn)行微衛(wèi)星DNA的多態(tài)性分析：一是在微衛(wèi)星數(shù)據(jù)庫中直接尋找合適的引物，進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測(cè)序，凝膠電泳分析。但其局限是所研究的基因序列是已知的，不能反映整個(gè)基因組。另一種是首先構(gòu)建基因文庫，然后以想釣取的微衛(wèi)星去雜交，從中選去陽性克隆，

3、提出質(zhì)粒后利用載體插入座位兩端的已知序列設(shè)計(jì)引物去測(cè)定插入片段序列。最后在微衛(wèi)星DNA兩端選出適當(dāng)?shù)囊镞M(jìn)行PCR擴(kuò)增和測(cè)序凝膠電泳去分離、測(cè)定基因組樣品中微衛(wèi)星DNA的多態(tài)性。再進(jìn)一步分析計(jì)算等位基因在研究群體中的基因頻率及群體中各位點(diǎn)的雜合度等?！　　　?微衛(wèi)星DNA標(biāo)記在家畜遺傳育種上的應(yīng)用　　微衛(wèi)星被廣泛用于家畜的基因組變異研究，由于它多態(tài)性豐富，易于獲得，在構(gòu)建物種的遺傳連鎖圖、基因鑒定、QTL相關(guān)及系譜確證等方面起到了巨大的作用?！　?.1構(gòu)建基因組連鎖圖　　微衛(wèi)星是構(gòu)建完整基因組連鎖圖時(shí)使用的主要基因標(biāo)記。在進(jìn)行基因組圖譜建

4、立過程中，標(biāo)記的基因位點(diǎn)一般有兩類：一類主要有編碼基因和結(jié)構(gòu)基因位點(diǎn)組成，位點(diǎn)變異??；另一類為具有高度變異的重復(fù)序列來標(biāo)記DNA上的基因位置。現(xiàn)在使用最廣泛的是微衛(wèi)星標(biāo)記。同一類微衛(wèi)星可分布在整個(gè)基因組的不同位置上，從而適合于基因定位，是基因組遺傳圖譜和物理圖譜的理想界標(biāo)?！　?.2基因鑒定標(biāo)記　　基因鑒定的主要任務(wù)是在DNA水平上鑒別群體中存在的某個(gè)基因位點(diǎn)的全部等位基因或者說該基因位點(diǎn)的所有變異體。用微衛(wèi)星標(biāo)記來鑒定基因位點(diǎn)的等位基因時(shí)，僅涉及DNA結(jié)構(gòu)，通常與表現(xiàn)型無關(guān)。用這種方法可以將群體中存在的所有等位基因無一遺漏地鑒定出來。在

5、家畜中用分子遺傳學(xué)基因技術(shù)研究發(fā)現(xiàn)的遺傳缺陷多數(shù)均是使用微衛(wèi)星標(biāo)記后發(fā)現(xiàn)的?！　?.3QTL的連鎖分析及基因定位　　可以利用標(biāo)記的連鎖特點(diǎn)，將一些功能基因或QTL定位在染色體上或連鎖群中。微衛(wèi)星DNA指紋圖是由20-30個(gè)多態(tài)位點(diǎn)的等位基因組成，可同時(shí)提供數(shù)十個(gè)隨機(jī)分布的標(biāo)記位點(diǎn)，被廣泛應(yīng)用于基因定位?！　?.4系譜確證　　在家畜育種中常常必須搞清楚畜群中的親子關(guān)系，或者說必須知道畜群的系譜關(guān)系。這樣做有利于防止群體近交的發(fā)生，這在普通育種學(xué)中稱為系譜記載。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展，應(yīng)用分子遺傳學(xué)方法比目前使用的血型、血液蛋白型等研究

6、更為精確地描述個(gè)體的遺傳變異程度，所以用DNA定型來進(jìn)行系譜確證(或系譜起源)是一種較好的選擇。由于微衛(wèi)星位點(diǎn)的特性，使它在親仔鑒定、胚胎移植、混合受精、親緣關(guān)系分析和品種遺傳純度分析上十分重要?！　?.5群體遺傳結(jié)構(gòu)分析及雜交優(yōu)勢(shì)預(yù)測(cè)　　微衛(wèi)星多態(tài)性分析可以評(píng)估畜禽遺傳多樣性、對(duì)品種資源進(jìn)行分類等，利用微衛(wèi)星位點(diǎn)估計(jì)品種間或品種內(nèi)遺傳結(jié)構(gòu)和變異是非常有效的。在緊密相關(guān)的物種中，微衛(wèi)星位點(diǎn)具有位置保守性，這使得我們能在相關(guān)畜種間如牛、綿羊、山羊間使用跨物種引物進(jìn)行研究，從而更快更準(zhǔn)確地找到該物種中更多的微衛(wèi)星位點(diǎn)，用于遺傳作圖或其他研究，

7、從而說明了微衛(wèi)星位點(diǎn)的保守性。　　　　4結(jié)論　　微衛(wèi)星標(biāo)記具有較高的突變率、較高的多態(tài)信息含量和雜合度，主要用于研究品種內(nèi)及品種間遺傳變異，為基因作圖、群體遺傳變異研究、親代評(píng)估等提供了很好的標(biāo)記。由于微衛(wèi)星標(biāo)記的研究起步較晚，現(xiàn)在已知的微衛(wèi)星位點(diǎn)還不夠多，以及其分析成本較大等，需要我們進(jìn)一步利用此標(biāo)記進(jìn)行快速、靈敏的遺傳分析。而且在目前的應(yīng)用中仍然存在一些不足如：微衛(wèi)星的獲得較為繁瑣、分析成本大及PCR擴(kuò)增產(chǎn)物在檢測(cè)過程中，出現(xiàn)的基因帶重疊，很難判斷等位基因，造成研究結(jié)果不準(zhǔn)確，因此我們要做進(jìn)一步的研究與改進(jìn)，以能夠準(zhǔn)確的判斷等位基因。