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1、LAMMPS如何在windows編譯步驟（翻譯整理Lammps上海大學(xué)上海市應(yīng)用數(shù)學(xué)與力學(xué)研究所，版權(quán)所有，據(jù)最新版06年6月份的，原說明在SRC/MAKE/WINDOWS目錄下）2004/11/20（該方法由JinMa（OkalahhomaStateUniversity）給出，聯(lián)系Jin.Ma@okstate.edu）編譯環(huán)境為微軟windows的VC++6.0，不帶MPI（并行處理）和FFT算法。創(chuàng)建一個空的win32控制臺工程（win32consoleproject），添加Src目錄下所有的.h文件和.cpp文件到工程。1.變量的重定義問題代碼中約有8
2、0處地方，變量出現(xiàn)重定義問題。大部分都出現(xiàn)在循環(huán)過程中，可以很容易修正。例如這樣的循環(huán)：for（inti=0;i<5;i++）{something}for(inti=0;i<5;i++{somethingelse}這種情況在Linux下的g＋＋編譯環(huán)境中是允許的，但是在VC環(huán)境中會認(rèn)為第二次循環(huán)時變量i被重定義，因此變量的范圍是不同的。這在代碼中有很多，因此在編譯錯誤修正時只需要把定義整形變量i的定義放在語句中，而不是放在循環(huán)體中。2.fft問題在文件fft3d.h的開頭增加#ifndefFFT_NONE#defineFFT_NONE#endif取消FFT功
3、能的編譯，即不編譯文件3.input文件的修改在input文件中修改下面的語句//#include"unistd.h"(注銷)#include"direct.h"（增加）4.處理MPI問題把文件mpi.h和mpi.cpp（在STUBS目錄內(nèi)）包括進(jìn)工程中來，并且在mpi.cpp文件中注釋掉語句//#include（和Linux系統(tǒng)下的取時間有關(guān)，windows不支持）同時注釋調(diào)所有和時間有關(guān)的語句，即函數(shù)MPI_Wtime()中的原始代碼，保持函數(shù)格式，讓內(nèi)容為空，并給予返回值為0(return0;)5.創(chuàng)建系統(tǒng)文件system.cp
4、p的修改由于輸入說明列表在linux和windows下的某些不同，在文件中system.cpp作如下修改行83:intiarg=2;（修改，默認(rèn)輸入的問題）行172:inflag=1;（增加改行不知道原因暫時）（原因：因?yàn)樵赿os行命令下運(yùn)行程序時，給出的變量數(shù)目在G++環(huán)境和VC++環(huán)境中有所不同，也可能和MPI相關(guān)，這個不同只是其中之一，一旦上面說的修改成功，程序輸入命令的個數(shù)才正確）之后2005年1月修改。4-a．輸入文件問題(由TimLau補(bǔ)充,MIT,ttl@mit.edu在variable.cpp文件中進(jìn)行修改頭文件//#include"unis
5、td.h"#include"direct.h"#include"windows.h"另外修改usleep(100000)為Sleep(100)修改說明：因?yàn)楫?dāng)Sleep發(fā)生在毫秒時而usleep發(fā)生在微妙，所以這個值被1000分開。（不明白何意思）7.新版erfc錯誤新版本的LAMMPS程序會調(diào)用下列函數(shù)而報(bào)錯doubleerfc(double)，該函數(shù)屬于GNU的C庫函數(shù)，在VC環(huán)境是不存在的。有三種修改方法：一從其他的庫中尋找到函數(shù)erfc()二是因?yàn)樵摵瘮?shù)是被pair_modify表選項(xiàng)調(diào)用的，我們可以在該函數(shù)的表選項(xiàng)中把值設(shè)為0,避免調(diào)用該函數(shù)三是自
6、己動手寫該函數(shù)補(bǔ)充：在新版的目錄下有這樣的兩個文件erfc.h,erfc.cpp已經(jīng)被加入到工程中，只需要在所有使用到erfc()函數(shù)的文件頭中增加調(diào)用命令#include"erfc.h"即可。注意這兩個函數(shù)為經(jīng)仔細(xì)測試，需謹(jǐn)慎使用。8.重建工程，指定正確的輸入文件運(yùn)行程序，windows下的結(jié)果可能會和unix環(huán)境的結(jié)果有所不同，請注意。（JinMajin.ma@okstate.eduOklahomaStateUniversityMarch7,2005）最近增加：如果要增加MPI和FFT，則如下(由TimothyLau聯(lián)系ttl@MIT.EDU給出，相關(guān)步
7、驟參考之前的說明如果你想使用FFT，先在載源碼FFTW2.1.5，然后解壓（dump）全部的文件到和LAMMPS相同的目錄下，然后包括所有FFTW的文件（.c文件和.h文件）到工程中，接下來修改上述第三個關(guān)于FFTW的問題。在文件fft3d.h中修改為#ifndefFFT_FFTW#defineFFT_FFTW#endif你必須小心的檢查visualstidoe編譯中關(guān)于“WIN32”變量的定義，盡管visualstudio可能會自動定義它，涉及到文件fftw.h的行137處。如果你還要增加MPI功能，即在微軟visualvistdo環(huán)境下的，多核處理器或者
8、windows結(jié)點(diǎn)結(jié)構(gòu)（cluster）并行機(jī)上運(yùn)行
