水稻寡分蘗突變體近等基因系構(gòu)建及全基因組表達(dá)譜分析

水稻寡分蘗突變體近等基因系構(gòu)建及全基因組表達(dá)譜分析

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1、論文獨(dú)創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明:所呈交的學(xué)位論文是我個(gè)人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行研究工作所取得的成果。盡我所知。除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外,學(xué)位論文中不包含其他個(gè)人或集體己經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果,也不包含為獲得四川農(nóng)業(yè)大學(xué)或其它教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書所使用過的材料。與我一同工作的同志對(duì)本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說明并表示了謝意。研究生簽名:勿7年6月,g日關(guān)于論文使用授權(quán)的聲明本人完全了解四川農(nóng)業(yè)大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定,即:學(xué)校有權(quán)保留并向國家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版,允許論文被查閱和借閱,可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段

2、保存、匯編學(xué)位論文。同意四川農(nóng)業(yè)大學(xué)可以用不同方式在不同媒體上發(fā)表、傳播學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容。研究生簽名:導(dǎo)師簽名硼年5Rtg黽.∥7年占月繆日摘要分蘗通過影響水稻的穗數(shù)而成為影響單產(chǎn)的重要農(nóng)藝性狀之一;分蘗又是單子葉植物的一種特殊的分枝現(xiàn)象,水稻是世界上超過半數(shù)的人口的主食,對(duì)水稻分蘗的研究具有重要的應(yīng)用價(jià)值和發(fā)育生物學(xué)意義.水稻分蘗的分子生物學(xué)機(jī)理研究己經(jīng)取得突破性的進(jìn)展,但對(duì)分蘗的信號(hào)傳導(dǎo)途徑等方面仍然知之甚少,還需要大量深入研究和證實(shí),探索控制水稻分蘗的分子機(jī)理將有助于生產(chǎn)上遺傳調(diào)控分蘗并促進(jìn)植物分枝的分子機(jī)理研究。本研究構(gòu)建了水稻寡分蘗突變體和0

3、2428的近等基因系,從細(xì)胞學(xué)水平上觀察了它們的側(cè)芽分生組織,并利用基因芯片技術(shù)對(duì)寡分蘗植株和正常植株進(jìn)行了基因表達(dá)譜分析,獲得到了以下主要研究結(jié)果:1.從秈粳交(02428/圭630)花培后代中分離鑒定出一份寡分蘗突變體6069,并以02428作為輪回親本進(jìn)行連續(xù)回交和自交,建立了寡分蘗性狀與02428的近等基因系02428-ftl。與02428相比,02428一ftl表現(xiàn)出最高分蘗少、分蘗速度慢、苗期和分蘗期葉尖黃化但后期逐漸恢復(fù)正常、成穗率高、穗頂部有穎花退化現(xiàn)象、再生能力強(qiáng)、植株矮化等特征.2.通過制作石蠟切片進(jìn)行細(xì)胞學(xué)觀察,發(fā)現(xiàn)突變體中,側(cè)芽分生組織

4、比正常植株的數(shù)量少。外觀上也比正常植株的??;突變體側(cè)芽分生組織的發(fā)生減少,且產(chǎn)生的速度較慢,因此,凡J基因部分抑制了水稻側(cè)芽分生組織的起始。3.利用Rice57KGeneChip(Affymetrix)寡核苷酸芯片從全基因組水平上對(duì)02428一療J和02428的基因表達(dá)譜進(jìn)行比較分析。發(fā)現(xiàn)了130個(gè)差異表達(dá)基因,02428-fti上升表達(dá)的基因有61個(gè),下降表達(dá)的基因有75個(gè)。其中,僅在02428-,ti中表達(dá)(激活)的基因有27個(gè),僅在02428中表達(dá)(沉默)的基因有30個(gè).4.利用Affymetrix的在線分析系統(tǒng)NETAFFX,以及NCBI和TIGR,對(duì)

5、差異表達(dá)基因進(jìn)行了基因功能注釋.這些差異表達(dá)基因涉及的功能范圍較廣,包括轉(zhuǎn)錄因子、激酶、功能蛋白、運(yùn)輸?shù)鞍住⒄{(diào)節(jié)蛋白等,但還有一部分功能未知。其中,LOB基因、含F(xiàn)-box結(jié)構(gòu)域的基因、NAM基因等都是已知與側(cè)枝形成相關(guān)的基因,另外還有葉綠體基因和線粒體基因組分別發(fā)生了下調(diào)和上升表達(dá)。顯示了水稻分蘗是由多基因控制的復(fù)雜的生命活動(dòng).5.利用PLB。XDB中的GO對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行分子功能、生物過程和細(xì)胞結(jié)構(gòu)三個(gè)層次上的功能劃分。分子功能方面,變化最多的是具有催化活性和具有結(jié)合功能的基因,這些基因都與生物反應(yīng)密切相關(guān),少量的變化就能極大地改變生物反應(yīng);生物過程發(fā)生

6、了復(fù)雜的變化,變化最大的是參與細(xì)胞生理過程和與細(xì)胞生長(zhǎng)和維持、新陳代謝相關(guān)的基因,還有部分調(diào)節(jié)生理過程的基因、應(yīng)激反應(yīng)基因發(fā)生了改變;細(xì)胞成分方面,主要是與細(xì)胞內(nèi)細(xì)胞質(zhì)相關(guān)的基因發(fā)生了改變。關(guān)鍵詞:水稻寡分蘗近等基因系基因表達(dá)譜分析基因芯片1AbstractRiceisoneofthemajorhumanbeings’foodresourcesintheworld.Tilleringinrice(OryzasativaL)isallimportantagronomictraitthatdeterminesgrainproduction,andthemlcrnu

7、mbershouldbemoderateinsuper-rice.Asaspecifickindofbranchinginmonocotyledonousplants,ricetilleringisalsoofdevelopmentalimportance.ThoughthemolecularmechanismofricetillerlngwasalreadyconsiderablybIokcnthrough,thesignalpasswayWasknownalittle,needingtobestudiedfurther.Inthisstudy,nearis

8、ogeniclines刪I嶙02428

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