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《il-10基因多態(tài)性與hbv感染易感性研究》由會員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、IL-10基因多態(tài)性與HBV感染易感性研宄高建梅1劉平興2鄒云蓮1董虹1嚴(yán)新民1(通訊作者)(1云南省第一人民醫(yī)院臨床基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所/昆明理工大學(xué)附屬醫(yī)院云南昆明650032)(2勐臘縣疾病預(yù)防控制中心云南景洪666300)【摘要】目的探討IL-10啟動子「S1800871和rsl800896位點(diǎn)多態(tài)性與HBV感染的相關(guān)性。方法運(yùn)用基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時間質(zhì)譜技術(shù),對200例健康對照和400例HBV感染患者的IL-10啟動子「S1800871和rsl800896位點(diǎn)進(jìn)行基因分型。結(jié)果rsl800871位點(diǎn)基
2、因型分布頻率在HBV感染組與正常對照組間顯著不同(χ2=9.625,P=0.008),TT基因型有增高的趨勢。以非條件logistic回歸模型校正混雜因素后,在T隱性模式下(TT/CC+TC),兩組間仍有統(tǒng)計學(xué)差異(P=0.034;OR為1.467;95%CI為1.028-2.094);而rsl800896位點(diǎn)基因型和等位基因分布頻率在兩組間差別無統(tǒng)計學(xué)意義。結(jié)論IL-10基因多態(tài)性與HBV易感性相關(guān),rsl800871TT基因型可能是HBV感染的危險因素?!娟P(guān)鍵詞】IL-10基因多態(tài)性肝炎病毒乙型【中
3、圖分類號】R39【文獻(xiàn)標(biāo)識碼】A【文章編號】2095-1752(2013)11-0084-02研究證實(shí),宿主的遺傳異質(zhì)性特別是與免疫應(yīng)答相關(guān)的基因的多態(tài)性可導(dǎo)致不同人群或個體間免疫功能的差異,從而與HBV易感性密切關(guān)系[1-2]。細(xì)胞介素10(interleukin-10,IL-10)是由Th2細(xì)胞產(chǎn)生的一種具有多效性的免疫調(diào)節(jié)性細(xì)胞因子,其啟動子區(qū)域「S1800871和rsl800896位點(diǎn)的多態(tài)性可影響IL-10基因的轉(zhuǎn)錄活性和血漿IL-10水平[3-4],與乙型肝炎病毒的感染和和預(yù)后密切相關(guān)。木文以運(yùn)用基
4、質(zhì)輔助激光解析電離飛行時間質(zhì)譜技術(shù)(Matrix-AssistedLaserDesorption/IonizationTimeofFlightMassSpectrometry,MALDI-TOF-MS)分析了IL-10啟動子多態(tài)性與HBV感染的相關(guān)性,現(xiàn)報道如下:對象與方法1.研究對象:在知情同意的原則下,收集云南西雙版納州醫(yī)院門診及住院患者血樣600份,其中正常對照200例,HBV感染患者400人,診斷標(biāo)準(zhǔn)符合《病毒性肝炎防治方案》。所有觀察人員均靜脈抽取EDTA-K2抗凝靜脈血3ml,充分混勻后-20°C保
5、存?zhèn)溆谩?.ll-10rsl800871和「S1800896位點(diǎn)多態(tài)性分析:全血標(biāo)本用全血基因組提取試劑盒(百泰克DP1801)提取基因組DNA作為模板,采用MALDI-TOF-MS技術(shù)對IL-10啟動子rsl800871和rsl800896位點(diǎn)進(jìn)行基因分型。首先進(jìn)行PCR擴(kuò)增,其中引物濃度為0.1μmol/L,HotStarTaqlU,dNTP濃度為0.5μmol/L,MgCI2濃度為1.625mmol/L,DNA模板10ng。PCR反應(yīng)的條件為94°C15分鐘;94°C20秒,56°C30秒,7
6、2°Cl分鐘,45個循環(huán);72°C延伸3分鐘。隨后將擴(kuò)增后的產(chǎn)物進(jìn)行SAP純化后進(jìn)行延伸反應(yīng),其中伸反應(yīng)引物0.84mol/L,iPlex酶1U,反應(yīng)條件為94°C30秒;94°C5秒,52°C5秒,40個循環(huán);80°C5秒,5個循環(huán);72°C延伸3min。反應(yīng)結(jié)束后每個延伸反應(yīng)產(chǎn)物經(jīng)樹脂純化后于芯片上點(diǎn)樣,MassARRAYAnalyzer質(zhì)譜檢測相應(yīng)位點(diǎn)的基因型。PCR引物和延伸引物見表1。表1PCR引物及延伸引物序列3.統(tǒng)計學(xué)分析:采用SPSS11.7統(tǒng)計軟件分析,直接計算法計算基因型和等位基因頻率,組間
7、頻率比較采用x2檢驗(yàn),非條件logistic冋歸模型計算相對風(fēng)險度的比值比(OR)及95%可信區(qū)間(Cl),P<0.05視為有統(tǒng)計學(xué)意義。結(jié)果1.飛行吋間質(zhì)譜檢測結(jié)果:經(jīng)x2檢驗(yàn)所調(diào)查的人群基因型頻率分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),樣本具有代表性。rsl800871三種基因型均有檢出,而rsl800896位點(diǎn)只有AA和AG基因型,結(jié)果見圖1。圖1IL-10啟動子rsl800871和rsl800896位點(diǎn)飛行時間質(zhì)譜圖注:a?e分別為:rsl800871CC、rsl8008
8、71TT、rsl800871CT、rsl800896AA和rsl800896GA2.IL-10啟動子rsl800871和rsl800871位點(diǎn)多態(tài)性與HBV感染相關(guān)性分析:HBV感染組rsl800871位點(diǎn)基因型分布頻率與正常對照組顯著不同(χ2=9.625,P=0.008),TT基因型冇增高的趨勢。而rsl800896位點(diǎn)基因型和等位基因分布頻率在兩組間差別無統(tǒng)計學(xué)意義,結(jié)果