玉米agpase基因序列變異及其與籽粒淀粉品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析

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1、SequenceVariationsofMaizeAGPaseGenesandtheirAssociationswithStarchQualityTraitsByHngJiangADissertationSubmittedtoYangzhouUniversityinPartialFulfillmentoftheRequirementfortheMasterDegreeofAgriculturalScienceSupervisorByProf．ChenwuXuAndAssociateProf．Zefeng砌，

2、曙YangzhouUniversityYangzhou，225009，P．R．ChinaMay2014目錄符號說明?????????????????????????????????．1．中文摘要?????????????????????????????????一2一ABSTRACT?????????????????????????????????．4—1前言??????????????????????????????????．．6—1．1玉米籽粒淀粉的研究進展??????????????????????一6

3、—1．1．1淀粉的化學結(jié)構(gòu)????????????????????????．6．1．1．2淀粉的主要理化特性?????????????????????一6—1．2玉米淀粉合成及其與品質(zhì)的關(guān)系????????????????????．8．1．2．1淀粉合成的基本途徑??????????????????????．8．1．2．2淀粉合成過程中的關(guān)鍵酶????????????????????．8．1．3AGPase研究進展???????????????????????????．。11．1．3．1AGPase在植物淀

4、粉合成中的作用????????????????．11．1．3．2AGPase的結(jié)構(gòu)????????????????????????．11．1．3．3AGPase的基因編碼及表達調(diào)節(jié)?????????????????一12．1．3．4AGPase在作物生產(chǎn)中的應用??????????????????一12一1．4關(guān)聯(lián)分析研究進展?????????????????????????．12一1．4．1核苷酸多態(tài)性????????????????????????一13．1．4．2關(guān)聯(lián)分析的基礎一一連鎖不平衡?????

5、???????????．一14．1．4．3基于候選基因的關(guān)聯(lián)分析???????????????????．．．14．1．4．4影響關(guān)聯(lián)分析的因素?????????????????????．．15．1．4．5關(guān)聯(lián)分析在玉米性狀關(guān)聯(lián)標1巳師JC,A-選中的應用???????????一15．1．5本研究的目的與意義????????????????????????．16．2材料與方法??????????????????????????????．．．18．2．1供試材料及田問試驗設計??????????????????

6、????一18—2．2玉米淀粉品質(zhì)檢測?????????????????????????．19—2．2．1RVA糊化特性????????????????????????．．19．2．2．2淀粉熱力學特性???????????????????????．一19—2．3淀粉葡萄糖焦磷酸化酶基因的序列分析????????????????．20．2．3．1玉米基因組DNA的提取、純化和檢測??????????????．20．2．3．2AGPase基因的重測序?????????????????????．20．2．4候選

7、基因與品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析???????????????????一2l_Ⅲ6㈣8㈣0川3Ⅲ3㈣6㈣2眥Y2．4．1自交系遺傳多樣性分析????????????????????．．．21—2．4．2群體結(jié)構(gòu)和親緣關(guān)系?????????????????????．．．21．2．4．3玉米AGPase基因多態(tài)性位點的連鎖不平衡????????????一21．2．4．4基因型和表型的關(guān)聯(lián)分析???????????????????．．．22．2．5數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析???????????????????????????．22．

8、2．5．1數(shù)據(jù)統(tǒng)計???????????????????????????．22—2．5．2序列分析??????????????????????????．．．22．3結(jié)果與分析???????????????????????????????．22．3．1供試材料淀粉品質(zhì)性狀分析?????????????????????．22．3．1．1表型差異分析????????????????????????．．．22．3．1．2