玉米自交系產(chǎn)量和品質(zhì)相關(guān)性狀與簡單重復(fù)序列(ssr)的關(guān)聯(lián)分析(可編輯)

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1、玉米自交系產(chǎn)量和品質(zhì)相關(guān)性狀與簡單重復(fù)序列(SSR)的關(guān)聯(lián)分析碟襁僦榴耥蹴搿農(nóng)。::/麓/..飄明?一。。尊研究報告玉米自交系產(chǎn)量和品質(zhì)相關(guān)性狀與簡單重復(fù)序關(guān)聯(lián)分析李偉忠姚希勤許崇香閔麗陳慶山胡國華,黑龍江省農(nóng)墾科研育種中心,哈爾濱;東北農(nóng)業(yè)大學(xué),哈爾濱同等貢獻作者通訊作者,.;..摘要為尋找并確定控制玉米產(chǎn)量、品質(zhì)的基因組區(qū)域,本研究利用對核心標記對份玉米.自交系構(gòu)成的群體進行基因分型,分析群體連鎖不平衡位點、群體結(jié)構(gòu),在此基礎(chǔ)上,采用軟件的程序?qū)χ旮?、穗位、生育期、穗長、穗行數(shù)、百粒重、脂肪含量、蛋白質(zhì)含量和淀粉含量共個性狀的表型數(shù)據(jù)與標記進行回歸分析,確定標記對表型的解釋率。

2、結(jié)果表明:在公共圖譜上的位點組合都有一定程度連鎖不平衡,,.時,成對位點占總位點組合.%,’.成對位點比例為.%。數(shù)據(jù)遺傳結(jié)構(gòu)分析表明,群體可分為個亞群。共鑒定出個標記位點與個性狀相關(guān)聯(lián),大多集中在、、和染色體上,其中第染色體上標記最多,為個。個位點的變異分別與株高、穗位、生育期、穗長、穗行數(shù)和蛋白質(zhì)含量等個表型性狀極顯著相關(guān).,分別為作用于株高,對表型的解釋率為.%;及作用于穗位,對表型的解釋率為.%.%;及作用于生育期,對表型的解釋率為.%.%;作用于穗長,對表型的解釋率為.%;作用于穗行數(shù),對表型的解釋率為.%;及作用于蛋白質(zhì)含量,對表型的解釋率為.%.%;其他個標記與個性狀

3、顯著相關(guān).。與單個性狀關(guān)聯(lián)的標記數(shù)目為~個,解釋率為.%~.%。與產(chǎn)量相關(guān)性狀關(guān)聯(lián)的位點次累計為個,與品質(zhì)相關(guān)性狀關(guān)聯(lián)的位點次累計為個,位點數(shù)目上品質(zhì)性狀遠少于產(chǎn)量性狀。部分標記與多個性狀關(guān)聯(lián),可能是性狀相關(guān)或一因多效的遺傳基礎(chǔ),一些標記同時與某性狀關(guān)聯(lián),多數(shù)標記與定位于遺傳圖譜的一致,也有互補性。研究結(jié)果表明,這些位點及其區(qū)域內(nèi)存在很多與產(chǎn)量、品質(zhì)等性狀相關(guān)的,對提高玉米產(chǎn)量、改善玉米品質(zhì)可能起到重要作用。關(guān)鍵詞玉米,,關(guān)聯(lián)分析,連鎖不平衡,群體結(jié)構(gòu)?????,“?,,,;,,..;..基金項目:公益性行業(yè)農(nóng)業(yè)科研專項項目.和引進國際先進農(nóng)業(yè)科學(xué)技術(shù)計劃計劃項目收稿日期:..接受

4、日期:??,.,,,,,,,一,,,,.:..%.,.%’...,,.,.,,,,,.:...%:.%.%;.%.%;.%:.%:.%.%....,.%.%...,.,..,,,,玉米的產(chǎn)量、品質(zhì)相關(guān)性狀多屬于數(shù)量性狀,于連鎖作圖,關(guān)聯(lián)分析具有以下優(yōu)點:獲取研究群了解并掌握其基因型是玉米科研、育種工作的基本體周期短,只需要某種分子標記;檢測范圍廣,能夠前提。目前研究植物數(shù)量性狀的方法主要是利用不同時掃描多個特異等位基因;選取材料廣度大,自同的分子標記方法與適宜的分離群體進行連鎖作然群體即可;檢測精確度較高。圖,。遺傳連鎖作圖存在缺等首次通過關(guān)聯(lián)分析法揭點:短期內(nèi)很難構(gòu)建出合適的分離

5、群體;僅能分析示了基因與玉米開花期的關(guān)系,將此方法兩個材料的后代群體,只涉及兩個特異等位基因;引入玉米。等選用高油玉米材料構(gòu)成獲得分離群體過程中,基因重組的次數(shù)較少,影響自然群體,對與油分有關(guān)的特異基因進行研究,結(jié)作圖精度。果表明,與分離群體檢測到數(shù)目相比,利用該針對遺傳連鎖作圖法的缺點,研究基因間人工選擇的群體檢測到控制油分的數(shù)目是前連鎖和重組的關(guān)聯(lián)分析法發(fā)展起來。該方法選取實者的倍左右。等用全基因組關(guān)驗材料,基于基因間連鎖不平衡,對性狀與特異等聯(lián)分析對擬南芥口.與開花期位基因進行作圖的關(guān)和抗病性狀相關(guān)的特異等位基因進行了研究。近年聯(lián)分析法.,;苗麗麗等,。相對來,采用全基因組掃

6、描,在玉米、大豆玉米自交系產(chǎn)量和品質(zhì)相關(guān)性狀與簡單重復(fù)序列的關(guān)聯(lián)分析.、小麥.等作物淀粉。分析表表明,份玉米自交系遺傳差異重要性狀與特異等位基因進行關(guān)聯(lián)分析研究較大,遺傳基礎(chǔ)較豐富,試驗材料構(gòu)成的群體中可.,;楊小紅等,;.,能存在優(yōu)異等位變異。;張軍等,;文自翔等,;竇秉德等,.位點的分析。隨著各主要物種全基因組測序的完成及單核苷酸多態(tài)性.圖為參與掃描的標記在供試玉米自交系連鎖群上連鎖不平衡表現(xiàn),圖中對角線上方的出現(xiàn),關(guān)聯(lián)分析法在玉米數(shù)量性狀定位中的顯示為’值,對角線下方為成對位點支持概應(yīng)用會越來越廣泛。率,其中方格的顏色分別與右側(cè)色差代碼相對應(yīng)。各本研究選取對標記與份遺傳基連鎖

7、群上水平較高的標記’.多分布于礎(chǔ)豐富的玉米自交系進行關(guān)聯(lián)分析?;谌后w連鎖”、及”連鎖群上黑色圈內(nèi),還包括其不平衡和遺傳結(jié)構(gòu)分析,運用全基因組掃描的關(guān)聯(lián)他與這幾個位點的組合,這幾個群內(nèi)用于掃描的分析方法,研究玉米自交系群體結(jié)構(gòu)及初步確定與產(chǎn)量、品質(zhì)相關(guān)性狀相關(guān)聯(lián)的標記位點,對玉米中位點數(shù)分別為、及個。全部用于掃描的標記位點組合數(shù)為個,無論是共線性組控制株高、穗位、生育期及蛋白質(zhì)含量等重要產(chǎn)量、合同一染色體群,還是非共線性組合不同染色體品質(zhì)性狀的基因區(qū)域進行初步定位,可

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