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《玉米和水稻產(chǎn)量及品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析研究》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、分類號:單位代碼:密級:學(xué)號:碩士學(xué)位論文中文論文題目:玉米和水稻產(chǎn)量及品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析研英文論文題目:申請人姓名:蔣蓓蓓指導(dǎo)教師:徐海明副教授專業(yè)名稱:作物學(xué)研究方向:數(shù)量遺傳與生物信息學(xué)所在學(xué)院:農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院論文提交曰期年月分類號:單位代碼:密級學(xué)號:碩士學(xué)位論文中文論文題目:玉米和水稻產(chǎn)量及品質(zhì)性■狀的關(guān)聯(lián)分折研英文論文題目:申請人姓名:蔣蓓萑指導(dǎo)教師:徐海明副教授專業(yè)名稱:作物學(xué)研究方向:數(shù)量遺傳與生物信息學(xué)所在學(xué)院:農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院論文提交日期年月浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文:浙江大學(xué)碩士學(xué)位
2、論文玉米和水稻產(chǎn)量及品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析研究論文作者簽名指導(dǎo)教師簽名:論文評閱人評閱人評閱人評閱人答辯委員會主席:陸燕教授委員委員樊龍江教授委員徐海明副教授答辯日期:年月號浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文:浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文浙江大學(xué)研究生學(xué)位論文獨創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進行的研宄工作及取得的研究成果。除了文中特別加以標注和致謝的地方外,論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研宄成果,也不包含為獲得浙江大學(xué)或其他教育機構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料。與我一同工作的同志對本研宂所做的任何貢獻均己在
3、論文中作了明確的說明并表示謝意。學(xué)位論文作者簽名簽字日期:如丨乂年纟月曰學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本學(xué)位論文作者完全了解浙江大學(xué)有權(quán)保留并向國家有關(guān)部門或機構(gòu)送交本論文的復(fù)印件和磁盤,允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)浙江大學(xué)可以將學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進行檢索和傳播,可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。保密的學(xué)位論文在解密后適用本授權(quán)書)簽字曰期月曰簽字曰期月曰浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文致謝致謝時光荏苒,歲月如梭,將近三年的碩士生涯即將結(jié)束,回顧在浙江大學(xué)生活的點滴,要感謝的人太多,
4、只言片語,難以囊括所有。首先,非常感謝我的導(dǎo)師徐海明老師,本研究是在徐老師的悉心指導(dǎo)下完成的。無論是論文的選題,論文的開展,還是最后的撰寫,導(dǎo)師都給予了我莫大的幫助。導(dǎo)師高尚的人格、專注務(wù)實的精神、兢兢業(yè)業(yè)的作風(fēng)、治學(xué)嚴謹?shù)膽B(tài)度、淵源廣博的學(xué)識等等都深深地影響著我,教育著我,使我受益匪淺。在我今后的工作和學(xué)習(xí)中,這些品質(zhì)和精神將不斷鞭策與激勵我,使我奮發(fā)向前。值此論文完成之際,謹向徐老師致以誠摯的感謝和崇高的敬意!其次,特別感謝朱軍教授,朱老師在數(shù)量遺傳和生物統(tǒng)計領(lǐng)域?qū)η把刂R的把握,極大的拓展了我的學(xué)科
5、視野和研究思路。此外,感謝樊龍江教授和葉楚玉老師在生物信息學(xué)領(lǐng)域內(nèi)給予我的指導(dǎo)與幫助,適時地解決了我遇到的科研瓶頸。本研究還得到了阿拉巴馬大學(xué)伯明翰分校的樓向陽老師和中國水稻研究所曹立勇等多位老師的幫助,特此感謝。再則,感謝徐飛、張福濤、童曉然、魏恒玲、梁媚媚、余世洲、王繼變、周莉媛、祁婷等師兄師姐在我學(xué)習(xí)上的指導(dǎo);感謝同一年進入實驗室生活、學(xué)習(xí)的孔祥東、段忠取和孫喜偉,謝謝與我風(fēng)雨兼程,共同面對科研和生活中的困難;感謝曹玉杰、丁藝、蔣玨、候挺挺、潘兵、劉守業(yè)等師弟師妹在畢業(yè)季給予我的理解和幫助;感謝樊老
6、師的各位博士生和碩士生們對我工作的肯定和支持。非常榮幸能在數(shù)量遺傳與生物信息學(xué)大家庭中學(xué)習(xí)和生活,愿大家都有好前程!最后,感謝我的家人和朋友在物質(zhì)和精神上給予我全力的支持和幫助,謝謝你們?nèi)绱藧凼Y蓓蓓年月浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文摘要摘要隨著全基因組測序技術(shù)的發(fā)展,可供研究利用的信息越來越多,這為采用全基因組關(guān)聯(lián)分析)方法揭示復(fù)雜性狀的遺傳機理提供了可能。然而,目前的研究所采用的遺傳模型往往忽略了上位性效應(yīng)(基因與基因互作)及基因與環(huán)境互作效應(yīng)。造成此種情況的原因:一方面可能是沒有合適的統(tǒng)計方法去檢測上位性及基因
7、與環(huán)境互作,另一方面可能是全基因組基因與基因二維(互作)掃描的計算壓力太大,耗時太長。本研究采用基于的廣義多因子降維法)與混合性線性模型相結(jié)合的研究策略,探究玉米群體穂部重要性狀(穗長、穗粗、穗行數(shù))和水稻重組自交系)群體品質(zhì)性狀(直鏈淀粉含量、糊化溫度、膠稠度)的遺傳結(jié)構(gòu)。在玉米穂部性狀的研究中,檢測到個加性效應(yīng)、上位性效應(yīng)或基因與環(huán)境互作效應(yīng)顯著的標記,這些標記能解釋較大比例的表型變異。研究發(fā)現(xiàn)穗長、穗粗和穗行數(shù)的加性效應(yīng)和加性與環(huán)境互作效應(yīng)的遺傳率解釋了大部分的表型變異。其中,加性與環(huán)境互作效應(yīng)的遺
8、傳率占總遺傳率的比例更大,說明這三個性狀受環(huán)境影響較大。此外,本研究證實了一些沒有或只具有較小加性效應(yīng)的目標可通過與基因上位性或與環(huán)境的互作來影響性狀的表達。在進行水稻群體品質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)分析之前,我們利用蒙特卡洛摸擬方法研究了遺傳模型和統(tǒng)計方法的可靠性、有效性。摸擬結(jié)果證實其可行且高效。同時,模擬結(jié)果還表明包含個個體左右的群體適合用來進行全基因組關(guān)聯(lián)分析研究。之后,我們利用重測序獲得的個標記與個來自水稻群體(該群體構(gòu)建自超級稻品