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《兩種水稻螟蟲(chóng)線粒體全基因組序列分析》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫(kù)。
1、、??一??爭(zhēng)-?gr.'?£r.;..%ij心>沒(méi).7麻牌誠(chéng)繁豕;^|重麗;圃陋?長(zhǎng)妻續(xù)擊學(xué)位冷權(quán)胃?―'.—乃‘‘4^於U著:細(xì)細(xì)則線祕(mì)全細(xì)酪…‘、。V?wèi)簦墸簹馕模墸唬牐郑崳?、、:'曹爽爽一.i於私;若>:l:i?hù)^jif'-一"—巧導(dǎo)教師巧墓盧-/:化豐州教授,揚(yáng)州大學(xué),江蘇揚(yáng)州,^250巧./iSi;植物保批申請(qǐng)學(xué)化級(jí)別i碩擊學(xué)科專(zhuān)業(yè)名稱(chēng).,論文提交日期:2015年5月論文答辯日期:2015年5月24曰\寶:.^堿、學(xué)位授予單位日期:、;揚(yáng)州大學(xué)學(xué)位授予或一.
2、.?.答辯委員會(huì)主席:陳學(xué)新教授浙江大學(xué)策-三分廬—y義爭(zhēng)':,C-':-.V乃於唉盧.分奏來(lái)>苦芝3^幾.、%皆、節(jié)/成.苗其心去戶(hù)之;:;巧對(duì)氣處;3篆就《y纖麵聲滅氣1ANALYISISOFTWOCOMPLETEMITOCHONDRIALGENOMEOFRICESTEMBORERSBYCAO-ShuanShuanggADISSERTATIONSUBMITTEDINPARTALFULFILMENTOFTHEREQUIREMENTSFORTHEDEGREEOFMAS
3、TERWITHMAJORINPLANTPROTECTIONADVISOR-;PROFESSORP圧DDUYuZhou()YANGZHOUUNIVESITYYANGZHOU,JIANGSU,CHINAMAY,20153本研究受?chē)?guó)家重點(diǎn)基堿研究發(fā)展規(guī)劃(973計(jì)劃)資助2012CB114100和2013CB127604-4)。(ThisworkissuortedbtheNationalBasicResearchppyProgram(973Program)ofChina(2
4、012CB114100and2013CB127604-4.)I病要.大頓(泌說(shuō)於?ms)、二化換(CTi'to琴戶(hù)M幻化)、蘭化頓(乃7/70叩之幻加ce燈w/as)’和臺(tái)灣稻喚(CMoflwZc加W)是眾所周知的鱗翅目喚蛾總科水稻害蟲(chóng),廣泛分布于中國(guó)主要一。、水稻種植區(qū)的重要害蟲(chóng)近年來(lái),由于氣候水稻品種W及種植制度的變化,在些地區(qū)為害日趨嚴(yán)重。本文對(duì)H化螺和臺(tái)灣稻螺線粒體全基因組進(jìn)行測(cè)序及序列特征分析,并比較分析了4種水稻鉆化性害蟲(chóng)的線粒體全基因組的異同。同時(shí)8種,比較分析了換蛾總科昆蟲(chóng)線粒體基因狙的特征。主要研究結(jié)果
5、如下;1.水稻H化嗔線粒體全基因組為15,223bp,包含巧個(gè)典型的線粒體基因(13個(gè)蛋白一質(zhì)編碼基因、22個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)RNA基因和2個(gè)核糖體RNA基因)和個(gè)大的非編碼區(qū)(又稱(chēng)控制區(qū))。除了COX/WCGA為起始密碼子,其余12個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因均WATN作為起始密碼子,除了妨WTAG為終止密碼子,其余WTAA、TA和T作為終止密碼子。22個(gè)tRNA基因都能形成典型的H葉草結(jié)構(gòu),只有托n庇心GW基因缺失DHU臂。16S的)二級(jí)結(jié)構(gòu)包含五個(gè)部分(標(biāo)記為I,II,IV,V和VI)共49個(gè)環(huán)型結(jié)構(gòu)缺失區(qū)域III,12S由3個(gè)結(jié)構(gòu)域組成
6、共33個(gè)環(huán)型結(jié)構(gòu)。此外,H化換線粒體基因組的控制區(qū)中有2個(gè)|i|'2TATA-1。莖環(huán)結(jié)構(gòu),個(gè)微衛(wèi)星,1T結(jié)構(gòu)和4個(gè)9b()i2和()9個(gè)p〇的重復(fù)單元?。穑玻_(tái)灣稻頓的全長(zhǎng)為5367b371,個(gè)編碼基因的相對(duì)位置及轉(zhuǎn)錄方向與H化暢的順序,p^^th一致^AGO,tRNA基因的二級(jí)結(jié)構(gòu)中缺失DHU臂,其余tRNA基因的二級(jí)結(jié)構(gòu)均為典型的H葉草結(jié)構(gòu),2個(gè)核糖體RNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)均和其它麟翅目昆蟲(chóng)的相似。此外,控制區(qū)中有五個(gè)結(jié)構(gòu)域一一,包含個(gè)12bp重復(fù)單元和個(gè)27bp的重復(fù)單元,兩個(gè)TA微衛(wèi)星結(jié)構(gòu)()n一和個(gè)poyT結(jié)構(gòu)。^一"
7、3.草膜科昆蟲(chóng)有個(gè)叮nATnG序列的保守區(qū)位于加7和coxi基因之間的間隔區(qū)""一""一INGS2區(qū)域的序列為TAG。段保守的序列ATACTAAA,大贖這草換科屋蟲(chóng)中存在位于拍(f/CiV)和nfl說(shuō)間的間隔區(qū)IN說(shuō)4。此外,控制區(qū)中有五個(gè)重復(fù)單元,兩個(gè)TAT一TAol,而二化螺中卻微衛(wèi)星結(jié)構(gòu)和p結(jié)構(gòu),但大換中只有個(gè)微衛(wèi)星結(jié)構(gòu)()?y()?沒(méi)有一,大喚形成個(gè)莖環(huán)結(jié)構(gòu),但二化頓和臺(tái)灣稻換中卻沒(méi)有。除了米頓和稻縱卷葉懼,其它換蛾總科昆蟲(chóng)線粒體基因組中堿基A的含量高于T,,異亮氨酸,天冬酌胺亮氨酸和苯丙氨酸是四種昆蟲(chóng)中普遍存在的氨基酸,都
8、使用雙重簡(jiǎn)并密碼子。位于化和na泌之間的間隔區(qū)I