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《兩種水稻螟蟲線粒體全基因組序列分析》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
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2、.?.答辯委員會主席:陳學(xué)新教授浙江大學(xué)策-三分廬—y義爭':,C-':-.V乃於唉盧.分奏來>苦芝3^幾.、%皆、節(jié)/成.苗其心去戶之;:;巧對氣處;3篆就《y纖麵聲滅氣1ANALYISISOFTWOCOMPLETEMITOCHONDRIALGENOMEOFRICESTEMBORERSBYCAO-ShuanShuanggADISSERTATIONSUBMITTEDINPARTALFULFILMENTOFTHEREQUIREMENTSFORTHEDEGREEOFMAS
3、TERWITHMAJORINPLANTPROTECTIONADVISOR-;PROFESSORP圧DDUYuZhou()YANGZHOUUNIVESITYYANGZHOU,JIANGSU,CHINAMAY,20153本研究受國家重點基堿研究發(fā)展規(guī)劃(973計劃)資助2012CB114100和2013CB127604-4)。(ThisworkissuortedbtheNationalBasicResearchppyProgram(973Program)ofChina(2
4、012CB114100and2013CB127604-4.)I病要.大頓(泌說於?ms)、二化換(CTi'to琴戶M幻化)、蘭化頓(乃7/70叩之幻加ce燈w/as)’和臺灣稻喚(CMoflwZc加W)是眾所周知的鱗翅目喚蛾總科水稻害蟲,廣泛分布于中國主要一。、水稻種植區(qū)的重要害蟲近年來,由于氣候水稻品種W及種植制度的變化,在些地區(qū)為害日趨嚴重。本文對H化螺和臺灣稻螺線粒體全基因組進行測序及序列特征分析,并比較分析了4種水稻鉆化性害蟲的線粒體全基因組的異同。同時8種,比較分析了換蛾總科昆蟲線粒體基因狙的特征。主要研究結(jié)果
5、如下;1.水稻H化嗔線粒體全基因組為15,223bp,包含巧個典型的線粒體基因(13個蛋白一質(zhì)編碼基因、22個轉(zhuǎn)運RNA基因和2個核糖體RNA基因)和個大的非編碼區(qū)(又稱控制區(qū))。除了COX/WCGA為起始密碼子,其余12個蛋白質(zhì)編碼基因均WATN作為起始密碼子,除了妨WTAG為終止密碼子,其余WTAA、TA和T作為終止密碼子。22個tRNA基因都能形成典型的H葉草結(jié)構(gòu),只有托n庇心GW基因缺失DHU臂。16S的)二級結(jié)構(gòu)包含五個部分(標記為I,II,IV,V和VI)共49個環(huán)型結(jié)構(gòu)缺失區(qū)域III,12S由3個結(jié)構(gòu)域組成
6、共33個環(huán)型結(jié)構(gòu)。此外,H化換線粒體基因組的控制區(qū)中有2個|i|'2TATA-1。莖環(huán)結(jié)構(gòu),個微衛(wèi)星,1T結(jié)構(gòu)和4個9b()i2和()9個p〇的重復(fù)單元!yp2.臺灣稻頓的全長為5367b371,個編碼基因的相對位置及轉(zhuǎn)錄方向與H化暢的順序,p^^th一致^AGO,tRNA基因的二級結(jié)構(gòu)中缺失DHU臂,其余tRNA基因的二級結(jié)構(gòu)均為典型的H葉草結(jié)構(gòu),2個核糖體RNA的二級結(jié)構(gòu)均和其它麟翅目昆蟲的相似。此外,控制區(qū)中有五個結(jié)構(gòu)域一一,包含個12bp重復(fù)單元和個27bp的重復(fù)單元,兩個TA微衛(wèi)星結(jié)構(gòu)()n一和個poyT結(jié)構(gòu)。^一"
7、3.草膜科昆蟲有個叮nATnG序列的保守區(qū)位于加7和coxi基因之間的間隔區(qū)""一""一INGS2區(qū)域的序列為TAG。段保守的序列ATACTAAA,大贖這草換科屋蟲中存在位于拍(f/CiV)和nfl說間的間隔區(qū)IN說4。此外,控制區(qū)中有五個重復(fù)單元,兩個TAT一TAol,而二化螺中卻微衛(wèi)星結(jié)構(gòu)和p結(jié)構(gòu),但大換中只有個微衛(wèi)星結(jié)構(gòu)()?y()?沒有一,大喚形成個莖環(huán)結(jié)構(gòu),但二化頓和臺灣稻換中卻沒有。除了米頓和稻縱卷葉懼,其它換蛾總科昆蟲線粒體基因組中堿基A的含量高于T,,異亮氨酸,天冬酌胺亮氨酸和苯丙氨酸是四種昆蟲中普遍存在的氨基酸,都
8、使用雙重簡并密碼子。位于化和na泌之間的間隔區(qū)I