SSR分子標(biāo)記在水稻品種鑒定和遺傳育種中的應(yīng)用

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1、SSR分子標(biāo)記在水稻品種鑒定和遺傳育種中的應(yīng)用摘要我國(guó)最早的引入分子標(biāo)記技術(shù)是在20世紀(jì)的80年代,經(jīng)過(guò)近幾十年的不斷發(fā)展,分子標(biāo)記法也取得了較快進(jìn)步,不僅應(yīng)用領(lǐng)域在不斷拓展,應(yīng)用成果也非常顯著。作為世界上最重要糧食作物之一的水稻,對(duì)于人類的生存與發(fā)展起到了十分關(guān)鍵性的作用,而如何更好的運(yùn)用生物技術(shù)全面提高水稻畝產(chǎn)量,提升水稻品質(zhì)己經(jīng)成為了國(guó)際社會(huì)共同關(guān)注的焦點(diǎn)話題。經(jīng)過(guò)多年的技術(shù)研究和發(fā)展,遺傳標(biāo)記在識(shí)別生物群體的多態(tài)性的過(guò)程中逐漸充當(dāng)著重要的角色,通過(guò)形態(tài)標(biāo)記可以對(duì)生物的形態(tài)差異進(jìn)行比較,分子標(biāo)記直接檢測(cè)出生物DNA分子結(jié)構(gòu)上的變化,進(jìn)而更好的將好的品種和遺傳特性保留下來(lái)。

2、在這種情況下,對(duì)于SSR分子標(biāo)記在水稻品種鑒定和遺傳育種中的應(yīng)用進(jìn)行分析和研究具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。關(guān)鍵詞SSR分子標(biāo)記;水稻;品種鑒定;遺傳育種;應(yīng)用中圖分類號(hào):S336文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A文章編號(hào):1671-7597(2014)17-0071-02在水稻品種鑒定和遺傳育種以及水稻的遺傳作圖中,SSR分子標(biāo)記一直都充當(dāng)著重要的角色。以往的育種主要依賴的是植株的表現(xiàn)型進(jìn)行品種的鑒定和選擇的,這對(duì)于育種者的經(jīng)驗(yàn)具有很高的要求,而且需要進(jìn)行多次技術(shù)測(cè)定,不僅耗時(shí)而且費(fèi)力,因此需要在此基礎(chǔ)上去尋求更好更加準(zhǔn)確的標(biāo)記方式,以此來(lái)提高項(xiàng)目育種的質(zhì)量和效率。而自從SSR分子標(biāo)記的出現(xiàn)和發(fā)展,對(duì)于水

3、稻育種工作和品種的鑒定具有重要的促進(jìn)作用。和普通的標(biāo)記方法相比,SSR標(biāo)記是不受到周圍的環(huán)境條件以及相關(guān)的因素影響的,因此具有很好的發(fā)展前景。本文也將從SSR標(biāo)記的基本原理出發(fā),對(duì)于SSR分子標(biāo)記在水稻品種鑒定和遺傳育種中的應(yīng)用進(jìn)行了分析和論述,希望給讀者一定的啟/JiO1SSR標(biāo)記的基本原理分析無(wú)論是水稻還是其他的生物作物都是由特定的基因組組成的,但是由于每一個(gè)SSR序列的存在單元存在一定的差異性,因此基因的座位也存在多態(tài)性。而SSR標(biāo)記的關(guān)鍵環(huán)節(jié)就是要對(duì)于SSR座位兩側(cè)的核昔酸進(jìn)行全面的了解和分析,并且對(duì)其基本結(jié)構(gòu)序列形成特定的特異保護(hù)⑴。SSR標(biāo)記主要包括以下幾個(gè)過(guò)程:一

4、是要建立專門的DNA文庫(kù)和數(shù)據(jù)資源庫(kù);二是要進(jìn)一步篩選鑒定微衛(wèi)星DNA克??;三是完成基本的序列測(cè)定和標(biāo)記??偟恼f(shuō)來(lái),SSR的操作程序就是指DNA的提取、微衛(wèi)星DNA的擴(kuò)增以及電泳處理。在這個(gè)過(guò)程中,還可以通過(guò)在已有的DNA數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行SSR序列的搜索,然后再根據(jù)搜索的結(jié)果,通過(guò)一對(duì)特異性引物來(lái)進(jìn)一步設(shè)計(jì)和擴(kuò)增已有的SSR序列。在完成了設(shè)計(jì)和擴(kuò)增SSR序列之后,在經(jīng)過(guò)一系列的染色處理和電泳處理,那個(gè)根據(jù)相應(yīng)的處理結(jié)果進(jìn)行分析,比如根據(jù)相對(duì)遷移距離可以分析出SSR座位的多態(tài)性。2SSR分子標(biāo)記在水稻品種鑒定中的應(yīng)用SSR分子標(biāo)記是一種在水稻分子多態(tài)性的基礎(chǔ)上進(jìn)行的一種具有遺傳特點(diǎn)和

5、性質(zhì)的標(biāo)記,它可以直接的將分子內(nèi)部DNA的差異性進(jìn)行反映和分析。和普通的遺傳標(biāo)記方法相比,SSR分子標(biāo)記不僅不會(huì)受到水稻發(fā)育階段和發(fā)育環(huán)境限制,而且多態(tài)性水平高的特性也直接增強(qiáng)了標(biāo)記的效果,有利于優(yōu)良品種的鑒定分析。因此SSR標(biāo)記在水稻品種鑒定中具有極高的應(yīng)用價(jià)值⑵。早在幾年前,國(guó)內(nèi)就有了關(guān)于SSR分子標(biāo)記在水稻品種鑒定中應(yīng)用的綜述和研究,但是由于早期工作的開(kāi)展具有一定的局限性,相關(guān)的有關(guān)水稻品種數(shù)據(jù)庫(kù)的建立工作還沒(méi)有得到充分的重視和開(kāi)展。從2006年開(kāi)始,相關(guān)的水稻品種的鑒別工作和SSR標(biāo)記指紋圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)建立工作開(kāi)始陸續(xù)開(kāi)展,并取得了非常重要的研究成果。比如在2010年,馬紅

6、勃等就對(duì)于福建省的相關(guān)種類的水稻品種進(jìn)行了研究,并對(duì)于這些水稻的遺傳多樣性進(jìn)行了分析,最后42份材料X12個(gè)SSR標(biāo)記的DNA指紋圖譜,這為今后水稻品種的鑒定和純度的檢測(cè)提供了強(qiáng)有力的依據(jù),非常有利于水稻遺傳育種工作的開(kāi)展[3]。與此同時(shí),國(guó)家對(duì)于水稻的DNA分子標(biāo)記鑒定技術(shù)的發(fā)展也是非常重視的,截至2013年,我國(guó)已經(jīng)完成了對(duì)于900份的水稻品種的DNA指紋圖譜的數(shù)據(jù)采集工作,這不僅對(duì)于水稻新品種的開(kāi)發(fā)和遺傳育種具有重要意義,同時(shí)也是進(jìn)行水稻品種鑒定的重要依據(jù)。而就目前SSR分子標(biāo)記在水稻品種鑒定中應(yīng)用的現(xiàn)狀來(lái)看,目前還有很多需要進(jìn)行不斷研究和技術(shù)創(chuàng)新的新方向,比如對(duì)于快速提

7、取DNA的方法的進(jìn)一步研究探討、PCR擴(kuò)增程序和反應(yīng)體系的進(jìn)一步優(yōu)化以及擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)方法的改進(jìn)等等。3SSR標(biāo)記在水稻遺傳育種中的應(yīng)用3.1構(gòu)建水稻遺傳連鎖圖譜SSR標(biāo)記一個(gè)重要的目的就在于水稻遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建,遺傳圖譜的構(gòu)建可以對(duì)于水稻品種的基因結(jié)構(gòu)、進(jìn)化進(jìn)程以及基本性狀等提供依據(jù),利于對(duì)于品種的進(jìn)一步鑒定分析和遺傳育種工作的開(kāi)展。從標(biāo)記的性質(zhì)來(lái)看,SSR標(biāo)記屬于一種共顯性的標(biāo)記,它是遺傳作圖的重要基礎(chǔ)⑷。和RFLP標(biāo)記相比,SSR分子標(biāo)記具有很好的多態(tài)性的頻率,這對(duì)于建立連鎖圖譜是非常

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