SSR分子標記在水稻品種鑒定和遺傳育種中的應用

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1、SSR分子標記在水稻品種鑒定和遺傳育種中的應用摘要我國最早的引入分子標記技術是在20世紀的80年代，經(jīng)過近幾十年的不斷發(fā)展，分子標記法也取得了較快進步，不僅應用領域在不斷拓展，應用成果也非常顯著。作為世界上最重要糧食作物之一的水稻，對于人類的生存與發(fā)展起到了十分關鍵性的作用，而如何更好的運用生物技術全面提高水稻畝產(chǎn)量，提升水稻品質己經(jīng)成為了國際社會共同關注的焦點話題。經(jīng)過多年的技術研究和發(fā)展，遺傳標記在識別生物群體的多態(tài)性的過程中逐漸充當著重要的角色,通過形態(tài)標記可以對生物的形態(tài)差異進行比較，分子標記直接檢測出生物DNA分子結構上的變化，進而更好的將好的品種和遺傳特性保留下來。

2、在這種情況下，對于SSR分子標記在水稻品種鑒定和遺傳育種中的應用進行分析和研究具有重要的現(xiàn)實意義。關鍵詞SSR分子標記；水稻；品種鑒定；遺傳育種；應用中圖分類號：S336文獻標識碼：A文章編號：1671-7597(2014)17-0071-02在水稻品種鑒定和遺傳育種以及水稻的遺傳作圖中，SSR分子標記一直都充當著重要的角色。以往的育種主要依賴的是植株的表現(xiàn)型進行品種的鑒定和選擇的，這對于育種者的經(jīng)驗具有很高的要求，而且需要進行多次技術測定，不僅耗時而且費力，因此需要在此基礎上去尋求更好更加準確的標記方式，以此來提高項目育種的質量和效率。而自從SSR分子標記的出現(xiàn)和發(fā)展，對于水

3、稻育種工作和品種的鑒定具有重要的促進作用。和普通的標記方法相比，SSR標記是不受到周圍的環(huán)境條件以及相關的因素影響的，因此具有很好的發(fā)展前景。本文也將從SSR標記的基本原理出發(fā)，對于SSR分子標記在水稻品種鑒定和遺傳育種中的應用進行了分析和論述，希望給讀者一定的啟/JiO1SSR標記的基本原理分析無論是水稻還是其他的生物作物都是由特定的基因組組成的，但是由于每一個SSR序列的存在單元存在一定的差異性，因此基因的座位也存在多態(tài)性。而SSR標記的關鍵環(huán)節(jié)就是要對于SSR座位兩側的核昔酸進行全面的了解和分析，并且對其基本結構序列形成特定的特異保護⑴。SSR標記主要包括以下幾個過程：一

4、是要建立專門的DNA文庫和數(shù)據(jù)資源庫；二是要進一步篩選鑒定微衛(wèi)星DNA克?。蝗峭瓿苫镜男蛄袦y定和標記。總的說來，SSR的操作程序就是指DNA的提取、微衛(wèi)星DNA的擴增以及電泳處理。在這個過程中，還可以通過在已有的DNA數(shù)據(jù)庫中進行SSR序列的搜索，然后再根據(jù)搜索的結果，通過一對特異性引物來進一步設計和擴增已有的SSR序列。在完成了設計和擴增SSR序列之后，在經(jīng)過一系列的染色處理和電泳處理，那個根據(jù)相應的處理結果進行分析，比如根據(jù)相對遷移距離可以分析出SSR座位的多態(tài)性。2SSR分子標記在水稻品種鑒定中的應用SSR分子標記是一種在水稻分子多態(tài)性的基礎上進行的一種具有遺傳特點和

5、性質的標記，它可以直接的將分子內部DNA的差異性進行反映和分析。和普通的遺傳標記方法相比，SSR分子標記不僅不會受到水稻發(fā)育階段和發(fā)育環(huán)境限制，而且多態(tài)性水平高的特性也直接增強了標記的效果，有利于優(yōu)良品種的鑒定分析。因此SSR標記在水稻品種鑒定中具有極高的應用價值⑵。早在幾年前，國內就有了關于SSR分子標記在水稻品種鑒定中應用的綜述和研究，但是由于早期工作的開展具有一定的局限性，相關的有關水稻品種數(shù)據(jù)庫的建立工作還沒有得到充分的重視和開展。從2006年開始，相關的水稻品種的鑒別工作和SSR標記指紋圖譜數(shù)據(jù)庫建立工作開始陸續(xù)開展，并取得了非常重要的研究成果。比如在2010年，馬紅

6、勃等就對于福建省的相關種類的水稻品種進行了研究，并對于這些水稻的遺傳多樣性進行了分析，最后42份材料X12個SSR標記的DNA指紋圖譜，這為今后水稻品種的鑒定和純度的檢測提供了強有力的依據(jù)，非常有利于水稻遺傳育種工作的開展［3］。與此同時，國家對于水稻的DNA分子標記鑒定技術的發(fā)展也是非常重視的，截至2013年，我國已經(jīng)完成了對于900份的水稻品種的DNA指紋圖譜的數(shù)據(jù)采集工作，這不僅對于水稻新品種的開發(fā)和遺傳育種具有重要意義，同時也是進行水稻品種鑒定的重要依據(jù)。而就目前SSR分子標記在水稻品種鑒定中應用的現(xiàn)狀來看，目前還有很多需要進行不斷研究和技術創(chuàng)新的新方向，比如對于快速提

7、取DNA的方法的進一步研究探討、PCR擴增程序和反應體系的進一步優(yōu)化以及擴增產(chǎn)物檢測方法的改進等等。3SSR標記在水稻遺傳育種中的應用3.1構建水稻遺傳連鎖圖譜SSR標記一個重要的目的就在于水稻遺傳連鎖圖譜的構建，遺傳圖譜的構建可以對于水稻品種的基因結構、進化進程以及基本性狀等提供依據(jù)，利于對于品種的進一步鑒定分析和遺傳育種工作的開展。從標記的性質來看，SSR標記屬于一種共顯性的標記，它是遺傳作圖的重要基礎⑷。和RFLP標記相比，SSR分子標記具有很好的多態(tài)性的頻率，這對于建立連鎖圖譜是非常