黃瓜(Cucumis sativus L.)果瘤基因Tu的精細(xì)定位-論文.pdf

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1、第32卷第3期上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)科學(xué)版)Vo1.32No.32014年6月JOURNALOFSHANGHAIJIAOTONGUNIVERSITY(AGRICULTURALSCIENCE)Jun.2O14文章編號:1671~9964(2014)030069—06DOI:10.3969/J.ISSN.1671—9964.2014.03.011黃瓜,Z·SSZ·SL.)果瘤基因Tu的精細(xì)定位楊緒勤●張微微,任國良,何歡樂,潘俊松,蔡潤(1.上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院,上海200240;2.中國科學(xué)院辰山植物園上海辰山植物研究

2、中心,上海201602)摘要:黃瓜果實(shí)果瘤性狀是非常重要的農(nóng)藝性狀,以黃瓜(CucumissativusL.)華北有瘤品系$52(P)和歐洲無瘤品系S06(P2)為親本,構(gòu)建826株F2(S06×$52)群體為試驗(yàn)材料,對黃瓜果瘤基因進(jìn)行精細(xì)定位研究。田間調(diào)查和遺傳分析發(fā)現(xiàn)F。群體的果實(shí)表現(xiàn)型為有果瘤與無果瘤,卡~-dt(x:0.583~3.84)檢驗(yàn)表明其分離比符合3:1,表明黃瓜果瘤性狀是單基因控制的顯性性狀。早期研究中基因被初步位于第5染色體的標(biāo)記SSR16203和CSC933之間,本研究利用公布的黃瓜基因組序列在這

3、兩標(biāo)記之間設(shè)計(jì)了100對SSR引物,通過分析在兩親本的多態(tài)性,最后篩選得到4對SSR多態(tài)性標(biāo)記。然后利用SSR16203和C—SC933標(biāo)記和這4個(gè)多態(tài)性引物對826株F群體進(jìn)行進(jìn)一步交換單株分析,最后將基因定位于兩翼標(biāo)記SSR7和SSR18之間,剩余的交換單株分別為11株、16株,物理距離為263kb。經(jīng)過FGENESH基因預(yù)測軟件(http://www.softberry.corn)分析,該區(qū)間僅含有候選基因31個(gè)。本研究為進(jìn)一步果瘤基因的最后克隆提供良好的研究基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞:黃瓜;果瘤基因;精細(xì)定位;SSR標(biāo)記中圖分類

4、號:$642.2文獻(xiàn)標(biāo)識碼:AFineMappingoftheWartyFruitGeneTuinOucumber(CucumissativusL.)YANGXu—qin,ZHANGWei—wei,RENGuo—liang,HEHuan—le,PANJun—song,CAIRun(1.SchoolofAgricultureandBiology,ShanghaiJiaotongUniversity,Shanghai200240,China~2.ShanghaiChenshanPlantScienceResearchCente

5、r,ChineseAcademyofSciences/ChenshanBotanica1Garden,Shanghai201602,China)Abstract:WartyfruittraitiSoneofthemostimportantexternalqualitytraitsincucumberthatisrelatedtothemarketvalueofthiscrop.AF2populationincluding826individualswerederivedfromthecrossingofwartyfruit

6、line$52(P1)fromnorthern-Chinaandnon-wartyfruitlineS06(P2)fromEurope.TheF2populationwereusedasmaterialstofinemappingofwartyfruitgeneTuincucumber.WefoundthatthisF2populationcouldbedividedintotwotypes,i.e.,wartyfruitandno—wartyfruitbyfieldinvestigation.value(Y一0.583~

7、3.84)oftheF2populationwasconsistentwitharatioof3wartyfruits:1smoothfruit,whichshowedonesingledominantgenecontrolsthewartyfruittrait.Inpreviousreport,theTugenewaspreliminarilymappedbetweentheCO—dominantSSRmarkerSSR16203andtheSCARmarkerCSC933on—收稿Et期:2013—01—13基金項(xiàng)目:

8、國家“973”課題(2012CBl13900);國家自然科學(xué)基金(31271291)作者簡介:楊緒勤(1988一),男,博士生,研究方向:作物遺傳育種,E-mail:xuqin800715@163.corn;蔡潤(1955一)為本文通訊作者,男,教授,博士生導(dǎo)師,研究方向:植物分子遺傳,E-mail:c

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