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《dna ladder及提取》由會員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、DNALadder是一種即用型(readyforuse)DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)(DNAMolecularWeightMarker)。包含了1KbDNALadder和100bpDNAladder,可以滿足各種常規(guī)DNA電泳分析的分子量參照需要。本DNAladder相當(dāng)于Invitrogen等公司的1KbplusDNAladder,但比Invitrogen公司的1KbplusDNAladder的條帶分布更加均勻細(xì)致,便于對照DNA分子量。DNAladder中500bp、1000bp和3000bp條帶用黑體標(biāo)記(參見右圖),亮度較高,使辨別條帶更加容易。具體每條帶的DNA的含量
2、可以參考右圖進(jìn)行計算。本DNAladder中已添加了含有溴酚藍(lán)的DNA上樣緩沖液,可以直接使用。每孔上樣5微升,即可觀察到非常清楚的DNA條帶(參見右圖)。DNAladder法檢測細(xì)胞凋亡發(fā)生細(xì)胞凋亡時,內(nèi)源性核酸酶被激活,染色體DNA鏈在核小體之間被切割,形成180~200個堿基或其整數(shù)倍的DNA片段,將這些DNA片段抽提出來進(jìn)行電泳,可得到DNA梯狀條帶(DNAladder)。【材料與試劑】凋亡細(xì)胞;蛋白酶K(500μg/ml)8mol/L醋酸鉀白細(xì)胞裂解液:pH8.0,10mmol/LTris-HCl,10mmol/LNaCl,10mmol/LEDTA,1%S
3、DS。氯仿無水乙醇,70%乙醇;2%瓊脂糖凝膠。【操作步驟】(1)收集凋亡細(xì)胞:取1~2×106個細(xì)胞,離心后,立即用70%酒精(-20℃)固定2h;(2)洗滌:取出酒精固定的細(xì)胞,1000r/min離心5min,去掉上清液,PBS洗二次;(3)裂解細(xì)胞:加400μl細(xì)胞裂解液,充分混勻再加蛋白酶K100μl,置65℃水浴消化2小時或過夜;(4)蛋白處理:加75μl8mol/L的醋酸鉀,4℃15min,再加750μl氯仿,充分混勻后,10000r/min離心10分鐘后,將上清移至一新的Eppendorf管中;(5)沉淀DNA:加入750μl無水乙醇,上下輕柔顛倒混合
4、,即可見乳白色沉淀,若不明顯時可置-20℃過夜,12000r/min離心10分鐘,去上清;(6)洗滌DNA:加1ml70%乙醇,混勻,10000r/min離心5min,去上清;(7)溶解DNA:根據(jù)DAN沉淀的大小,加一定量的蒸餾水或TE,37℃溶解;(8)測定DNA濃度;(9)2%瓊脂糖凝膠電泳80V2小時;【結(jié)果判斷】出現(xiàn)梯狀電泳條帶,最小的條帶為180~200bp,其他的條帶為其整倍數(shù)大小。壞死細(xì)胞則出現(xiàn)彌散的電泳條帶,無清晰可見的條帶。正常細(xì)胞DNA基因條帶因分子量大,遷移距離短,故停留在加樣孔附近。細(xì)胞凋亡DNALadder檢測試劑盒細(xì)胞凋亡DNALadd
5、er檢測試劑盒一、原理細(xì)胞核染色質(zhì)DNA斷裂是細(xì)胞凋亡的標(biāo)志特征。在細(xì)胞發(fā)生凋亡時,核酸內(nèi)切酶被激活,選擇性降解染色質(zhì)DNA,形成50-300kb的大片段,并進(jìn)而在核小體連接處斷裂,形成180-200bp或其整倍數(shù)的DNA片段,這些DNA片段可從細(xì)胞中提取出來,通過瓊脂糖凝膠電泳,溴化乙啶染色呈現(xiàn)為梯狀條帶(DNALadder),并據(jù)此判斷細(xì)胞凋亡產(chǎn)生。細(xì)胞凋亡DNALadder檢測試劑盒提供了一種簡便、快速地提取染色質(zhì)DNA的方法,并增加對小片段DNA的回收,從而增強(qiáng)了檢測的敏感性。二、試劑盒組份組份KGA111(20assays)KGA112(50assays)
6、KGA113(100assays)LysisBuffer6mL15mL25mLSolutionA400μL1.0mL2.0mLEnzymeA400μL1.0mL2.0mLEnzymeB400μL1.0mL2.0mLPrecipitant3.0mL6.5mL13.0mLLoadingBuffer80μL0.2mL0.4mL三、操作步驟1.離心收集105~106細(xì)胞(1500×g,5min)于1.5mL微量離心管中;2.用PBS洗滌細(xì)胞二次(離心1500×g,5min),棄上清;3.沉淀的細(xì)胞中加入100μLLysisBuffer,渦旋振蕩器上劇烈混合10秒,離心100
7、0×g,5min)移上清于另一1.5mL微量離心管中;4.沉淀再加入100μLLysisBuffer重復(fù)上步,合并兩次的上清液;5.在上述合并的上清液中加入20μLSolutionA,再加入20μLEnzymeA,55℃反應(yīng)1小時;6.加入20μLEnzymeB,37℃,1小時;7.加入130μLPrecipitant和950μL冷乙醇,混勻,置—20℃,1小時以上或過夜;8.4℃,12,000-14,000rpm離心15-30min,小心地棄去上清,收集沉淀的DNA;9.加入0.5mL70%的冷乙醇,洗DNA沉淀,再12,000-14,000rpm離心20mi