手把手教你使用imagepro-plus(12.免疫組化圖片光密度測量

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1、自從寫了imageproplus教學(xué)系列帖子“手把手教你使用IPP”以來，得到了不少好評。前兩天這個帖子又被人翻了出來，發(fā)現(xiàn)它的點(diǎn)擊已經(jīng)升到了一萬二?？梢娺@個帖子還是有許多人看的。甚至把MediaCybnetics公司的工程師給招來了。他們才是真正的IPP高手，給了我很多指導(dǎo)，也教了我許多妙招。無論是經(jīng)常使用IPP還是第一次使用，如果需要分析測量一大批圖片的話，都免不了要花費(fèi)大量時間。為了省時省力，最好是制作一個宏操作來完成那些枯燥的一下下點(diǎn)鼠標(biāo)動作?？墒亲约褐谱骱暌彩峭β闊┑摹Ｈ绻苷业揭粋€現(xiàn)成的宏來處理圖片就能省事了

2、。在IPP公司的網(wǎng)站上就有大量這樣的通用的宏程序，macro。MediaCybnetics公司的軟件工程師注意到了很多人都在使用IPP測量免疫組化圖片的光密度，也注意到了論壇上大家討論的分析免疫組化圖片的方法，于是他們給大家編制了一個macro，專門用來方便地進(jìn)行免疫組化圖片的分析，這可是專業(yè)水平的macro，真管用呀。我近水樓臺得到了一個試用版本，使用這個macro分析上百張免疫組化圖片，不到一個小時就能全部搞定。好東西要大家分享，再寫一篇“手把手教你使用IPP"。先把這個試用版本傳給大家，正式版本則需到MediaCy

3、bnetics網(wǎng)站上下載。>(待續(xù))Pathology.scr(27.26k)當(dāng)然，如果你對IPP一點(diǎn)也不了解，是使用不了這個macro的。希望你看過了以前的手把手教你使用IPP的系列帖子。>特別是看過了第十一個關(guān)于免疫組化圖片光密度測量的帖子（包括后面的跟帖）http://www.....cn/bbs/post/view?bid=10&id=5923479&sty=1。這個macro基本上就是根據(jù)這個分析方法來分析測量免疫組化圖片的。下載了這個macro后，首先用記事本打開這個文件，在第三十幾行上找到這句話：Shell

4、("c:programfilesmicrosoftofficeoffice10excel.exe")然后到你自己的電腦上按照這個路徑看看。如果你安裝的是officeXP,則能找到這個excel.exe文件。不同版本的office，其excel.exe文件的位置是不一樣的。你需要在自己的電腦上找到excel.exe文件所在的路徑，然后在記事本里修改這句命令，使它能正確地指到excel.exe文件。一般office2000的系統(tǒng)要把這句話改為Shell("c:programfilesmicrosoftoffice

5、officeexcel.exe")office2003的系統(tǒng)要把這句話改為Shell("c:programfilesmicrosoftofficeoffice11excel.exe")改完后直接在記事本里點(diǎn)保存。把保存好的文件另存到C盤IPP文件夾下面的scripts目錄里。啟動IPP程序，點(diǎn)macro菜單下的macro命令。在macro窗口里點(diǎn)chang按紐。在彈出的打開文件窗口中選擇pathology。再點(diǎn)OK關(guān)閉所有窗口。這個macro就安裝好了。screen.width-333)this.width=

6、screen.width-333"width=640height=369title="Clicktoviewfull未命名1.JPG(867X501)"border=0align=absmiddle>再次點(diǎn)macro菜單，就可以看到在菜單的最底下增加了兩行命令：pathology和filloutside。點(diǎn)擊pathology來運(yùn)行這個宏。測量免疫組化圖片光密度，實(shí)際上測量的就是一個平均光密度meandensity。這就需要先測量一下有效測量區(qū)域的面積，再測量這個面積范圍內(nèi)目標(biāo)染色區(qū)域的累積光密度值IOD。兩者相除得到m

7、eandensity。作為一個特例，如果測量區(qū)域就是整張圖片，可以直接測量IOD值。不必考慮面積區(qū)域。以下圖為例。圖片中黃色染色區(qū)域主要集中于藍(lán)色框住的區(qū)域內(nèi)。測量平均光密度就要根據(jù)圖片情況有三種選擇：1.測量整張圖片黃色的IOD，除以整張圖片面積。2.測量整張圖片黃色的IOD，除以紅線框住區(qū)域的面積。（這是扣除空白區(qū)域）3.測量藍(lán)線所框區(qū)域的黃色I(xiàn)OD，除以藍(lán)線框住區(qū)域的面積。（這是計(jì)算特定組織區(qū)域的染色平均光密度）在許多情況下，都需要選擇測量區(qū)域，作為特例，在測量區(qū)域充滿整個畫面時不需要考慮測量區(qū)域。需要指出的是，使

8、用IPP的count/size測量IOD及area時，測量出的面積area是選定的黃色染色區(qū)域的面積。用IOD除以這個面積一般來說是不準(zhǔn)確的。它的意思是“黃色染色區(qū)域的平均光密度”。所以使用這個宏進(jìn)行測量時就有兩件事要干：1.畫出測量區(qū)域2.選擇特定染色物的顏色。（縮略圖，點(diǎn)擊圖片鏈接看原圖）從手把手教你使用IPP第