基于機(jī)器學(xué)習(xí)的mirna靶標(biāo)預(yù)測方法

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1、<>全部作者：劉輝張林徐釗第1作者單位：中國礦業(yè)大學(xué)信息與電氣工程學(xué)院論文摘要：microRNA（miRNA）是1類長約20個(gè)核苷酸（nt）的非編碼的調(diào)控小分子RNA，能夠切割靶mRNA或抑制蛋白質(zhì)的合成，因而對后轉(zhuǎn)錄調(diào)控有非常重大的作用。正確地預(yù)測miRNA的靶基因已經(jīng)是業(yè)界研究的熱點(diǎn)之1。本文提出1種新的基于統(tǒng)計(jì)理念的學(xué)習(xí)方法進(jìn)行miRNA靶標(biāo)判別特征的提取，再使用SVM分類器進(jìn)行miRNA靶標(biāo)的預(yù)測。經(jīng)仿真結(jié)果表明，該方法能夠比目前已有的基于機(jī)器學(xué)習(xí)的miTarget算法獲得更佳的性能。關(guān)鍵詞：microRNA，靶標(biāo)預(yù)測，生物信息學(xué)，SVM，分類器

2、(瀏覽全文)發(fā)表日期：2008年03月21日同行評議：（暫時(shí)沒有）綜合評價(jià)：（暫時(shí)沒有）修改稿：<>1.緒論1.1研究背景網(wǎng)絡(luò)被認(rèn)為是互聯(lián)網(wǎng)發(fā)展的第三階段。網(wǎng)絡(luò)的設(shè)計(jì)和實(shí)施能夠帶來切身實(shí)際的利益，城域網(wǎng)、企業(yè)網(wǎng)、局域網(wǎng)、家庭網(wǎng)和個(gè)人網(wǎng)絡(luò)都是網(wǎng)絡(luò)發(fā)展的體現(xiàn)。網(wǎng)絡(luò)發(fā)明的初衷并不僅僅是表現(xiàn)在它的規(guī)模上，而是互聯(lián)互通，資源共享，消除資源訪問的壁壘，讓生活更加方便、快捷、高效。隨著網(wǎng)絡(luò)技術(shù)的發(fā)展，網(wǎng)絡(luò)在應(yīng)用方面也體現(xiàn)出了很大的潛力，能夠共享和調(diào)度成千上萬的計(jì)算設(shè)備協(xié)同并發(fā)工作，能匯聚數(shù)百萬計(jì)的信息資源加以歸類、分析和發(fā)布，還可以讓世界每一個(gè)角落的人們實(shí)時(shí)溝通交流。

3、在現(xiàn)代高速發(fā)展的社會(huì)里，企業(yè)與企業(yè)之間的聯(lián)系日益密切，大量的、復(fù)雜的信息交流顯得由為重要。隨著電子科技的高速發(fā)展，那些如何復(fù)雜大量的信息，通過網(wǎng)絡(luò)技術(shù)幫助下，就可以輕而易舉的從某一地方傳送到另一地方，而且簡單、快速、準(zhǔn)確，給人們帶來了很大的方便。而在現(xiàn)代企業(yè)中，網(wǎng)絡(luò)技術(shù)在管理中的應(yīng)用，已顯得舉足輕重。隨著企業(yè)信息化進(jìn)程的進(jìn)一步深入和發(fā)展，計(jì)算機(jī)在企業(yè)中的應(yīng)用越來越廣泛，而企業(yè)對計(jì)算機(jī)的依賴越來越強(qiáng)。隨著網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用的日益豐富以及人們在日常生活中對網(wǎng)絡(luò)依賴的日漸緊密，那么對于網(wǎng)絡(luò)吞吐量，網(wǎng)絡(luò)延時(shí)，網(wǎng)絡(luò)鏈路的穩(wěn)定性以及網(wǎng)絡(luò)服務(wù)的多樣性就會(huì)產(chǎn)生新的要求，同時(shí)也希望

4、網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用的花銷能更加低廉，這樣針對電信網(wǎng)絡(luò)運(yùn)營商所提供的服務(wù)將會(huì)產(chǎn)生巨大的挑戰(zhàn)，本實(shí)時(shí)通信系統(tǒng)的成功應(yīng)用將會(huì)給運(yùn)營商們提供更加方便，快捷，穩(wěn)定，并且低廉的網(wǎng)絡(luò)運(yùn)營成本，本實(shí)時(shí)通信系統(tǒng)幫助企業(yè)實(shí)現(xiàn)巨大的商業(yè)價(jià)值的同時(shí)也為用戶帶來的更加高效，快速，穩(wěn)定并且廉價(jià)的網(wǎng)絡(luò)服務(wù)資源。1.2選題理論更多文章http://www.mxdsf.net/mxdwk<>1.緒論1.1研究背景網(wǎng)絡(luò)被認(rèn)為是互聯(lián)網(wǎng)發(fā)展的第三階段。網(wǎng)絡(luò)的設(shè)計(jì)和實(shí)施能夠帶來切身實(shí)際的利益，城域網(wǎng)、企業(yè)網(wǎng)、局域網(wǎng)、家庭網(wǎng)和個(gè)人網(wǎng)絡(luò)都是網(wǎng)絡(luò)發(fā)展的體現(xiàn)。網(wǎng)絡(luò)發(fā)明的初衷并不僅僅是表現(xiàn)在它的規(guī)模上，而是互聯(lián)互通

5、，資源共享，消除資源訪問的壁壘，讓生活更加方便、快捷、高效。隨著網(wǎng)絡(luò)技術(shù)的發(fā)展，網(wǎng)絡(luò)在應(yīng)用方面也體現(xiàn)出了很大的潛力，能夠共享和調(diào)度成千上萬的計(jì)算設(shè)備協(xié)同并發(fā)工作，能匯聚數(shù)百萬計(jì)的信息資源加以歸類、分析和發(fā)布，還可以讓世界每一個(gè)角落的人們實(shí)時(shí)溝通交流。在現(xiàn)代高速發(fā)展的社會(huì)里，企業(yè)與企業(yè)之間的聯(lián)系日益密切，大量的、復(fù)雜的信息交流顯得由為重要。隨著電子科技的高速發(fā)展，那些如何復(fù)雜大量的信息，通過網(wǎng)絡(luò)技術(shù)幫助下，就可以輕而易舉的從某一地方傳送到另一地方，而且簡單、快速、準(zhǔn)確，給人們帶來了很大的方便。而在現(xiàn)代企業(yè)中，網(wǎng)絡(luò)技術(shù)在管理中的應(yīng)用，已顯得舉足輕重。隨著企業(yè)

6、信息化進(jìn)程的進(jìn)一步深入和發(fā)展，計(jì)算機(jī)在企業(yè)中的應(yīng)用越來越廣泛，而企業(yè)對計(jì)算機(jī)的依賴越來越強(qiáng)。隨著網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用的日益豐富以及人們在日常生活中對網(wǎng)絡(luò)依賴的日漸緊密，那么對于網(wǎng)絡(luò)吞吐量，網(wǎng)絡(luò)延時(shí)，網(wǎng)絡(luò)鏈路的穩(wěn)定性以及網(wǎng)絡(luò)服務(wù)的多樣性就會(huì)產(chǎn)生新的要求，同時(shí)也希望網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用的花銷能更加低廉，這樣針對電信網(wǎng)絡(luò)運(yùn)營商所提供的服務(wù)將會(huì)產(chǎn)生巨大的挑戰(zhàn)，本實(shí)時(shí)通信系統(tǒng)的成功應(yīng)用將會(huì)給運(yùn)營商們提供更加方便，快捷，穩(wěn)定，并且低廉的網(wǎng)絡(luò)運(yùn)營成本，本實(shí)時(shí)通信系統(tǒng)幫助企業(yè)實(shí)現(xiàn)巨大的商業(yè)價(jià)值的同時(shí)也為用戶帶來的更加高效，快速，穩(wěn)定并且廉價(jià)的網(wǎng)絡(luò)服務(wù)資源。1.2選題理論1.2.1需求分析方法在

7、軟件的設(shè)計(jì)和開發(fā)過程中，需求分析是一個(gè)重要的階段，是項(xiàng)目開發(fā)的基本要素，是項(xiàng)目實(shí)現(xiàn)和實(shí)行的關(guān)鍵。軟件工程的需求分析指的是了解用戶需求，在軟件的功能上和客戶溝通并且達(dá)成一致，評估軟件的風(fēng)險(xiǎn)系數(shù)和項(xiàng)目需要付出的代價(jià)，最終形成一個(gè)完善設(shè)計(jì)實(shí)現(xiàn)的復(fù)雜過程。目前比較流行的軟件需求分析方法有：結(jié)構(gòu)化分析方法和面向?qū)ο蟮姆治龇椒ā?.結(jié)構(gòu)化分析結(jié)構(gòu)化分析方法給出一組幫助系統(tǒng)分析人員產(chǎn)生功能規(guī)約的原理與技術(shù)。它一般利用圖形表達(dá)用戶需求，使用的手段主要有數(shù)據(jù)流圖、數(shù)據(jù)字典、結(jié)構(gòu)化語言、判定表以及判定樹等。結(jié)構(gòu)化分析的步驟如下：①分析當(dāng)前的情況，做出反映當(dāng)前物理模型的DFD

8、;②推導(dǎo)出等價(jià)的邏輯模型的DFD;③設(shè)計(jì)新的邏輯系統(tǒng)，生成數(shù)據(jù)字典和基元描述;④