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《部分紅麻myb轉(zhuǎn)錄因子基因序列的生物信息學(xué)分析》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在教育資源-天天文庫。
1、福建農(nóng)林大學(xué)本科畢業(yè)論文 論文題目：部分紅麻MYB轉(zhuǎn)錄因子基因序列的生物信息學(xué)分析學(xué)院：生命科學(xué)學(xué)院專業(yè)年級：生物技術(shù)2011級學(xué)號：3115405030姓 名：陳志超指導(dǎo)教師、職稱：徐建堂副研究員2015年5月5日福建農(nóng)林大學(xué)本科畢業(yè)論文福建農(nóng)林大學(xué)本科畢業(yè)論文BioinformaticsanalysisonpartofMYBtranscriptionfactorinKenaf（HibiscuscannabinusL.）SubmittedinpartialfulfillmentoftherequirementsforthedegreeofBachelorinSchoolofLi
2、feSciences,FAFUCollege:SchoolofLifeSciencesSpeciality:BiotechnologyEntranceyear:2011I.D.No.:3115405030Candidate:ChenZhichaoSupervisor:AssociateProf.XUJiantangSubmitted:InMay,2015福建農(nóng)林大學(xué)本科畢業(yè)論文目錄摘要1英文摘要11引言11.1研究意義11.2前人研究進(jìn)展21.3本研究切入點31.4擬解決關(guān)鍵性問題32材料與方法32.1試驗材料32.2總DNA提取42.3目的基因的克隆與生物信息學(xué)分析42.4PCR擴
3、增43結(jié)果與分析53.1紅麻DNA提取結(jié)果53.2紅麻MYB的PCR結(jié)果63.3PCR產(chǎn)物測序結(jié)果（鉑尚測序公司）73.4DNAMAN比對結(jié)果73.5進(jìn)化樹123.6ORF分析134討論154.1DNA提取與目的片段擴增154.2關(guān)于目的片段引物設(shè)計154.3轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果驗證165結(jié)論16參考文獻(xiàn)16致謝18福建農(nóng)林大學(xué)本科畢業(yè)論文部分紅麻MYB轉(zhuǎn)錄因子基因序列的生物信息學(xué)分析陳志超福建農(nóng)林大學(xué)，生命科學(xué)學(xué)院，生物技術(shù)2011級摘要：通過對紅麻MYB相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)行序列驗證分析，為下一步開展MYB基因全長克隆奠定基礎(chǔ)。對紅麻MYB轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析，從中篩選出92條與MYB相關(guān)序列，進(jìn)
4、行進(jìn)化樹分析。從紅麻轉(zhuǎn)錄組中隨機挑選8條MYB基因，利用Oligo7軟件設(shè)計特異引物，以紅麻品種福紅7號基因組總DNA為模板進(jìn)行中間片段擴增與擴增產(chǎn)物測序，利用DNAMAN8軟件及NCBIBlast進(jìn)行序列比對分析。其中7條MYB相關(guān)因子的基因序列相似度達(dá)99%以上，經(jīng)分析后均能獲得轉(zhuǎn)錄組序列的開放閱讀框。獲得基于轉(zhuǎn)錄測序的7條MYB轉(zhuǎn)錄因子相關(guān)序列中間片段，為下一步開展MYB基因全長克隆及功能驗證奠定良好基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞：紅麻，MYB轉(zhuǎn)錄因子，轉(zhuǎn)錄組，基因克隆，比對分析BioinformaticsanalysisonpartofMYBtranscriptionfactorinKenaf
5、（HibiscuscannabinusL.）Chenzhichao,FujianAgricultureandForestryUniversity,collegeoflifescience,DepartmentofBiotechnology,MajorofBiotechnology,Grade2011,No.3115405030Abstract:BasedonkenafMYBrelatedtranscriptionfactorsequenceanalysis,toprovideabasisforkenafMYBgenecloning.ThroughtheanalysisofKenaft
6、ranscriptomedata,atotalof92MYBtranscriptionfactorrelatedsequencewereselectedfromthedata,andthenanalysisitsphylogenetictree.EightkenafMYBgenesequenceswererandomlyselectedfromthedata,usingsoftwareoligo7todesignspecificprimers,withtotalgenomicDNAofVarietiesFuhongNo.7asthetemplateforthemiddlefragme
7、nt,sequencealignmentanalysisusingDNAMAN8softwareandNCBIBlast.Almondthemthereweresevensequences’similaritywereupto99%,andbothofthemexistthetranscriptomesequenceoftheopenreadingframe.ObtainedbasedonthetranscriptionofsequencingsevenM
