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《關(guān)于上報(bào)高通量基因測(cè)序技術(shù)臨床應(yīng)用試點(diǎn)單位的相關(guān)工作》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在工程資料-天天文庫(kù)。
1、關(guān)于上報(bào)高通量基因測(cè)序技術(shù)臨床應(yīng)用試點(diǎn)單位的相關(guān)工作2、實(shí)驗(yàn)室基本情況,包括技術(shù)力量、設(shè)備實(shí)施條件、開(kāi)展相關(guān)業(yè)務(wù)規(guī)模等。(請(qǐng)艾迪康協(xié)助完善)2.1儀器設(shè)備實(shí)施條件目前我實(shí)驗(yàn)室具有高通量測(cè)序相關(guān)的所有設(shè)備儀器:高通量測(cè)序儀IonProton?、IonOneTouch2、IonOneTouchES、ABI實(shí)時(shí)定量PCR儀、梯度PCR儀、可控溫高速離心機(jī)、超微量核酸檢測(cè)儀、全自動(dòng)核酸提取儀、超純水系統(tǒng)、多模塊可觸屏金屬浴等。IonProton?平臺(tái)是一種利用半導(dǎo)體微芯片技術(shù)的臺(tái)式高通量測(cè)序儀,體積如辦公室打印機(jī)般大小。IonProton?有兩種通量的測(cè)序芯片靈活可選
2、,分別是10G、100G,適合不同通量需求的應(yīng)用,該測(cè)序儀的半導(dǎo)體芯片上布滿(mǎn)了高密度的小孔,每一個(gè)小孔就是一個(gè)測(cè)序反應(yīng)池,孔底部帶有一種探針-離子選擇性場(chǎng)效應(yīng)晶體管(ISFET),用來(lái)探測(cè)PH值的變化。進(jìn)而把化學(xué)信號(hào)直接轉(zhuǎn)化為數(shù)字信號(hào),最終讀出DNA序列。與其它新一代測(cè)序儀相比,IonProton?平臺(tái)不需要激發(fā)光、CCD成像儀及熒光標(biāo)記,可最大程度地簡(jiǎn)化處理高通量系統(tǒng)生成的數(shù)據(jù)所需的計(jì)算硬件,能直接并快速“讀”出DNA序列,具有簡(jiǎn)單、快速、準(zhǔn)確、靈活和低成本等顯著優(yōu)勢(shì),是中等規(guī)模測(cè)序項(xiàng)目的最佳選擇。IonProton?使用半導(dǎo)體測(cè)序芯片,反應(yīng)微孔數(shù)不小于16
3、億,研發(fā)中的IonProtonTMⅡ的反應(yīng)微孔數(shù)則不小于66億。此外,IonProtonTM芯片上獨(dú)特的流體體系、微體系機(jī)械設(shè)計(jì)和半導(dǎo)體的技術(shù)組合,可以快速直接的將遺傳信息翻譯成數(shù)碼的DNAHightideagainstCCPbloodyanTomb,CommunistPartymembersandpartoftheexposedTombareavacatedbyprogressiveyouth.IvisitedinBeijingin1985whenitwasoldundergroundcomrade,sisterofYaoZhiyingYaoMuzheng(
4、thenDeputyDirectoroftheexternaltrademagazineforthepromotionofinternationaltrade,deshengmenWai,theReed測(cè)序結(jié)果,進(jìn)一步得到高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù),它可以在一天之內(nèi)測(cè)定一個(gè)人的全基因組。2.2專(zhuān)業(yè)技術(shù)2.2.1測(cè)序樣品前處理技術(shù)——自主研發(fā)的專(zhuān)利技術(shù)樣品處理需要排除外來(lái)基因的干擾,有效的提取出極微量的DNA片段,經(jīng)我公司自主研發(fā)出的血液游離痕量DNA提取系統(tǒng)純化系統(tǒng)與檢測(cè)系統(tǒng),該系統(tǒng)檢測(cè)所需樣品量少,最低可提取出0.2ml濃度為血液樣品的DNA,提取純化用時(shí)短,且純度高
5、,重復(fù)性好,提取儀器設(shè)備和耗材所占體積小,所需空間小,除可應(yīng)用于固定實(shí)驗(yàn)室外,也可配備在移動(dòng)檢測(cè)車(chē)上作為快檢使用。該血液游離痕量DNA提取系統(tǒng)采用超吸附性納米顆粒,利用納米該技術(shù)對(duì)其表面進(jìn)行改良和表面修飾后,制備成超吸附性氧化硅納米晶珠,將分離的核酸吸附收集到晶珠上。DNA富集的方法主要有磁珠法和離心柱法。磁珠法的核心是將細(xì)胞中游離出來(lái)的核酸分子吸附到磁性顆粒表面,蛋白質(zhì)等雜質(zhì)不被吸附而留在溶液中。在磁場(chǎng)作用下,使磁性顆粒與液體分開(kāi),回收顆粒,再用洗脫液洗脫即可得到純凈的DNA。離心柱法是將樹(shù)脂或硅膠膜固定在離心管中,在高鹽低pH值條件下,DNA選擇性吸附于離
6、心柱內(nèi)的樹(shù)脂或膜上,通過(guò)漂洗、離心等步驟,去除蛋白和多糖雜質(zhì),最后用低鹽高pH值的洗脫緩沖液將DNA從樹(shù)脂或硅膠模上洗脫。本研發(fā)采用特有的納米晶珠方法,不需要經(jīng)過(guò)磁場(chǎng)處理,也不用特別制作的離心柱,操作簡(jiǎn)便省時(shí)。該項(xiàng)技術(shù)是采用的國(guó)際先進(jìn)的技術(shù)理念,并且由我公司研發(fā)團(tuán)隊(duì)在國(guó)際先進(jìn)技術(shù)基礎(chǔ)上自主設(shè)計(jì)配制的,是國(guó)際國(guó)內(nèi)未有的創(chuàng)新的技術(shù),經(jīng)該技術(shù)改良的晶珠的表面結(jié)構(gòu)也是國(guó)內(nèi)外未有的設(shè)計(jì)方案。HightideagainstCCPbloodyanTomb,CommunistPartymembersandpartoftheexposedTombareavacatedbypro
7、gressiveyouth.IvisitedinBeijingin1985whenitwasoldundergroundcomrade,sisterofYaoZhiyingYaoMuzheng(thenDeputyDirectoroftheexternaltrademagazineforthepromotionofinternationaltrade,deshengmenWai,theReed該檢測(cè)系統(tǒng)的的先進(jìn)技術(shù)使得其特異性好、靈敏度高等一系列優(yōu)點(diǎn),打破了從前的瓶頸問(wèn)題,此外,其操作簡(jiǎn)便易行,無(wú)需特殊昂貴的儀器設(shè)備耗材等,也使其成本大大降低,所以本技術(shù)所產(chǎn)生
8、的商業(yè)化產(chǎn)品更容易被市場(chǎng)接受。2.2.